Protein–RNA interactions for Protein: Q12672

RPL21B, 60S ribosomal protein L21-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL21BQ12672 NSR1YGR159C 1245 nt17.02■□□□□ 0.32
RPL21BQ12672 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.99■□□□□ 0.31
RPL21BQ12672 NOP1YDL014W 984 nt16.52■□□□□ 0.24
RPL21BQ12672 MDJ1YFL016C 1536 nt15.16■□□□□ 0.02
RPL21BQ12672 YKL036CYKL036C 393 nt15.13■□□□□ 0.01
RPL21BQ12672 Q0297Q0297 156 nt14.43□□□□□ -0.1
RPL21BQ12672 SRX1YKL086W 384 nt14.43□□□□□ -0.1
RPL21BQ12672 YJL027CYJL027C 417 nt14.09□□□□□ -0.15
RPL21BQ12672 SCS3YGL126W 1143 nt13.7□□□□□ -0.22
RPL21BQ12672 YCR051WYCR051W 669 nt13.64□□□□□ -0.23
RPL21BQ12672 DBP2YNL112W 1641 nt13.39□□□□□ -0.27
RPL21BQ12672 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.11□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 YOL085CYOL085C 342 nt13.1□□□□□ -0.31
RPL21BQ12672 YBR190WYBR190W 312 nt13□□□□□ -0.33
RPL21BQ12672 RPP1BYDL130W 321 nt12.94□□□□□ -0.34
RPL21BQ12672 CCC1YLR220W 969 nt12.92□□□□□ -0.34
RPL21BQ12672 PKP1YIL042C 1185 nt12.87□□□□□ -0.35
RPL21BQ12672 RTC3YHR087W 336 nt12.66□□□□□ -0.38
RPL21BQ12672 RVS167YDR388W 1449 nt12.59□□□□□ -0.39
RPL21BQ12672 SSA3YBL075C 1950 nt12.49□□□□□ -0.41
RPL21BQ12672 SCJ1YMR214W 1134 nt12.47□□□□□ -0.41
RPL21BQ12672 PET122YER153C 765 nt12.36□□□□□ -0.43
RPL21BQ12672 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.35□□□□□ -0.43
RPL21BQ12672 ATS1YAL020C 1002 nt12.22□□□□□ -0.45
RPL21BQ12672 SCR1SCR1 522 nt12.21□□□□□ -0.45
RPL21BQ12672 SHR5YOL110W 714 nt12.13□□□□□ -0.47
RPL21BQ12672 YDJ1YNL064C 1230 nt11.98□□□□□ -0.49
RPL21BQ12672 RRN5YLR141W 1092 nt11.97□□□□□ -0.49
RPL21BQ12672 PUT4YOR348C 1884 nt11.86□□□□□ -0.51
RPL21BQ12672 URN1YPR152C 1398 nt11.83□□□□□ -0.52
RPL21BQ12672 DEP1YAL013W 1218 nt11.77□□□□□ -0.53
RPL21BQ12672 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.75□□□□□ -0.53
RPL21BQ12672 OPI9YLR338W 858 nt11.7□□□□□ -0.54
RPL21BQ12672 RSB1YOR049C 1065 nt11.7□□□□□ -0.54
RPL21BQ12672 GAR1YHR089C 618 nt11.67□□□□□ -0.54
RPL21BQ12672 RPN10YHR200W 807 nt11.67□□□□□ -0.54
RPL21BQ12672 YNL208WYNL208W 600 nt11.63□□□□□ -0.55
RPL21BQ12672 ARE1YCR048W 1833 nt11.61□□□□□ -0.55
RPL21BQ12672 SAH1YER043C 1350 nt11.61□□□□□ -0.55
RPL21BQ12672 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL21BQ12672 POA1YBR022W 534 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL21BQ12672 PUN1YLR414C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
RPL21BQ12672 PST2YDR032C 597 nt11.34□□□□□ -0.59
RPL21BQ12672 TIR1YER011W 765 nt11.31□□□□□ -0.6
RPL21BQ12672 YJR018WYJR018W 363 nt11.29□□□□□ -0.6
RPL21BQ12672 BSC6YOL137W 1494 nt11.25□□□□□ -0.61
RPL21BQ12672 PTC2YER089C 1395 nt11.21□□□□□ -0.61
RPL21BQ12672 SSA1YAL005C 1929 nt11.18□□□□□ -0.62
RPL21BQ12672 BUD23YCR047C 828 nt11.17□□□□□ -0.62
RPL21BQ12672 SPT5YML010W 3192 nt11.16□□□□□ -0.62
RPL21BQ12672 NAB2YGL122C 1578 nt11.11□□□□□ -0.63
RPL21BQ12672 YJR120WYJR120W 351 nt11.08□□□□□ -0.64
RPL21BQ12672 RPP2BYDR382W 333 nt11.05□□□□□ -0.64
RPL21BQ12672 SSA4YER103W 1929 nt11.05□□□□□ -0.64
RPL21BQ12672 SRB2YHR041C 633 nt10.95□□□□□ -0.66
RPL21BQ12672 DAL1YIR027C 1383 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL21BQ12672 FIS1YIL065C 468 nt10.93□□□□□ -0.66
RPL21BQ12672 INM2YDR287W 879 nt10.92□□□□□ -0.66
RPL21BQ12672 SHU1YHL006C 453 nt10.89□□□□□ -0.67
RPL21BQ12672 FPR4YLR449W 1179 nt10.87□□□□□ -0.67
RPL21BQ12672 YKL097CYKL097C 411 nt10.84□□□□□ -0.67
RPL21BQ12672 PHO4YFR034C 939 nt10.83□□□□□ -0.68
RPL21BQ12672 BDH2YAL061W 1254 nt10.81□□□□□ -0.68
RPL21BQ12672 YBL100CYBL100C 315 nt10.78□□□□□ -0.68
RPL21BQ12672 WWM1YFL010C 636 nt10.77□□□□□ -0.69
RPL21BQ12672 YGR021WYGR021W 873 nt10.74□□□□□ -0.69
RPL21BQ12672 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.72□□□□□ -0.69
RPL21BQ12672 BDF1YLR399C 2061 nt10.7□□□□□ -0.7
RPL21BQ12672 HOM6YJR139C 1080 nt10.67□□□□□ -0.7
RPL21BQ12672 LSM3YLR438C-A 270 nt10.66□□□□□ -0.7
RPL21BQ12672 YPS1YLR120C 1710 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL21BQ12672 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.65□□□□□ -0.7
RPL21BQ12672 FUN26YAL022C 1554 nt10.65□□□□□ -0.71
RPL21BQ12672 TRM9YML014W 840 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL21BQ12672 YDR095CYDR095C 411 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 MEP2YNL142W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 MNP1YGL068W 585 nt10.57□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 TAT1YBR069C 1860 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.53□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 CCT6YDR188W 1641 nt10.53□□□□□ -0.72
RPL21BQ12672 ALF1YNL148C 765 nt10.52□□□□□ -0.73
RPL21BQ12672 RKM5YLR137W 1104 nt10.51□□□□□ -0.73
RPL21BQ12672 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.45□□□□□ -0.74
RPL21BQ12672 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.45□□□□□ -0.74
RPL21BQ12672 YOL037CYOL037C 354 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL21BQ12672 YOR139CYOR139C 393 nt10.41□□□□□ -0.74
RPL21BQ12672 RPP2AYOL039W 321 nt10.39□□□□□ -0.75
RPL21BQ12672 DCW1YKL046C 1350 nt10.38□□□□□ -0.75
RPL21BQ12672 NPL3YDR432W 1245 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL21BQ12672 SIS1YNL007C 1059 nt10.37□□□□□ -0.75
RPL21BQ12672 PAC11YDR488C 1602 nt10.34□□□□□ -0.75
RPL21BQ12672 PTP1YDL230W 1008 nt10.33□□□□□ -0.76
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