RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	ATG32	P40458	529 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	EMP47	P43555	445 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	YNL108C	P53929	270 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	YJR115W	P47152	169 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	RIM21	P48565	533 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	APP1	P53933	587 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	RGA1	P39083	1007 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	ATG3	P40344	310 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	SPE2	P21182	396 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	FBP26	P32604	452 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	MKS1	P34072	584 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	TY4B-J	P47024	1803 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	STE6	P12866	1290 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	RCM1	P53972	490 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	MRX10	Q05648	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	ATG20	Q07528	640 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	PPH3	P32345	308 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	ISF1	P32488	338 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PPQ1	YPL179W	NUP85	P46673	744 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	ISU1	Q03020	165 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	ARG82	P07250	355 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	ENV9	Q08651	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YML133C	Q03099	1374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YLL067C	Q07888	1374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YLL066C	Q99208	1374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	AAD14	P42884	376 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	DFG5	Q05031	458 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	CPS1	P27614	576 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	MET22	P32179	357 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	BDS1	Q08347	646 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	SRF1	Q12516	437 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	PSK1	P31374	1356 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YIL177C	P40434	1758 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YJL225C	P40889	1758 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	PEP12	P32854	288 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	SIS2	P36024	562 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	MHP1	P43638	1398 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	SOH1	P38633	127 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YDR444W	Q04093	687 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PPQ1	YPL179W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	LSC2	P53312	427 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	YJR098C	P47139	656 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	UTR2	P32623	467 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	OPT2	Q06593	877 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	WTM2	Q12206	467 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	YRF1-2	P40105	1681 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	VTC4	P47075	721 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	PDS5	Q04264	1277 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	HDA3	Q06623	655 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	MIP1	P15801	1254 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	TTI1	P36097	1038 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	TBS1	P38114	1094 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	SLX8	P40072	274 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	UBP2	Q01476	1272 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	RLF2	Q12495	606 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
PPQ1	YPL179W	SPT7	P35177	1332 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	DLD1	P32891	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	ACO2	P39533	789 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	AUS1	Q08409	1394 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PPQ1	YPL179W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	DAL1	P32375	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	MSN5	P52918	1224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	SCW11	P53189	542 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	TSC13	Q99190	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	FKS3	Q04952	1785 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PPQ1	YPL179W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6

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