Protein–RNA interactions for Protein: P17564

Ppp1r15a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r15aP17564 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,04■■■■■ 5,76
Ppp1r15aP17564 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,13■■■■■ 5,14
Ppp1r15aP17564 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,47■■■■■ 5,03
Ppp1r15aP17564 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,72■■■■■ 4,75
Ppp1r15aP17564 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,42■■■■■ 4,7
Ppp1r15aP17564 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,21■■■■■ 4,67
Ppp1r15aP17564 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Ppp1r15aP17564 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Ppp1r15aP17564 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Ppp1r15aP17564 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Ppp1r15aP17564 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Ppp1r15aP17564 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Ppp1r15aP17564 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,63■■■■■ 4,41
Ppp1r15aP17564 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Ppp1r15aP17564 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Ppp1r15aP17564 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Ppp1r15aP17564 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,66■■■■■ 4,26
Ppp1r15aP17564 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Ppp1r15aP17564 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Ppp1r15aP17564 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,28■■■■■ 4,2
Ppp1r15aP17564 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,11■■■■■ 4,17
Ppp1r15aP17564 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Ppp1r15aP17564 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Ppp1r15aP17564 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Ppp1r15aP17564 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,94■■■■■ 4,14
Ppp1r15aP17564 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Ppp1r15aP17564 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Ppp1r15aP17564 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,9■■■■■ 4,14
Ppp1r15aP17564 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Ppp1r15aP17564 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Ppp1r15aP17564 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Ppp1r15aP17564 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Ppp1r15aP17564 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ppp1r15aP17564 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Ppp1r15aP17564 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
Ppp1r15aP17564 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Ppp1r15aP17564 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,06■■■■■ 4
Ppp1r15aP17564 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Ppp1r15aP17564 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Ppp1r15aP17564 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Ppp1r15aP17564 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Ppp1r15aP17564 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ppp1r15aP17564 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Ppp1r15aP17564 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Ppp1r15aP17564 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Ppp1r15aP17564 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Ppp1r15aP17564 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Ppp1r15aP17564 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,25■■■■□ 3,87
Ppp1r15aP17564 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Ppp1r15aP17564 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Ppp1r15aP17564 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Ppp1r15aP17564 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3,83
Ppp1r15aP17564 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Ppp1r15aP17564 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Ppp1r15aP17564 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Ppp1r15aP17564 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,74■■■■□ 3,79
Ppp1r15aP17564 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Ppp1r15aP17564 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Ppp1r15aP17564 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Ppp1r15aP17564 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Ppp1r15aP17564 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,51■■■■□ 3,76
Ppp1r15aP17564 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38,44■■■■□ 3,74
Ppp1r15aP17564 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,43■■■■□ 3,74
Ppp1r15aP17564 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Ppp1r15aP17564 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Ppp1r15aP17564 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Ppp1r15aP17564 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Ppp1r15aP17564 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Ppp1r15aP17564 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,28■■■■□ 3,72
Ppp1r15aP17564 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,28■■■■□ 3,72
Ppp1r15aP17564 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,25■■■■□ 3,71
Ppp1r15aP17564 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Ppp1r15aP17564 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Ppp1r15aP17564 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Ppp1r15aP17564 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Ppp1r15aP17564 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Ppp1r15aP17564 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Ppp1r15aP17564 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Ppp1r15aP17564 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Ppp1r15aP17564 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Ppp1r15aP17564 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Ppp1r15aP17564 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Ppp1r15aP17564 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,85■■■■□ 3,65
Ppp1r15aP17564 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Ppp1r15aP17564 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Ppp1r15aP17564 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Ppp1r15aP17564 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Ppp1r15aP17564 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Ppp1r15aP17564 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Ppp1r15aP17564 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Ppp1r15aP17564 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppp1r15aP17564 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppp1r15aP17564 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Ppp1r15aP17564 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Ppp1r15aP17564 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Ppp1r15aP17564 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Ppp1r15aP17564 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Ppp1r15aP17564 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Ppp1r15aP17564 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Ppp1r15aP17564 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms