RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	DIT1	P21623	536 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	VMA3	P25515	160 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	ACH1	P32316	526 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	FLO10	P36170	1169 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YBR197C	P38306	217 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	GPG1	P53130	126 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	DMA2	P53924	522 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	FRE8	Q12209	686 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	CPR4	P25334	318 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	ATG22	P25568	528 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	AIM46	P38885	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	NCA3	P46955	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SOL1	P50278	321 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	GEP7	P53171	287 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	INN1	P53901	409 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	MRPS16	Q02608	121 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SYM1	Q06563	197 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	MED4	Q12343	284 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	RTR2	Q12378	196 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	UBA3	Q99344	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YCL042W	P25572	119 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YIR020C	P40575	100 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	XPT1	P47165	209 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YNR064C	P53750	290 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	MRPL13	Q02204	264 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	FIT1	Q04433	528 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	RFM1	Q12192	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SCM3	Q12334	223 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	GEP5	Q12393	293 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	GAL1	P04385	528 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	CKA1	P15790	372 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SEN2	P16658	377 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	APA2	P22108	325 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	RPB7	P34087	171 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	POP8	P38208	133 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	DIE2	P50076	525 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	OKP1	P53298	406 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	HSK3	P69852	69 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	VBA1	Q04301	562 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YDR286C	Q05530	114 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	SCP1	Q08873	200 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	VAM3	Q12241	283 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	YOR029W	Q12243	111 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	TRM13	Q12383	476 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	BMT5	P40493	336 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	PIR5	P46999	287 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	NRG1	Q03125	231 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPS100	YHR139C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	MRP17	P28778	131 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YHC3	P47040	408 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	IRC25	Q07951	179 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YOL118C	Q08259	102 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YDL009C	Q12210	107 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ISC10	P32645	267 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PPQ1	P32945	549 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YUH1	P35127	236 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	GPI18	P38211	433 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	COS8	P38723	381 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PRM5	P40476	318 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	CAB5	Q03941	241 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TSA2	Q04120	196 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ECM18	Q04623	453 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RIM9	Q04734	239 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RTT103	Q05543	409 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	CSI2	Q08054	341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ATP10	P18496	279 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	IES6	P32617	166 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	CPR5	P35176	225 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	LAG1	P38703	411 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	POP2	P39008	433 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PAC2	P39937	518 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TTI2	P47168	421 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	MRPL22	P53881	309 aa		7.25	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms