Protein–RNA interactions for Protein: P39542

YJL193W, Uncharacterized transporter YJL193W, yeastyeast

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL193WP39542 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.57■□□□□ 0.56
YJL193WP39542 NSR1YGR159C 1245 nt18.53■□□□□ 0.56
YJL193WP39542 NOP1YDL014W 984 nt18.14■□□□□ 0.49
YJL193WP39542 YKL036CYKL036C 393 nt16.7■□□□□ 0.26
YJL193WP39542 MDJ1YFL016C 1536 nt16.35■□□□□ 0.21
YJL193WP39542 Q0297Q0297 156 nt15.86■□□□□ 0.13
YJL193WP39542 SRX1YKL086W 384 nt15.82■□□□□ 0.12
YJL193WP39542 YJL027CYJL027C 417 nt15.55■□□□□ 0.08
YJL193WP39542 SCS3YGL126W 1143 nt15.14■□□□□ 0.01
YJL193WP39542 YCR051WYCR051W 669 nt14.96□□□□□ -0.01
YJL193WP39542 DBP2YNL112W 1641 nt14.48□□□□□ -0.09
YJL193WP39542 YOL085CYOL085C 342 nt14.43□□□□□ -0.1
YJL193WP39542 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YJL193WP39542 RPP1BYDL130W 321 nt14.22□□□□□ -0.13
YJL193WP39542 PKP1YIL042C 1185 nt14.14□□□□□ -0.15
YJL193WP39542 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
YJL193WP39542 YBR190WYBR190W 312 nt14.04□□□□□ -0.16
YJL193WP39542 RVS167YDR388W 1449 nt13.7□□□□□ -0.22
YJL193WP39542 RTC3YHR087W 336 nt13.68□□□□□ -0.22
YJL193WP39542 ATS1YAL020C 1002 nt13.56□□□□□ -0.24
YJL193WP39542 SCJ1YMR214W 1134 nt13.54□□□□□ -0.24
YJL193WP39542 PET122YER153C 765 nt13.53□□□□□ -0.24
YJL193WP39542 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.51□□□□□ -0.25
YJL193WP39542 SCR1SCR1 522 nt13.46□□□□□ -0.25
YJL193WP39542 SHR5YOL110W 714 nt13.21□□□□□ -0.29
YJL193WP39542 RRN5YLR141W 1092 nt13.14□□□□□ -0.31
YJL193WP39542 YDJ1YNL064C 1230 nt13.12□□□□□ -0.31
YJL193WP39542 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL193WP39542 RSB1YOR049C 1065 nt12.88□□□□□ -0.35
YJL193WP39542 URN1YPR152C 1398 nt12.8□□□□□ -0.36
YJL193WP39542 GAR1YHR089C 618 nt12.75□□□□□ -0.37
YJL193WP39542 DEP1YAL013W 1218 nt12.74□□□□□ -0.37
YJL193WP39542 RPN10YHR200W 807 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL193WP39542 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
YJL193WP39542 OPI9YLR338W 858 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL193WP39542 YNL208WYNL208W 600 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL193WP39542 PST2YDR032C 597 nt12.56□□□□□ -0.4
YJL193WP39542 SAH1YER043C 1350 nt12.51□□□□□ -0.41
YJL193WP39542 ARE1YCR048W 1833 nt12.44□□□□□ -0.42
YJL193WP39542 TIR1YER011W 765 nt12.35□□□□□ -0.43
YJL193WP39542 PUN1YLR414C 792 nt12.31□□□□□ -0.44
YJL193WP39542 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL193WP39542 POA1YBR022W 534 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL193WP39542 Q0182Q0182 405 nt12.22□□□□□ -0.45
YJL193WP39542 YJR018WYJR018W 363 nt12.22□□□□□ -0.45
YJL193WP39542 SSA1YAL005C 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
YJL193WP39542 PTC2YER089C 1395 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL193WP39542 YKL097CYKL097C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL193WP39542 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.48
YJL193WP39542 RPP2BYDR382W 333 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL193WP39542 SHU1YHL006C 453 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL193WP39542 BUD23YCR047C 828 nt12.01□□□□□ -0.49
YJL193WP39542 YJR120WYJR120W 351 nt11.99□□□□□ -0.49
YJL193WP39542 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL193WP39542 SRB2YHR041C 633 nt11.89□□□□□ -0.51
YJL193WP39542 INM2YDR287W 879 nt11.84□□□□□ -0.51
YJL193WP39542 SSA3YBL075C 1950 nt11.83□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 DAL1YIR027C 1383 nt11.82□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 MOT3YMR070W 1473 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 YGR021WYGR021W 873 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
YJL193WP39542 WWM1YFL010C 636 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL193WP39542 BDH2YAL061W 1254 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL193WP39542 FPR4YLR449W 1179 nt11.73□□□□□ -0.53
YJL193WP39542 HOM6YJR139C 1080 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL193WP39542 PHO4YFR034C 939 nt11.68□□□□□ -0.54
YJL193WP39542 YBL100CYBL100C 315 nt11.68□□□□□ -0.54
YJL193WP39542 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.66□□□□□ -0.54
YJL193WP39542 LSM3YLR438C-A 270 nt11.65□□□□□ -0.54
YJL193WP39542 MNP1YGL068W 585 nt11.57□□□□□ -0.56
YJL193WP39542 YOR139CYOR139C 393 nt11.55□□□□□ -0.56
YJL193WP39542 TRM9YML014W 840 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL193WP39542 FUN26YAL022C 1554 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL193WP39542 RKM5YLR137W 1104 nt11.52□□□□□ -0.57
YJL193WP39542 NPL3YDR432W 1245 nt11.49□□□□□ -0.57
YJL193WP39542 YOL037CYOL037C 354 nt11.49□□□□□ -0.57
YJL193WP39542 YPS1YLR120C 1710 nt11.46□□□□□ -0.58
YJL193WP39542 CCT6YDR188W 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
YJL193WP39542 SPT5YML010W 3192 nt11.41□□□□□ -0.58
YJL193WP39542 YDR095CYDR095C 411 nt11.41□□□□□ -0.58
YJL193WP39542 ALF1YNL148C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL193WP39542 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL193WP39542 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL193WP39542 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.33□□□□□ -0.6
YJL193WP39542 MEP2YNL142W 1500 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL193WP39542 SIS1YNL007C 1059 nt11.22□□□□□ -0.61
YJL193WP39542 RPP2AYOL039W 321 nt11.2□□□□□ -0.62
YJL193WP39542 YLR281CYLR281C 468 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL193WP39542 WHI5YOR083W 888 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL193WP39542 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.12□□□□□ -0.63
YJL193WP39542 PTP1YDL230W 1008 nt11.11□□□□□ -0.63
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