RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W NIF3P53081 288 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W DMA2P53924 522 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YMR279CQ03263 540 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YDR248CQ03786 193 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W EAF3Q12432 401 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W NUM1Q00402 2748 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W GAL1P04385 528 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W SEN2P16658 377 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W MIR1P23641 311 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W IMP1P28627 190 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W LNP1P38878 278 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W CCS1P40202 249 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W MRX5P47007 382 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W TAF4P50105 388 aa7.55□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RPL25P04456 142 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W SPS4P09937 338 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W PET122P10355 254 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YCR101CP25607 182 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W ACB1P31787 87 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YER137CP40083 148 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W ORM1P53224 222 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W CRZ1P53968 678 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W SKO1Q02100 647 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W GRC3Q07845 632 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W SCP1Q08873 200 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W UBA3Q99344 299 aa7.54□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RPS23BP0CX30 145 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RPB7P34087 171 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W SWD3P38123 315 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YPC1P38298 316 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W PRS2P38620 318 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W GEP4P38812 185 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YGR210CP42942 411 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W HNT2P49775 206 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W MRPL50P53724 139 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W ALG9P53868 555 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W COA4Q05809 96 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YLR224WQ05947 369 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YDL086WQ07505 273 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W FEX2Q08991 375 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W FRE8Q12209 686 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YLR365WQ7LIF2 110 aa7.53□□□□□ -1.2
DDI1YER143W VMA3P25515 160 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SUA5P32579 426 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W NAT2P37293 288 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W AIM46P38885 310 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data7.52□□□□□ -1.21not detected
DDI1YER143W UBP8P50102 471 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SED1Q01589 338 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W THI74Q04083 370 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YMR254CQ04838 102 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YDR286CQ05530 114 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RTT103Q05543 409 aa7.52□□□□□ -1.21
DDI1YER143W TPI1P00942 248 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W DAL80P26343 269 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W MTR2P34232 184 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SHM2P37291 469 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W POP2P39008 433 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RMD6P39975 231 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PRM5P40476 318 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W GON7P46984 123 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SOL1P50278 321 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W MRPL22P53881 309 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YNL092WP53934 400 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W CAB5Q03941 241 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PLP1Q04004 230 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YOL118CQ08259 102 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YNG1Q08465 219 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W MED4Q12343 284 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YOR192C-CQ3E736 78 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa7.51□□□□□ -1.21
DDI1YER143W QCR2P07257 368 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SPS100P13130 326 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YCR061WP25639 631 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YDR114CQ04597 100 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W UPS1Q05776 175 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W FEX1Q08913 375 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W WHI5Q12416 295 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa7.5□□□□□ -1.21
DDI1YER143W FUS3P16892 353 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SEC22P22214 214 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ECM27P47144 725 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PEF1P53238 335 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ASM4Q05166 528 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W FCY22Q12119 530 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W VAM3Q12241 283 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YLR108CQ12259 485 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PRM4Q12498 284 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ATG40Q99325 256 aa7.49□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RPL39P04650 51 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YML003WP0CF16 290 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms