Protein–RNA interactions for Protein: Q12192

RFM1, Repression factor of MSEs protein 1, yeastyeast

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFM1Q12192 NSR1YGR159C 1245 nt17.1■□□□□ 0.33
RFM1Q12192 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.05■□□□□ 0.32
RFM1Q12192 NOP1YDL014W 984 nt16.58■□□□□ 0.24
RFM1Q12192 MDJ1YFL016C 1536 nt15.21■□□□□ 0.03
RFM1Q12192 YKL036CYKL036C 393 nt15.19■□□□□ 0.02
RFM1Q12192 Q0297Q0297 156 nt14.5□□□□□ -0.09
RFM1Q12192 SRX1YKL086W 384 nt14.49□□□□□ -0.09
RFM1Q12192 YJL027CYJL027C 417 nt14.13□□□□□ -0.15
RFM1Q12192 SCS3YGL126W 1143 nt13.75□□□□□ -0.21
RFM1Q12192 YCR051WYCR051W 669 nt13.69□□□□□ -0.22
RFM1Q12192 DBP2YNL112W 1641 nt13.46□□□□□ -0.26
RFM1Q12192 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 YOL085CYOL085C 342 nt13.16□□□□□ -0.3
RFM1Q12192 YBR190WYBR190W 312 nt13.06□□□□□ -0.32
RFM1Q12192 RPP1BYDL130W 321 nt12.99□□□□□ -0.33
RFM1Q12192 CCC1YLR220W 969 nt12.96□□□□□ -0.33
RFM1Q12192 PKP1YIL042C 1185 nt12.91□□□□□ -0.34
RFM1Q12192 RTC3YHR087W 336 nt12.7□□□□□ -0.38
RFM1Q12192 RVS167YDR388W 1449 nt12.63□□□□□ -0.39
RFM1Q12192 SCJ1YMR214W 1134 nt12.53□□□□□ -0.4
RFM1Q12192 PET122YER153C 765 nt12.4□□□□□ -0.42
RFM1Q12192 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.4□□□□□ -0.42
RFM1Q12192 ATS1YAL020C 1002 nt12.28□□□□□ -0.44
RFM1Q12192 SCR1SCR1 522 nt12.25□□□□□ -0.45
RFM1Q12192 SHR5YOL110W 714 nt12.18□□□□□ -0.46
RFM1Q12192 RRN5YLR141W 1092 nt12.03□□□□□ -0.48
RFM1Q12192 YDJ1YNL064C 1230 nt12.03□□□□□ -0.48
RFM1Q12192 PUT4YOR348C 1884 nt11.92□□□□□ -0.5
RFM1Q12192 URN1YPR152C 1398 nt11.87□□□□□ -0.51
RFM1Q12192 SSA3YBL075C 1950 nt11.83□□□□□ -0.52
RFM1Q12192 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
RFM1Q12192 DEP1YAL013W 1218 nt11.8□□□□□ -0.52
RFM1Q12192 OPI9YLR338W 858 nt11.75□□□□□ -0.53
RFM1Q12192 RSB1YOR049C 1065 nt11.73□□□□□ -0.53
RFM1Q12192 GAR1YHR089C 618 nt11.72□□□□□ -0.53
RFM1Q12192 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
RFM1Q12192 ARE1YCR048W 1833 nt11.67□□□□□ -0.54
RFM1Q12192 SAH1YER043C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
RFM1Q12192 YNL208WYNL208W 600 nt11.66□□□□□ -0.54
RFM1Q12192 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.5□□□□□ -0.57
RFM1Q12192 POA1YBR022W 534 nt11.5□□□□□ -0.57
RFM1Q12192 PUN1YLR414C 792 nt11.42□□□□□ -0.58
RFM1Q12192 PST2YDR032C 597 nt11.41□□□□□ -0.58
RFM1Q12192 TIR1YER011W 765 nt11.36□□□□□ -0.59
RFM1Q12192 YJR018WYJR018W 363 nt11.33□□□□□ -0.6
RFM1Q12192 BSC6YOL137W 1494 nt11.29□□□□□ -0.6
RFM1Q12192 PTC2YER089C 1395 nt11.26□□□□□ -0.61
RFM1Q12192 SSA1YAL005C 1929 nt11.23□□□□□ -0.61
RFM1Q12192 BUD23YCR047C 828 nt11.2□□□□□ -0.62
RFM1Q12192 NAB2YGL122C 1578 nt11.15□□□□□ -0.62
RFM1Q12192 YJR120WYJR120W 351 nt11.14□□□□□ -0.63
RFM1Q12192 RPP2BYDR382W 333 nt11.08□□□□□ -0.64
RFM1Q12192 SRB2YHR041C 633 nt11□□□□□ -0.65
RFM1Q12192 DAL1YIR027C 1383 nt10.99□□□□□ -0.65
RFM1Q12192 FIS1YIL065C 468 nt10.98□□□□□ -0.65
RFM1Q12192 INM2YDR287W 879 nt10.96□□□□□ -0.65
RFM1Q12192 SHU1YHL006C 453 nt10.94□□□□□ -0.66
RFM1Q12192 FPR4YLR449W 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
RFM1Q12192 SPT5YML010W 3192 nt10.89□□□□□ -0.67
RFM1Q12192 YKL097CYKL097C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
RFM1Q12192 PHO4YFR034C 939 nt10.87□□□□□ -0.67
RFM1Q12192 BDH2YAL061W 1254 nt10.85□□□□□ -0.67
RFM1Q12192 WWM1YFL010C 636 nt10.82□□□□□ -0.68
RFM1Q12192 YBL100CYBL100C 315 nt10.82□□□□□ -0.68
RFM1Q12192 YGR021WYGR021W 873 nt10.77□□□□□ -0.69
RFM1Q12192 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.76□□□□□ -0.69
RFM1Q12192 LSM3YLR438C-A 270 nt10.72□□□□□ -0.69
RFM1Q12192 HOM6YJR139C 1080 nt10.71□□□□□ -0.69
RFM1Q12192 YPS1YLR120C 1710 nt10.7□□□□□ -0.7
RFM1Q12192 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.69□□□□□ -0.7
RFM1Q12192 FUN26YAL022C 1554 nt10.69□□□□□ -0.7
RFM1Q12192 TRM9YML014W 840 nt10.65□□□□□ -0.7
RFM1Q12192 YDR095CYDR095C 411 nt10.63□□□□□ -0.71
RFM1Q12192 MEP2YNL142W 1500 nt10.63□□□□□ -0.71
RFM1Q12192 MNP1YGL068W 585 nt10.6□□□□□ -0.71
RFM1Q12192 CCT6YDR188W 1641 nt10.58□□□□□ -0.72
RFM1Q12192 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.56□□□□□ -0.72
RFM1Q12192 RKM5YLR137W 1104 nt10.55□□□□□ -0.72
RFM1Q12192 ALF1YNL148C 765 nt10.54□□□□□ -0.72
RFM1Q12192 SSA4YER103W 1929 nt10.49□□□□□ -0.73
RFM1Q12192 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RFM1Q12192 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.49□□□□□ -0.73
RFM1Q12192 YOR139CYOR139C 393 nt10.47□□□□□ -0.73
RFM1Q12192 YOL037CYOL037C 354 nt10.45□□□□□ -0.74
RFM1Q12192 SIS1YNL007C 1059 nt10.43□□□□□ -0.74
RFM1Q12192 DCW1YKL046C 1350 nt10.42□□□□□ -0.74
RFM1Q12192 RPP2AYOL039W 321 nt10.42□□□□□ -0.74
RFM1Q12192 PTP1YDL230W 1008 nt10.39□□□□□ -0.75
RFM1Q12192 NPL3YDR432W 1245 nt10.39□□□□□ -0.75
RFM1Q12192 EMI2YDR516C 1503 nt10.32□□□□□ -0.76
RFM1Q12192 CAC2YML102W 1407 nt10.3□□□□□ -0.76
RFM1Q12192 YMR090WYMR090W 684 nt10.27□□□□□ -0.77
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