Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2Q2

YCL048W-A, Uncharacterized protein YCL048W-A, yeastyeast

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCL048W-AQ2V2Q2 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.17■□□□□ 0.34
YCL048W-AQ2V2Q2 NSR1YGR159C 1245 nt17.01■□□□□ 0.31
YCL048W-AQ2V2Q2 NOP1YDL014W 984 nt16.76■□□□□ 0.27
YCL048W-AQ2V2Q2 YKL036CYKL036C 393 nt15.56■□□□□ 0.08
YCL048W-AQ2V2Q2 MDJ1YFL016C 1536 nt14.97□□□□□ -0.01
YCL048W-AQ2V2Q2 Q0297Q0297 156 nt14.73□□□□□ -0.05
YCL048W-AQ2V2Q2 SRX1YKL086W 384 nt14.65□□□□□ -0.06
YCL048W-AQ2V2Q2 YJL027CYJL027C 417 nt14.52□□□□□ -0.09
YCL048W-AQ2V2Q2 SCS3YGL126W 1143 nt14.2□□□□□ -0.14
YCL048W-AQ2V2Q2 YCR051WYCR051W 669 nt13.87□□□□□ -0.19
YCL048W-AQ2V2Q2 YOL085CYOL085C 342 nt13.47□□□□□ -0.25
YCL048W-AQ2V2Q2 DBP2YNL112W 1641 nt13.32□□□□□ -0.28
YCL048W-AQ2V2Q2 PKP1YIL042C 1185 nt13.21□□□□□ -0.29
YCL048W-AQ2V2Q2 RPP1BYDL130W 321 nt13.2□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.19□□□□□ -0.3
YCL048W-AQ2V2Q2 CCC1YLR220W 969 nt13□□□□□ -0.33
YCL048W-AQ2V2Q2 YBR190WYBR190W 312 nt12.78□□□□□ -0.36
YCL048W-AQ2V2Q2 SCJ1YMR214W 1134 nt12.75□□□□□ -0.37
YCL048W-AQ2V2Q2 ATS1YAL020C 1002 nt12.74□□□□□ -0.37
YCL048W-AQ2V2Q2 PET122YER153C 765 nt12.58□□□□□ -0.4
YCL048W-AQ2V2Q2 RVS167YDR388W 1449 nt12.54□□□□□ -0.4
YCL048W-AQ2V2Q2 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YCL048W-AQ2V2Q2 SCR1SCR1 522 nt12.48□□□□□ -0.41
YCL048W-AQ2V2Q2 RTC3YHR087W 336 nt12.45□□□□□ -0.42
YCL048W-AQ2V2Q2 RRN5YLR141W 1092 nt12.22□□□□□ -0.45
YCL048W-AQ2V2Q2 SHR5YOL110W 714 nt12.14□□□□□ -0.47
YCL048W-AQ2V2Q2 YDJ1YNL064C 1230 nt12.12□□□□□ -0.47
YCL048W-AQ2V2Q2 YER088W-BYER088W-B 147 nt12□□□□□ -0.49
YCL048W-AQ2V2Q2 RSB1YOR049C 1065 nt11.99□□□□□ -0.49
YCL048W-AQ2V2Q2 PST2YDR032C 597 nt11.79□□□□□ -0.52
YCL048W-AQ2V2Q2 GAR1YHR089C 618 nt11.78□□□□□ -0.52
YCL048W-AQ2V2Q2 URN1YPR152C 1398 nt11.71□□□□□ -0.53
YCL048W-AQ2V2Q2 DEP1YAL013W 1218 nt11.71□□□□□ -0.53
YCL048W-AQ2V2Q2 RPN10YHR200W 807 nt11.58□□□□□ -0.56
YCL048W-AQ2V2Q2 YNL208WYNL208W 600 nt11.58□□□□□ -0.56
YCL048W-AQ2V2Q2 OPI9YLR338W 858 nt11.55□□□□□ -0.56
YCL048W-AQ2V2Q2 PUT4YOR348C 1884 nt11.52□□□□□ -0.57
YCL048W-AQ2V2Q2 SAH1YER043C 1350 nt11.41□□□□□ -0.58
YCL048W-AQ2V2Q2 TIR1YER011W 765 nt11.4□□□□□ -0.58
YCL048W-AQ2V2Q2 YKL097CYKL097C 411 nt11.36□□□□□ -0.59
YCL048W-AQ2V2Q2 ARE1YCR048W 1833 nt11.34□□□□□ -0.59
YCL048W-AQ2V2Q2 SHU1YHL006C 453 nt11.27□□□□□ -0.61
YCL048W-AQ2V2Q2 SSA1YAL005C 1929 nt11.25□□□□□ -0.61
YCL048W-AQ2V2Q2 PUN1YLR414C 792 nt11.21□□□□□ -0.61
YCL048W-AQ2V2Q2 YJR018WYJR018W 363 nt11.18□□□□□ -0.62
YCL048W-AQ2V2Q2 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.17□□□□□ -0.62
YCL048W-AQ2V2Q2 POA1YBR022W 534 nt11.13□□□□□ -0.63
YCL048W-AQ2V2Q2 SRB2YHR041C 633 nt11.08□□□□□ -0.64
YCL048W-AQ2V2Q2 YJR120WYJR120W 351 nt11.06□□□□□ -0.64
YCL048W-AQ2V2Q2 PTC2YER089C 1395 nt11.03□□□□□ -0.64
YCL048W-AQ2V2Q2 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.03□□□□□ -0.64
YCL048W-AQ2V2Q2 RPP2BYDR382W 333 nt10.98□□□□□ -0.65
YCL048W-AQ2V2Q2 WWM1YFL010C 636 nt10.91□□□□□ -0.66
YCL048W-AQ2V2Q2 YGR021WYGR021W 873 nt10.91□□□□□ -0.66
YCL048W-AQ2V2Q2 BUD23YCR047C 828 nt10.9□□□□□ -0.66
YCL048W-AQ2V2Q2 YOR139CYOR139C 393 nt10.9□□□□□ -0.66
YCL048W-AQ2V2Q2 BSC6YOL137W 1494 nt10.89□□□□□ -0.67
YCL048W-AQ2V2Q2 NAB2YGL122C 1578 nt10.89□□□□□ -0.67
YCL048W-AQ2V2Q2 HOM6YJR139C 1080 nt10.87□□□□□ -0.67
YCL048W-AQ2V2Q2 SSA3YBL075C 1950 nt10.81□□□□□ -0.68
YCL048W-AQ2V2Q2 MNP1YGL068W 585 nt10.81□□□□□ -0.68
YCL048W-AQ2V2Q2 BDH2YAL061W 1254 nt10.8□□□□□ -0.68
YCL048W-AQ2V2Q2 INM2YDR287W 879 nt10.79□□□□□ -0.68
YCL048W-AQ2V2Q2 DAL1YIR027C 1383 nt10.77□□□□□ -0.68
YCL048W-AQ2V2Q2 NPL3YDR432W 1245 nt10.76□□□□□ -0.69
YCL048W-AQ2V2Q2 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.76□□□□□ -0.69
YCL048W-AQ2V2Q2 FIS1YIL065C 468 nt10.76□□□□□ -0.69
YCL048W-AQ2V2Q2 RKM5YLR137W 1104 nt10.71□□□□□ -0.69
YCL048W-AQ2V2Q2 YOL037CYOL037C 354 nt10.7□□□□□ -0.7
YCL048W-AQ2V2Q2 LSM3YLR438C-A 270 nt10.69□□□□□ -0.7
YCL048W-AQ2V2Q2 FPR4YLR449W 1179 nt10.69□□□□□ -0.7
YCL048W-AQ2V2Q2 YBL100CYBL100C 315 nt10.69□□□□□ -0.7
YCL048W-AQ2V2Q2 PHO4YFR034C 939 nt10.66□□□□□ -0.7
YCL048W-AQ2V2Q2 FUN26YAL022C 1554 nt10.56□□□□□ -0.72
YCL048W-AQ2V2Q2 TRM9YML014W 840 nt10.56□□□□□ -0.72
YCL048W-AQ2V2Q2 CCT6YDR188W 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.46□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.46□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.46□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.46□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.46□□□□□ -0.73
YCL048W-AQ2V2Q2 YLR281CYLR281C 468 nt10.44□□□□□ -0.74
YCL048W-AQ2V2Q2 YPS1YLR120C 1710 nt10.42□□□□□ -0.74
YCL048W-AQ2V2Q2 YDR095CYDR095C 411 nt10.39□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 ALF1YNL148C 765 nt10.38□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 WHI5YOR083W 888 nt10.38□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.37□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.37□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 PUS2YGL063W 1113 nt10.34□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 SPT5YML010W 3192 nt10.34□□□□□ -0.75
YCL048W-AQ2V2Q2 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.28□□□□□ -0.76
YCL048W-AQ2V2Q2 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.28□□□□□ -0.76
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