RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	YOL057W	Q08225	711 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	LYS14	P40971	790 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YOR131C	Q12486	218 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	DAL5	P15365	543 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	ICP55	P40051	511 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SPR3	P41901	512 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	LDH1	P38139	375 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	ITC1	P53125	1264 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	CST9	Q06032	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YRF1-2	P40105	1681 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	OCT1	P35999	772 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YIR042C	P40586	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	VPS53	P47061	822 aa		3.8	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	STV1	P37296	890 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YJR107W	P47145	328 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YFH7	P43591	353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	APL6	P46682	809 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YLR271W	Q06152	274 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RTT109	Q07794	436 aa		3.79	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YIL177C	P40434	1758 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YJL225C	P40889	1758 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SLA1	P32790	1244 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YPR204W	Q08995	1032 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	ADP1	P25371	1049 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	VPS8	P39702	1274 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YGR122W	P53272	402 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SRT1	Q03175	343 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	INM2	Q05533	292 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	DID4	P36108	232 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ACA1	P39970	489 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	IRC4	Q03036	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	LAP2	Q10740	671 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
STE6	YKL209C	ASH1	P34233	588 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	GAS5	Q08193	484 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	MET7	Q08645	548 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	DSF2	P38213	736 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	IXR1	P33417	597 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	FKS3	Q04952	1785 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	PIF1	P07271	859 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ARG8	P18544	423 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	YKR018C	P36114	725 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	SPO1	P53541	631 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	THI22	Q06490	572 aa		3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	VPS62	P53285	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	UBP16	Q02863	499 aa		3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ARG82	P07250	355 aa		3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	PDR18	P53756	1333 aa		3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	UBP12	P39538	1254 aa		3.75	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ERG12	P07277	443 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	YNL193W	P53870	558 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	CDC45	Q08032	650 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	HVG1	P0CE11	249 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ACE2	P21192	770 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	KTR2	P33550	425 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	CST26	P38226	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ERG7	P38604	731 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	SET4	P42948	560 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	RAD53	P22216	821 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	IRE1	P32361	1115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	GPT2	P36148	743 aa		3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
STE6	YKL209C	ULP1	Q02724	621 aa		3.74	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.5 ms