RNA–Protein interactions for RNA: YMR238W

DFG5, Transcript of Putative mannosidase, yeast

Gene DFG5, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DFG5	YMR238W	YOP1	Q12402	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	DIF1	O13577	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SPT10	P35208	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	RRG9	P40156	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SNM1	P40993	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SFH5	P47008	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ATG4	P53867	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SDH7	Q04401	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	FRE3	Q08905	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ENV7	Q12003	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	COX2	P00410	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	ERG8	P24521	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	IFM1	P25038	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	MGR1	P25573	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YPS1	P32329	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YPK3	P38070	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	EHT1	P38295	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	BIG1	P38813	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YJL193W	P39542	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YNL194C	P40169	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SER2	P42941	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SWP82	P43554	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YIP5	P53108	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YLR460C	P54007	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YML122C	Q03207	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	FCY22	Q12119	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	SFG1	Q12507	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	UBA3	Q99344	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DFG5	YMR238W	TFS1	P14306	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	ATP10	P18496	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YMR31	P19955	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	RPB5	P20434	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	RPB8	P20436	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YMC1	P32331	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
DFG5	YMR238W	ARN2	P38724	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	GID8	P40208	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YPS6	P40583	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YNR071C	P53757	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YAT1	P80235	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	ABF2	Q02486	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	IZH1	Q03419	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	EKI1	Q03764	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	BUR2	Q05949	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	IRC13	Q08630	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	SIA1	Q12212	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	DCN1	Q12395	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	MET2	P08465	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	CDC26	P14724	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	CLB2	P24869	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	CNB1	P25296	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	SRB5	P32585	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	COS9	P36034	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	PMT6	P42934	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	NUP57	P48837	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	TOS2	P50078	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	NUP49	Q02199	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	GPI17	Q04080	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	GAL83	Q04739	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	NAT4	Q04751	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	STP3	Q05937	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	MHR1	Q06630	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	RKM5	Q12367	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	YPR1	Q12458	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	PSF1	Q12488	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	NAM2	P11325	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DFG5	YMR238W	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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