Protein–RNA interactions for Protein: Q05022

RRP5, rRNA biogenesis protein RRP5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP5Q05022 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.68■■■□□ 2.02
RRP5Q05022 NOP1YDL014W 984 nt26.64■■□□□ 1.85
RRP5Q05022 NSR1YGR159C 1245 nt26.4■■□□□ 1.82
RRP5Q05022 YKL036CYKL036C 393 nt25.57■■□□□ 1.68
RRP5Q05022 YJL027CYJL027C 417 nt23.94■■□□□ 1.42
RRP5Q05022 SCS3YGL126W 1143 nt23.81■■□□□ 1.4
RRP5Q05022 Q0297Q0297 156 nt23.78■■□□□ 1.4
RRP5Q05022 SRX1YKL086W 384 nt23.67■■□□□ 1.38
RRP5Q05022 MDJ1YFL016C 1536 nt23.26■■□□□ 1.31
RRP5Q05022 YCR051WYCR051W 669 nt22.5■■□□□ 1.19
RRP5Q05022 YOL085CYOL085C 342 nt21.96■■□□□ 1.11
RRP5Q05022 PKP1YIL042C 1185 nt21.85■■□□□ 1.09
RRP5Q05022 SCJ1YMR214W 1134 nt21.63■■□□□ 1.05
RRP5Q05022 RPP1BYDL130W 321 nt21.29■■□□□ 1
RRP5Q05022 ATS1YAL020C 1002 nt21.22■□□□□ 0.99
RRP5Q05022 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.05■□□□□ 0.96
RRP5Q05022 DBP2YNL112W 1641 nt20.77■□□□□ 0.92
RRP5Q05022 CCC1YLR220W 969 nt20.72■□□□□ 0.91
RRP5Q05022 PET122YER153C 765 nt20.5■□□□□ 0.87
RRP5Q05022 SCR1SCR1 522 nt20.27■□□□□ 0.83
RRP5Q05022 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.02■□□□□ 0.8
RRP5Q05022 RTC3YHR087W 336 nt19.89■□□□□ 0.77
RRP5Q05022 RRN5YLR141W 1092 nt19.79■□□□□ 0.76
RRP5Q05022 RSB1YOR049C 1065 nt19.76■□□□□ 0.75
RRP5Q05022 PST2YDR032C 597 nt19.51■□□□□ 0.71
RRP5Q05022 RVS167YDR388W 1449 nt19.5■□□□□ 0.71
RRP5Q05022 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.42■□□□□ 0.7
RRP5Q05022 YBR190WYBR190W 312 nt19.31■□□□□ 0.68
RRP5Q05022 YKL097CYKL097C 411 nt19.28■□□□□ 0.68
RRP5Q05022 YDJ1YNL064C 1230 nt19.21■□□□□ 0.67
RRP5Q05022 SHR5YOL110W 714 nt19.06■□□□□ 0.64
RRP5Q05022 GAR1YHR089C 618 nt18.81■□□□□ 0.6
RRP5Q05022 SHU1YHL006C 453 nt18.77■□□□□ 0.59
RRP5Q05022 YOR139CYOR139C 393 nt18.5■□□□□ 0.55
RRP5Q05022 DEP1YAL013W 1218 nt18.49■□□□□ 0.55
RRP5Q05022 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.4■□□□□ 0.54
RRP5Q05022 URN1YPR152C 1398 nt18.22■□□□□ 0.51
RRP5Q05022 TIR1YER011W 765 nt18.12■□□□□ 0.49
RRP5Q05022 NPL3YDR432W 1245 nt18.07■□□□□ 0.48
RRP5Q05022 YNL208WYNL208W 600 nt17.95■□□□□ 0.46
RRP5Q05022 MNP1YGL068W 585 nt17.92■□□□□ 0.46
RRP5Q05022 SRB2YHR041C 633 nt17.9■□□□□ 0.46
RRP5Q05022 RPN10YHR200W 807 nt17.87■□□□□ 0.45
RRP5Q05022 SSA1YAL005C 1929 nt17.81■□□□□ 0.44
RRP5Q05022 YOL037CYOL037C 354 nt17.64■□□□□ 0.41
RRP5Q05022 OPI9YLR338W 858 nt17.64■□□□□ 0.41
RRP5Q05022 WWM1YFL010C 636 nt17.63■□□□□ 0.41
RRP5Q05022 HOM6YJR139C 1080 nt17.62■□□□□ 0.41
RRP5Q05022 SAH1YER043C 1350 nt17.57■□□□□ 0.4
RRP5Q05022 YGR021WYGR021W 873 nt17.54■□□□□ 0.4
RRP5Q05022 YJR120WYJR120W 351 nt17.48■□□□□ 0.39
RRP5Q05022 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.44■□□□□ 0.38
RRP5Q05022 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.44■□□□□ 0.38
RRP5Q05022 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.44■□□□□ 0.38
RRP5Q05022 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.44■□□□□ 0.38
RRP5Q05022 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.44■□□□□ 0.38
RRP5Q05022 PUT4YOR348C 1884 nt17.38■□□□□ 0.37
RRP5Q05022 ARE1YCR048W 1833 nt17.33■□□□□ 0.36
RRP5Q05022 YJR018WYJR018W 363 nt17.32■□□□□ 0.36
RRP5Q05022 RKM5YLR137W 1104 nt17.3■□□□□ 0.36
RRP5Q05022 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.26■□□□□ 0.35
RRP5Q05022 MOT3YMR070W 1473 nt17.23■□□□□ 0.35
RRP5Q05022 PUS2YGL063W 1113 nt17.19■□□□□ 0.34
RRP5Q05022 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.17■□□□□ 0.34
RRP5Q05022 SSA3YBL075C 1950 nt17.11■□□□□ 0.33
RRP5Q05022 PUN1YLR414C 792 nt17.09■□□□□ 0.33
RRP5Q05022 RPP2BYDR382W 333 nt17.05■□□□□ 0.32
RRP5Q05022 YLR281CYLR281C 468 nt17.05■□□□□ 0.32
RRP5Q05022 BSC6YOL137W 1494 nt17.04■□□□□ 0.32
RRP5Q05022 BDH2YAL061W 1254 nt16.96■□□□□ 0.31
RRP5Q05022 WHI5YOR083W 888 nt16.96■□□□□ 0.31
RRP5Q05022 POA1YBR022W 534 nt16.88■□□□□ 0.29
RRP5Q05022 FMP45YDL222C 930 nt16.87■□□□□ 0.29
RRP5Q05022 YLR236CYLR236C 324 nt16.87■□□□□ 0.29
RRP5Q05022 YPR011CYPR011C 981 nt16.78■□□□□ 0.28
RRP5Q05022 PTC2YER089C 1395 nt16.77■□□□□ 0.28
RRP5Q05022 BUD23YCR047C 828 nt16.74■□□□□ 0.27
RRP5Q05022 DSK2YMR276W 1122 nt16.7■□□□□ 0.26
RRP5Q05022 FIS1YIL065C 468 nt16.68■□□□□ 0.26
RRP5Q05022 YBL100CYBL100C 315 nt16.64■□□□□ 0.25
RRP5Q05022 MRPL8YJL063C 717 nt16.62■□□□□ 0.25
RRP5Q05022 LSM3YLR438C-A 270 nt16.58■□□□□ 0.24
RRP5Q05022 YCH1YGR203W 447 nt16.55■□□□□ 0.24
RRP5Q05022 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.53■□□□□ 0.24
RRP5Q05022 IMP2'YIL154C 1041 nt16.52■□□□□ 0.24
RRP5Q05022 LPX1YOR084W 1164 nt16.51■□□□□ 0.23
RRP5Q05022 NAB2YGL122C 1578 nt16.5■□□□□ 0.23
RRP5Q05022 UBX6YJL048C 1191 nt16.49■□□□□ 0.23
RRP5Q05022 RTG1YOL067C 534 nt16.48■□□□□ 0.23
RRP5Q05022 PHO4YFR034C 939 nt16.46■□□□□ 0.23
RRP5Q05022 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.41■□□□□ 0.22
RRP5Q05022 YEL076CYEL076C 651 nt16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms