RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	BRN1	P38170	754 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	GCR2	Q01722	534 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	YKU70	P32807	602 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	PBY1	P38254	753 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	IRC4	Q03036	179 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	DLD1	P32891	587 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	EPS1	P40557	701 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	PIB2	P53191	635 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	TOP1	P04786	769 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	RIM20	Q12033	661 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	YIR042C	P40586	236 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	INM2	Q05533	292 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	SET4	P42948	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	RIM101	P33400	625 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	JJJ2	P46997	583 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	HXT13	P39924	564 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	GSM1	P42950	618 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	HXT17	P53631	564 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	DPL1	Q05567	589 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	PSF3	Q12146	194 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RNQ1	YCL028W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	YFH7	P43591	353 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	TOS4	Q06266	489 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	SHC1	P39000	512 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	GRX7	P38068	203 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	GAS5	Q08193	484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	CYB2	P00175	591 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	YIR014W	P40570	242 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	OPI1	P21957	404 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	FIG2	P25653	1609 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	MDL2	P33311	773 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	BBC1	P47068	1157 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNQ1	YCL028W	ARG82	P07250	355 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	IRC8	P47046	822 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	TAH18	Q12181	623 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	NPL4	P33755	580 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	KAR5	Q04746	504 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	ATG20	Q07528	640 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	AFG2	P32794	780 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	GEF1	P37020	779 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	IOC3	P43596	787 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	LAM4	P38800	1345 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	MSM1	P22438	575 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	CDC27	P38042	758 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	RLF2	Q12495	606 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	MET1	P36150	593 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	PUS6	P53294	404 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	FPK1	P53739	893 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	HKR1	P41809	1802 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	SNF3	P10870	884 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	SLI15	P38283	698 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	APL6	P46682	809 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	PIP2	P52960	996 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RNQ1	YCL028W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	CRF1	Q04930	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	PPM2	Q08282	695 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	COQ1	P18900	473 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	FLO11	P08640	1367 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	YGL015C	P33199	130 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.05	□□□□□ -0.32	not detected
RNQ1	YCL028W	OPY1	P38271	328 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	PCT1	P13259	424 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RNQ1	YCL028W	IMP2'	P32351	346 aa		13.04	□□□□□ -0.32

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