Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,75■■■■■ 5,87
Hoxb7P09024 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,79■■■■■ 5,24
Hoxb7P09024 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,16■■■■■ 5,14
Hoxb7P09024 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,3■■■■■ 4,84
Hoxb7P09024 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,86■■■■■ 4,77
Hoxb7P09024 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,44■■■■■ 4,7
Hoxb7P09024 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,35■■■■■ 4,69
Hoxb7P09024 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
Hoxb7P09024 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Hoxb7P09024 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Hoxb7P09024 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Hoxb7P09024 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,24■■■■■ 4,51
Hoxb7P09024 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,09■■■■■ 4,49
Hoxb7P09024 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Hoxb7P09024 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Hoxb7P09024 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Hoxb7P09024 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,92■■■■■ 4,3
Hoxb7P09024 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Hoxb7P09024 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Hoxb7P09024 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,69■■■■■ 4,26
Hoxb7P09024 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Hoxb7P09024 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Hoxb7P09024 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Hoxb7P09024 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
Hoxb7P09024 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Hoxb7P09024 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Hoxb7P09024 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Hoxb7P09024 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
Hoxb7P09024 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Hoxb7P09024 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Hoxb7P09024 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Hoxb7P09024 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Hoxb7P09024 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,89■■■■■ 4,14
Hoxb7P09024 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Hoxb7P09024 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Hoxb7P09024 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Hoxb7P09024 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Hoxb7P09024 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Hoxb7P09024 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Hoxb7P09024 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Hoxb7P09024 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Hoxb7P09024 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,9■■■■□ 3,98
Hoxb7P09024 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Hoxb7P09024 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
Hoxb7P09024 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Hoxb7P09024 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Hoxb7P09024 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Hoxb7P09024 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Hoxb7P09024 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Hoxb7P09024 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Hoxb7P09024 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Hoxb7P09024 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Hoxb7P09024 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Hoxb7P09024 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,22■■■■□ 3,87
Hoxb7P09024 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Hoxb7P09024 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Hoxb7P09024 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Hoxb7P09024 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,06■■■■□ 3,84
Hoxb7P09024 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,98■■■■□ 3,83
Hoxb7P09024 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Hoxb7P09024 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Hoxb7P09024 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Hoxb7P09024 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Hoxb7P09024 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,83■■■■□ 3,81
Hoxb7P09024 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Hoxb7P09024 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Hoxb7P09024 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Hoxb7P09024 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Hoxb7P09024 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Hoxb7P09024 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Hoxb7P09024 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Hoxb7P09024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,55■■■■□ 3,76
Hoxb7P09024 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Hoxb7P09024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,53■■■■□ 3,76
Hoxb7P09024 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Hoxb7P09024 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,43■■■■□ 3,74
Hoxb7P09024 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,42■■■■□ 3,74
Hoxb7P09024 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Hoxb7P09024 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Hoxb7P09024 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Hoxb7P09024 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,33■■■■□ 3,73
Hoxb7P09024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Hoxb7P09024 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Hoxb7P09024 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Hoxb7P09024 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Hoxb7P09024 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Hoxb7P09024 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Hoxb7P09024 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,05■■■■□ 3,68
Hoxb7P09024 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,03■■■■□ 3,68
Hoxb7P09024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,67
Hoxb7P09024 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Hoxb7P09024 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Hoxb7P09024 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Hoxb7P09024 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Hoxb7P09024 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Hoxb7P09024 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Hoxb7P09024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Hoxb7P09024 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Hoxb7P09024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Hoxb7P09024 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,9 ms