RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	SCT1	P32784	759 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	YLR271W	Q06152	274 aa		5.95	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	YGL082W	P53155	381 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	TAP42	Q04372	366 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PIB1	Q06651	286 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	GRX6	Q12438	231 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PMD1	P32634	1753 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	DSD1	P53095	428 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	SIT4	P20604	311 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	MSM1	P22438	575 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	WSC3	Q12215	556 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	SRF1	Q12516	437 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	GLC3	P32775	704 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	MDG1	P53885	366 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	TIM50	Q02776	476 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	SPP1	Q03012	353 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	ALE1	Q08548	619 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PEA2	P40091	420 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	CTF4	Q01454	927 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	PHM7	Q12252	991 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	SAS4	Q04003	481 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	DPL1	Q05567	589 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	FIG2	P25653	1609 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	EMP47	P43555	445 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	VPS4	P52917	437 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	NCS6	P53088	359 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	AOS1	Q06624	347 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	UBP16	Q02863	499 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	KCC4	P25389	1037 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	STV1	P37296	890 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	BSD2	P38356	321 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	PNT1	P38969	423 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	YGR117C	P53270	476 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	SSP2	Q08646	371 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YNL057W	YNL057W	ARG8	P18544	423 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	MRM1	P25270	412 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	AFG2	P32794	780 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	MAL31	P38156	614 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	SET4	P42948	560 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	SSP1	P38871	571 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	CST9	Q06032	482 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	YPR117W	Q06116	2489 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	NTH2	P35172	780 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
YNL057W	YNL057W	GAS5	Q08193	484 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	HAT1	Q12341	374 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
YNL057W	YNL057W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	VPS64	Q03944	604 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	CBP1	P07252	654 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	RSC30	P38781	883 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	CRF1	Q04930	467 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	HKR1	P41809	1802 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	GSM1	P42950	618 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YNL057W	YNL057W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	VPS13	Q07878	3144 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	TAO3	P40468	2376 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	UGA3	P26370	528 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	ULI1	P43604	169 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	YJL171C	P46992	396 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	PDS5	Q04264	1277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	TRK1	P12685	1235 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	ZDS2	P54786	942 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	RBA50	Q04418	439 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	NSE3	Q05541	303 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	LDB19	Q12502	818 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	KRE2	P27809	442 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	JIP4	Q03361	876 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	PKH1	Q03407	766 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.9 ms