RNA–Protein interactions for RNA: YOR160W

MTR10, Transcript of Nuclear import receptor, yeast

Gene MTR10, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR10	YOR160W	MAM1	P40065	302 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MTR10	YOR160W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MTR10	YOR160W	ADR1	P07248	1323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PDR1	P12383	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	RBA50	Q04418	439 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SLX8	P40072	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	KRE2	P27809	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	DPH6	Q12429	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	MAL31	P38156	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SET4	P42948	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PSF3	Q12146	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	FLO1	P32768	1537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	GAL2	P13181	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SPC42	P36094	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	FLO11	P08640	1367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	ICP55	P40051	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	YJL171C	P46992	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	EAR1	Q03212	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	STV1	P37296	890 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	CDC11	P32458	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	AFG2	P32794	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	VPS4	P52917	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MTR10	YOR160W	TRK1	P12685	1235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	DNM1	P54861	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	TAF13	P11747	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	HOS4	P40480	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	GAS5	Q08193	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	QCR6	P00127	147 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	DAL5	P15365	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SWI1	P09547	1314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MTR10	YOR160W	SEC20	P28791	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SPR3	P41901	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	CBP1	P07252	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	GAL11	P19659	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	CLA4	P48562	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	MTC3	P53077	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	MEH1	Q02205	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ARG82	P07250	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	RAD2	P07276	1031 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	OXP1	P28273	1286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	SPL2	P38839	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	CST6	P40535	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YNL011C	P53980	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	DOS2	P54858	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	NIT1	P40447	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	COQ4	O13525	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	DLD1	P32891	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ASH1	P34233	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PET111	P08468	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PNT1	P38969	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	NET1	P47035	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PRD1	P25375	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	GRX3	Q03835	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PPM2	Q08282	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	TFC8	Q12308	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YFL040W	P43562	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	FBP1	P09201	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	MGM1	P32266	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	YGR130C	P53278	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTR10	YOR160W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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