Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 NSR1YGR159C 1245 nt15.72■□□□□ 0.11
YOP1Q12402 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.26■□□□□ 0.03
YOP1Q12402 MDJ1YFL016C 1536 nt14.59□□□□□ -0.07
YOP1Q12402 NOP1YDL014W 984 nt14.58□□□□□ -0.08
YOP1Q12402 YJL027CYJL027C 417 nt13.42□□□□□ -0.26
YOP1Q12402 SSA3YBL075C 1950 nt13.05□□□□□ -0.32
YOP1Q12402 YKL036CYKL036C 393 nt12.81□□□□□ -0.36
YOP1Q12402 SRX1YKL086W 384 nt12.7□□□□□ -0.38
YOP1Q12402 YBR190WYBR190W 312 nt12.62□□□□□ -0.39
YOP1Q12402 DBP2YNL112W 1641 nt12.59□□□□□ -0.39
YOP1Q12402 Q0297Q0297 156 nt12.5□□□□□ -0.41
YOP1Q12402 RTC3YHR087W 336 nt12.34□□□□□ -0.43
YOP1Q12402 YCR051WYCR051W 669 nt12.03□□□□□ -0.48
YOP1Q12402 PUT4YOR348C 1884 nt11.94□□□□□ -0.5
YOP1Q12402 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YOP1Q12402 CCC1YLR220W 969 nt11.78□□□□□ -0.52
YOP1Q12402 RVS167YDR388W 1449 nt11.77□□□□□ -0.52
YOP1Q12402 POA1YBR022W 534 nt11.54□□□□□ -0.56
YOP1Q12402 ARE1YCR048W 1833 nt11.52□□□□□ -0.57
YOP1Q12402 SCJ1YMR214W 1134 nt11.51□□□□□ -0.57
YOP1Q12402 BSC6YOL137W 1494 nt11.42□□□□□ -0.58
YOP1Q12402 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.41□□□□□ -0.58
YOP1Q12402 SAH1YER043C 1350 nt11.34□□□□□ -0.59
YOP1Q12402 SPT5YML010W 3192 nt11.3□□□□□ -0.6
YOP1Q12402 SSA4YER103W 1929 nt11.29□□□□□ -0.6
YOP1Q12402 SCS3YGL126W 1143 nt11.29□□□□□ -0.6
YOP1Q12402 URN1YPR152C 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
YOP1Q12402 OPI9YLR338W 858 nt11.24□□□□□ -0.61
YOP1Q12402 RPP1BYDL130W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
YOP1Q12402 PAC11YDR488C 1602 nt11.2□□□□□ -0.62
YOP1Q12402 SHR5YOL110W 714 nt11.17□□□□□ -0.62
YOP1Q12402 BUD23YCR047C 828 nt11.12□□□□□ -0.63
YOP1Q12402 NVJ2YPR091C 2313 nt11.1□□□□□ -0.63
YOP1Q12402 DEP1YAL013W 1218 nt11.09□□□□□ -0.63
YOP1Q12402 YOL085CYOL085C 342 nt11.09□□□□□ -0.63
YOP1Q12402 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.02□□□□□ -0.65
YOP1Q12402 PKP1YIL042C 1185 nt11.02□□□□□ -0.65
YOP1Q12402 RPN10YHR200W 807 nt11□□□□□ -0.65
YOP1Q12402 FPS1YLL043W 2010 nt10.99□□□□□ -0.65
YOP1Q12402 PUN1YLR414C 792 nt10.93□□□□□ -0.66
YOP1Q12402 PTC2YER089C 1395 nt10.9□□□□□ -0.66
YOP1Q12402 BDF1YLR399C 2061 nt10.89□□□□□ -0.67
YOP1Q12402 Q0182Q0182 405 nt10.88□□□□□ -0.67
YOP1Q12402 NAB2YGL122C 1578 nt10.86□□□□□ -0.67
YOP1Q12402 YNL208WYNL208W 600 nt10.85□□□□□ -0.67
YOP1Q12402 PET122YER153C 765 nt10.8□□□□□ -0.68
YOP1Q12402 MEP2YNL142W 1500 nt10.78□□□□□ -0.68
YOP1Q12402 SSA1YAL005C 1929 nt10.77□□□□□ -0.69
YOP1Q12402 TAT1YBR069C 1860 nt10.74□□□□□ -0.69
YOP1Q12402 YJR018WYJR018W 363 nt10.72□□□□□ -0.69
YOP1Q12402 YDJ1YNL064C 1230 nt10.66□□□□□ -0.7
YOP1Q12402 FIS1YIL065C 468 nt10.61□□□□□ -0.71
YOP1Q12402 DCW1YKL046C 1350 nt10.59□□□□□ -0.71
YOP1Q12402 DAL1YIR027C 1383 nt10.58□□□□□ -0.72
YOP1Q12402 FPR4YLR449W 1179 nt10.57□□□□□ -0.72
YOP1Q12402 GAR1YHR089C 618 nt10.54□□□□□ -0.72
YOP1Q12402 SCR1SCR1 522 nt10.54□□□□□ -0.72
YOP1Q12402 YPS1YLR120C 1710 nt10.5□□□□□ -0.73
YOP1Q12402 PHO4YFR034C 939 nt10.48□□□□□ -0.73
YOP1Q12402 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.47□□□□□ -0.73
YOP1Q12402 YMR090WYMR090W 684 nt10.47□□□□□ -0.73
YOP1Q12402 YBR220CYBR220C 1683 nt10.45□□□□□ -0.74
YOP1Q12402 EMI2YDR516C 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
YOP1Q12402 INM2YDR287W 879 nt10.42□□□□□ -0.74
YOP1Q12402 RRN5YLR141W 1092 nt10.42□□□□□ -0.74
YOP1Q12402 RPP2BYDR382W 333 nt10.35□□□□□ -0.75
YOP1Q12402 YJR120WYJR120W 351 nt10.35□□□□□ -0.75
YOP1Q12402 YDR095CYDR095C 411 nt10.32□□□□□ -0.76
YOP1Q12402 YDL221WYDL221W 552 nt10.3□□□□□ -0.76
YOP1Q12402 SDH1YKL148C 1923 nt10.3□□□□□ -0.76
YOP1Q12402 MOT3YMR070W 1473 nt10.28□□□□□ -0.76
YOP1Q12402 PCH2YBR186W 1695 nt10.25□□□□□ -0.77
YOP1Q12402 YBL100CYBL100C 315 nt10.23□□□□□ -0.77
YOP1Q12402 TIR1YER011W 765 nt10.22□□□□□ -0.77
YOP1Q12402 SEC11YIR022W 504 nt10.21□□□□□ -0.77
YOP1Q12402 UME6YDR207C 2511 nt10.21□□□□□ -0.78
YOP1Q12402 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.2□□□□□ -0.78
YOP1Q12402 GUT2YIL155C 1950 nt10.2□□□□□ -0.78
YOP1Q12402 CAC2YML102W 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
YOP1Q12402 RPP2AYOL039W 321 nt10.15□□□□□ -0.78
YOP1Q12402 SCC4YER147C 1875 nt10.15□□□□□ -0.79
YOP1Q12402 PTP1YDL230W 1008 nt10.13□□□□□ -0.79
YOP1Q12402 ALF1YNL148C 765 nt10.1□□□□□ -0.79
YOP1Q12402 FUN26YAL022C 1554 nt10.06□□□□□ -0.8
YOP1Q12402 IRC15YPL017C 1500 nt10.03□□□□□ -0.8
YOP1Q12402 RSB1YOR049C 1065 nt10.03□□□□□ -0.8
YOP1Q12402 BDH2YAL061W 1254 nt10□□□□□ -0.81
YOP1Q12402 GIS3YLR094C 1509 nt10□□□□□ -0.81
YOP1Q12402 YSC84YHR016C 1407 nt9.99□□□□□ -0.81
YOP1Q12402 PIB2YGL023C 1908 nt9.97□□□□□ -0.81
YOP1Q12402 RTF1YGL244W 1677 nt9.94□□□□□ -0.82
YOP1Q12402 TRM9YML014W 840 nt9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms