Protein–RNA interactions for Protein: Q12458

YPR1, Putative reductase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR1Q12458 NSR1YGR159C 1245 nt18.13■□□□□ 0.49
YPR1Q12458 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.85■□□□□ 0.45
YPR1Q12458 NOP1YDL014W 984 nt17.26■□□□□ 0.35
YPR1Q12458 MDJ1YFL016C 1536 nt16.37■□□□□ 0.21
YPR1Q12458 YKL036CYKL036C 393 nt15.55■□□□□ 0.08
YPR1Q12458 YJL027CYJL027C 417 nt15.12■□□□□ 0.01
YPR1Q12458 SRX1YKL086W 384 nt15.06■□□□□ 0
YPR1Q12458 Q0297Q0297 156 nt14.97□□□□□ -0.01
YPR1Q12458 DBP2YNL112W 1641 nt14.36□□□□□ -0.11
YPR1Q12458 YCR051WYCR051W 669 nt14.24□□□□□ -0.13
YPR1Q12458 SSA3YBL075C 1950 nt14.23□□□□□ -0.13
YPR1Q12458 YBR190WYBR190W 312 nt14.12□□□□□ -0.15
YPR1Q12458 SCS3YGL126W 1143 nt13.93□□□□□ -0.18
YPR1Q12458 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.82□□□□□ -0.2
YPR1Q12458 RTC3YHR087W 336 nt13.76□□□□□ -0.21
YPR1Q12458 CCC1YLR220W 969 nt13.66□□□□□ -0.22
YPR1Q12458 YOL085CYOL085C 342 nt13.47□□□□□ -0.25
YPR1Q12458 RVS167YDR388W 1449 nt13.45□□□□□ -0.26
YPR1Q12458 RPP1BYDL130W 321 nt13.43□□□□□ -0.26
YPR1Q12458 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
YPR1Q12458 PKP1YIL042C 1185 nt13.27□□□□□ -0.29
YPR1Q12458 SCJ1YMR214W 1134 nt13.24□□□□□ -0.29
YPR1Q12458 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.96□□□□□ -0.33
YPR1Q12458 SHR5YOL110W 714 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR1Q12458 PET122YER153C 765 nt12.84□□□□□ -0.35
YPR1Q12458 ARE1YCR048W 1833 nt12.82□□□□□ -0.36
YPR1Q12458 POA1YBR022W 534 nt12.81□□□□□ -0.36
YPR1Q12458 URN1YPR152C 1398 nt12.74□□□□□ -0.37
YPR1Q12458 BSC6YOL137W 1494 nt12.69□□□□□ -0.38
YPR1Q12458 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.68□□□□□ -0.38
YPR1Q12458 OPI9YLR338W 858 nt12.65□□□□□ -0.38
YPR1Q12458 SCR1SCR1 522 nt12.65□□□□□ -0.38
YPR1Q12458 SAH1YER043C 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
YPR1Q12458 SPT5YML010W 3192 nt12.61□□□□□ -0.39
YPR1Q12458 DEP1YAL013W 1218 nt12.59□□□□□ -0.39
YPR1Q12458 SSA4YER103W 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
YPR1Q12458 YDJ1YNL064C 1230 nt12.56□□□□□ -0.4
YPR1Q12458 RPN10YHR200W 807 nt12.49□□□□□ -0.41
YPR1Q12458 RRN5YLR141W 1092 nt12.45□□□□□ -0.42
YPR1Q12458 YNL208WYNL208W 600 nt12.41□□□□□ -0.42
YPR1Q12458 ATS1YAL020C 1002 nt12.37□□□□□ -0.43
YPR1Q12458 BUD23YCR047C 828 nt12.32□□□□□ -0.44
YPR1Q12458 GAR1YHR089C 618 nt12.3□□□□□ -0.44
YPR1Q12458 PUN1YLR414C 792 nt12.29□□□□□ -0.44
YPR1Q12458 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.2□□□□□ -0.46
YPR1Q12458 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
YPR1Q12458 BDF1YLR399C 2061 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR1Q12458 YJR018WYJR018W 363 nt12.14□□□□□ -0.47
YPR1Q12458 NAB2YGL122C 1578 nt12.1□□□□□ -0.47
YPR1Q12458 RSB1YOR049C 1065 nt12.07□□□□□ -0.48
YPR1Q12458 MEP2YNL142W 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
YPR1Q12458 TAT1YBR069C 1860 nt11.97□□□□□ -0.49
YPR1Q12458 TIR1YER011W 765 nt11.92□□□□□ -0.5
YPR1Q12458 DAL1YIR027C 1383 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR1Q12458 FIS1YIL065C 468 nt11.85□□□□□ -0.51
YPR1Q12458 SSA1YAL005C 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
YPR1Q12458 YJR120WYJR120W 351 nt11.84□□□□□ -0.51
YPR1Q12458 PAC11YDR488C 1602 nt11.82□□□□□ -0.52
YPR1Q12458 RPP2BYDR382W 333 nt11.81□□□□□ -0.52
YPR1Q12458 INM2YDR287W 879 nt11.79□□□□□ -0.52
YPR1Q12458 FPR4YLR449W 1179 nt11.79□□□□□ -0.52
YPR1Q12458 DCW1YKL046C 1350 nt11.79□□□□□ -0.52
YPR1Q12458 PHO4YFR034C 939 nt11.72□□□□□ -0.53
YPR1Q12458 YPS1YLR120C 1710 nt11.66□□□□□ -0.54
YPR1Q12458 YBR220CYBR220C 1683 nt11.63□□□□□ -0.55
YPR1Q12458 EMI2YDR516C 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
YPR1Q12458 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.59□□□□□ -0.55
YPR1Q12458 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
YPR1Q12458 YMR090WYMR090W 684 nt11.57□□□□□ -0.56
YPR1Q12458 PST2YDR032C 597 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR1Q12458 SRB2YHR041C 633 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR1Q12458 YDR095CYDR095C 411 nt11.51□□□□□ -0.57
YPR1Q12458 BDH2YAL061W 1254 nt11.51□□□□□ -0.57
YPR1Q12458 YDL221WYDL221W 552 nt11.45□□□□□ -0.58
YPR1Q12458 SDH1YKL148C 1923 nt11.45□□□□□ -0.58
YPR1Q12458 FUN26YAL022C 1554 nt11.43□□□□□ -0.58
YPR1Q12458 NVJ2YPR091C 2313 nt11.43□□□□□ -0.58
YPR1Q12458 PCH2YBR186W 1695 nt11.39□□□□□ -0.59
YPR1Q12458 TRM9YML014W 840 nt11.36□□□□□ -0.59
YPR1Q12458 GUT2YIL155C 1950 nt11.36□□□□□ -0.59
YPR1Q12458 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
YPR1Q12458 ALF1YNL148C 765 nt11.35□□□□□ -0.59
YPR1Q12458 SEC11YIR022W 504 nt11.32□□□□□ -0.6
YPR1Q12458 LSM3YLR438C-A 270 nt11.32□□□□□ -0.6
YPR1Q12458 WWM1YFL010C 636 nt11.31□□□□□ -0.6
YPR1Q12458 PTP1YDL230W 1008 nt11.3□□□□□ -0.6
YPR1Q12458 RPP2AYOL039W 321 nt11.3□□□□□ -0.6
YPR1Q12458 SCC4YER147C 1875 nt11.27□□□□□ -0.61
YPR1Q12458 CCT6YDR188W 1641 nt11.27□□□□□ -0.61
YPR1Q12458 Q0182Q0182 405 nt11.24□□□□□ -0.61
YPR1Q12458 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.21□□□□□ -0.61
YPR1Q12458 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.21□□□□□ -0.61
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