Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 NSR1YGR159C 1245 nt17.27■□□□□ 0.36
CCS1P40202 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.21■□□□□ 0.35
CCS1P40202 NOP1YDL014W 984 nt16.66■□□□□ 0.26
CCS1P40202 MDJ1YFL016C 1536 nt15.52■□□□□ 0.07
CCS1P40202 YKL036CYKL036C 393 nt15.15■□□□□ 0.02
CCS1P40202 SRX1YKL086W 384 nt14.52□□□□□ -0.09
CCS1P40202 Q0297Q0297 156 nt14.46□□□□□ -0.09
CCS1P40202 YJL027CYJL027C 417 nt14.35□□□□□ -0.11
CCS1P40202 YCR051WYCR051W 669 nt13.8□□□□□ -0.2
CCS1P40202 SCS3YGL126W 1143 nt13.64□□□□□ -0.23
CCS1P40202 DBP2YNL112W 1641 nt13.6□□□□□ -0.23
CCS1P40202 YBR190WYBR190W 312 nt13.31□□□□□ -0.28
CCS1P40202 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.23□□□□□ -0.29
CCS1P40202 CCC1YLR220W 969 nt13.15□□□□□ -0.3
CCS1P40202 YOL085CYOL085C 342 nt13.1□□□□□ -0.31
CCS1P40202 RTC3YHR087W 336 nt13.04□□□□□ -0.32
CCS1P40202 RPP1BYDL130W 321 nt13□□□□□ -0.33
CCS1P40202 PKP1YIL042C 1185 nt12.95□□□□□ -0.34
CCS1P40202 RVS167YDR388W 1449 nt12.84□□□□□ -0.35
CCS1P40202 SCJ1YMR214W 1134 nt12.63□□□□□ -0.39
CCS1P40202 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.47□□□□□ -0.41
CCS1P40202 PET122YER153C 765 nt12.43□□□□□ -0.42
CCS1P40202 SHR5YOL110W 714 nt12.3□□□□□ -0.44
CCS1P40202 SCR1SCR1 522 nt12.29□□□□□ -0.44
CCS1P40202 PUT4YOR348C 1884 nt12.19□□□□□ -0.46
CCS1P40202 ATS1YAL020C 1002 nt12.14□□□□□ -0.47
CCS1P40202 URN1YPR152C 1398 nt12.1□□□□□ -0.47
CCS1P40202 RRN5YLR141W 1092 nt12.06□□□□□ -0.48
CCS1P40202 YDJ1YNL064C 1230 nt12.06□□□□□ -0.48
CCS1P40202 DEP1YAL013W 1218 nt12.04□□□□□ -0.48
CCS1P40202 OPI9YLR338W 858 nt11.95□□□□□ -0.5
CCS1P40202 SAH1YER043C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
CCS1P40202 SSA3YBL075C 1950 nt11.92□□□□□ -0.5
CCS1P40202 ARE1YCR048W 1833 nt11.91□□□□□ -0.5
CCS1P40202 RPN10YHR200W 807 nt11.91□□□□□ -0.5
CCS1P40202 GAR1YHR089C 618 nt11.84□□□□□ -0.51
CCS1P40202 POA1YBR022W 534 nt11.84□□□□□ -0.51
CCS1P40202 YNL208WYNL208W 600 nt11.83□□□□□ -0.52
CCS1P40202 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
CCS1P40202 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.79□□□□□ -0.52
CCS1P40202 RSB1YOR049C 1065 nt11.77□□□□□ -0.53
CCS1P40202 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
CCS1P40202 BSC6YOL137W 1494 nt11.61□□□□□ -0.55
CCS1P40202 BUD23YCR047C 828 nt11.55□□□□□ -0.56
CCS1P40202 YJR018WYJR018W 363 nt11.54□□□□□ -0.56
CCS1P40202 PTC2YER089C 1395 nt11.51□□□□□ -0.57
CCS1P40202 TIR1YER011W 765 nt11.45□□□□□ -0.58
CCS1P40202 NAB2YGL122C 1578 nt11.4□□□□□ -0.58
CCS1P40202 SSA1YAL005C 1929 nt11.32□□□□□ -0.6
CCS1P40202 RPP2BYDR382W 333 nt11.29□□□□□ -0.6
CCS1P40202 PST2YDR032C 597 nt11.26□□□□□ -0.61
CCS1P40202 YJR120WYJR120W 351 nt11.22□□□□□ -0.61
CCS1P40202 FPR4YLR449W 1179 nt11.21□□□□□ -0.61
CCS1P40202 DAL1YIR027C 1383 nt11.19□□□□□ -0.62
CCS1P40202 INM2YDR287W 879 nt11.17□□□□□ -0.62
CCS1P40202 FIS1YIL065C 468 nt11.15□□□□□ -0.62
CCS1P40202 SPT5YML010W 3192 nt11.1□□□□□ -0.63
CCS1P40202 PHO4YFR034C 939 nt11.08□□□□□ -0.64
CCS1P40202 SRB2YHR041C 633 nt11.03□□□□□ -0.64
CCS1P40202 YBL100CYBL100C 315 nt11.01□□□□□ -0.65
CCS1P40202 BDH2YAL061W 1254 nt10.98□□□□□ -0.65
CCS1P40202 YPS1YLR120C 1710 nt10.92□□□□□ -0.66
CCS1P40202 MEP2YNL142W 1500 nt10.92□□□□□ -0.66
CCS1P40202 WWM1YFL010C 636 nt10.9□□□□□ -0.66
CCS1P40202 SSA4YER103W 1929 nt10.88□□□□□ -0.67
CCS1P40202 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.87□□□□□ -0.67
CCS1P40202 FUN26YAL022C 1554 nt10.86□□□□□ -0.67
CCS1P40202 SHU1YHL006C 453 nt10.86□□□□□ -0.67
CCS1P40202 TRM9YML014W 840 nt10.84□□□□□ -0.67
CCS1P40202 YDR095CYDR095C 411 nt10.82□□□□□ -0.68
CCS1P40202 YGR021WYGR021W 873 nt10.8□□□□□ -0.68
CCS1P40202 LSM3YLR438C-A 270 nt10.8□□□□□ -0.68
CCS1P40202 ALF1YNL148C 765 nt10.8□□□□□ -0.68
CCS1P40202 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.79□□□□□ -0.68
CCS1P40202 YKL097CYKL097C 411 nt10.75□□□□□ -0.69
CCS1P40202 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.74□□□□□ -0.69
CCS1P40202 DCW1YKL046C 1350 nt10.72□□□□□ -0.69
CCS1P40202 HOM6YJR139C 1080 nt10.7□□□□□ -0.7
CCS1P40202 CCT6YDR188W 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
CCS1P40202 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.67□□□□□ -0.7
CCS1P40202 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.67□□□□□ -0.7
CCS1P40202 RPP2AYOL039W 321 nt10.65□□□□□ -0.7
CCS1P40202 MNP1YGL068W 585 nt10.63□□□□□ -0.71
CCS1P40202 YMR090WYMR090W 684 nt10.62□□□□□ -0.71
CCS1P40202 EMI2YDR516C 1503 nt10.61□□□□□ -0.71
CCS1P40202 PTP1YDL230W 1008 nt10.57□□□□□ -0.72
CCS1P40202 SIS1YNL007C 1059 nt10.57□□□□□ -0.72
CCS1P40202 RKM5YLR137W 1104 nt10.56□□□□□ -0.72
CCS1P40202 CAC2YML102W 1407 nt10.53□□□□□ -0.72
CCS1P40202 YDL221WYDL221W 552 nt10.51□□□□□ -0.73
CCS1P40202 YBR220CYBR220C 1683 nt10.44□□□□□ -0.74
CCS1P40202 ART5YGR068C 1761 nt10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms