Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.75■■■■■ 5.87
Hoxb7P09024 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Hoxb7P09024 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Hoxb7P09024 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
Hoxb7P09024 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
Hoxb7P09024 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Hoxb7P09024 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Hoxb7P09024 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Hoxb7P09024 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Hoxb7P09024 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Hoxb7P09024 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Hoxb7P09024 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Hoxb7P09024 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Hoxb7P09024 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Hoxb7P09024 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Hoxb7P09024 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Hoxb7P09024 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Hoxb7P09024 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Hoxb7P09024 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Hoxb7P09024 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Hoxb7P09024 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Hoxb7P09024 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Hoxb7P09024 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Hoxb7P09024 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Hoxb7P09024 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Hoxb7P09024 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Hoxb7P09024 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Hoxb7P09024 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Hoxb7P09024 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Hoxb7P09024 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Hoxb7P09024 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Hoxb7P09024 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Hoxb7P09024 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Hoxb7P09024 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Hoxb7P09024 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Hoxb7P09024 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Hoxb7P09024 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Hoxb7P09024 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Hoxb7P09024 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Hoxb7P09024 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Hoxb7P09024 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Hoxb7P09024 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Hoxb7P09024 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Hoxb7P09024 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Hoxb7P09024 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Hoxb7P09024 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Hoxb7P09024 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Hoxb7P09024 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Hoxb7P09024 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Hoxb7P09024 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Hoxb7P09024 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Hoxb7P09024 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Hoxb7P09024 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Hoxb7P09024 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Hoxb7P09024 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Hoxb7P09024 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Hoxb7P09024 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Hoxb7P09024 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Hoxb7P09024 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Hoxb7P09024 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Hoxb7P09024 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Hoxb7P09024 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Hoxb7P09024 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Hoxb7P09024 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Hoxb7P09024 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Hoxb7P09024 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Hoxb7P09024 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Hoxb7P09024 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Hoxb7P09024 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Hoxb7P09024 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Hoxb7P09024 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Hoxb7P09024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Hoxb7P09024 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Hoxb7P09024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Hoxb7P09024 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Hoxb7P09024 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Hoxb7P09024 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Hoxb7P09024 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Hoxb7P09024 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Hoxb7P09024 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Hoxb7P09024 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Hoxb7P09024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Hoxb7P09024 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Hoxb7P09024 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Hoxb7P09024 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Hoxb7P09024 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Hoxb7P09024 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Hoxb7P09024 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Hoxb7P09024 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Hoxb7P09024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Hoxb7P09024 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Hoxb7P09024 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Hoxb7P09024 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Hoxb7P09024 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Hoxb7P09024 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Hoxb7P09024 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Hoxb7P09024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Hoxb7P09024 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Hoxb7P09024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Hoxb7P09024 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms