Protein–RNA interactions for Protein: P32331

YMC1, Mitochondrial glycine transporter YMC1, yeastyeast

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMC1P32331 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.32■□□□□ 0.68
YMC1P32331 NSR1YGR159C 1245 nt19.12■□□□□ 0.65
YMC1P32331 NOP1YDL014W 984 nt18.81■□□□□ 0.6
YMC1P32331 YKL036CYKL036C 393 nt17.41■□□□□ 0.38
YMC1P32331 MDJ1YFL016C 1536 nt16.92■□□□□ 0.3
YMC1P32331 Q0297Q0297 156 nt16.45■□□□□ 0.22
YMC1P32331 SRX1YKL086W 384 nt16.41■□□□□ 0.22
YMC1P32331 YJL027CYJL027C 417 nt16.28■□□□□ 0.2
YMC1P32331 SCS3YGL126W 1143 nt15.85■□□□□ 0.13
YMC1P32331 YCR051WYCR051W 669 nt15.62■□□□□ 0.09
YMC1P32331 YOL085CYOL085C 342 nt15.06■□□□□ 0
YMC1P32331 DBP2YNL112W 1641 nt14.96□□□□□ -0.01
YMC1P32331 PKP1YIL042C 1185 nt14.86□□□□□ -0.03
YMC1P32331 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.79□□□□□ -0.04
YMC1P32331 RPP1BYDL130W 321 nt14.78□□□□□ -0.04
YMC1P32331 CCC1YLR220W 969 nt14.7□□□□□ -0.06
YMC1P32331 YBR190WYBR190W 312 nt14.4□□□□□ -0.1
YMC1P32331 ATS1YAL020C 1002 nt14.2□□□□□ -0.14
YMC1P32331 RTC3YHR087W 336 nt14.14□□□□□ -0.15
YMC1P32331 RVS167YDR388W 1449 nt14.14□□□□□ -0.15
YMC1P32331 PET122YER153C 765 nt14.11□□□□□ -0.15
YMC1P32331 SCJ1YMR214W 1134 nt14.11□□□□□ -0.15
YMC1P32331 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YMC1P32331 SCR1SCR1 522 nt14.01□□□□□ -0.17
YMC1P32331 RRN5YLR141W 1092 nt13.72□□□□□ -0.21
YMC1P32331 SHR5YOL110W 714 nt13.64□□□□□ -0.23
YMC1P32331 YDJ1YNL064C 1230 nt13.55□□□□□ -0.24
YMC1P32331 RSB1YOR049C 1065 nt13.48□□□□□ -0.25
YMC1P32331 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.44□□□□□ -0.26
YMC1P32331 GAR1YHR089C 618 nt13.28□□□□□ -0.28
YMC1P32331 DEP1YAL013W 1218 nt13.27□□□□□ -0.29
YMC1P32331 URN1YPR152C 1398 nt13.23□□□□□ -0.29
YMC1P32331 PST2YDR032C 597 nt13.13□□□□□ -0.31
YMC1P32331 RPN10YHR200W 807 nt13.06□□□□□ -0.32
YMC1P32331 YNL208WYNL208W 600 nt13.05□□□□□ -0.32
YMC1P32331 PUT4YOR348C 1884 nt13.04□□□□□ -0.32
YMC1P32331 SSA3YBL075C 1950 nt13.01□□□□□ -0.33
YMC1P32331 OPI9YLR338W 858 nt13□□□□□ -0.33
YMC1P32331 SAH1YER043C 1350 nt12.92□□□□□ -0.34
YMC1P32331 TIR1YER011W 765 nt12.82□□□□□ -0.36
YMC1P32331 ARE1YCR048W 1833 nt12.79□□□□□ -0.36
YMC1P32331 YKL097CYKL097C 411 nt12.68□□□□□ -0.38
YMC1P32331 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.65□□□□□ -0.38
YMC1P32331 POA1YBR022W 534 nt12.65□□□□□ -0.38
YMC1P32331 PUN1YLR414C 792 nt12.64□□□□□ -0.39
YMC1P32331 SSA1YAL005C 1929 nt12.64□□□□□ -0.39
YMC1P32331 YJR018WYJR018W 363 nt12.63□□□□□ -0.39
YMC1P32331 SHU1YHL006C 453 nt12.59□□□□□ -0.39
YMC1P32331 PTC2YER089C 1395 nt12.48□□□□□ -0.41
YMC1P32331 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.42□□□□□ -0.42
YMC1P32331 BUD23YCR047C 828 nt12.41□□□□□ -0.42
YMC1P32331 RPP2BYDR382W 333 nt12.41□□□□□ -0.42
YMC1P32331 SRB2YHR041C 633 nt12.41□□□□□ -0.42
YMC1P32331 BSC6YOL137W 1494 nt12.4□□□□□ -0.42
YMC1P32331 YJR120WYJR120W 351 nt12.39□□□□□ -0.43
YMC1P32331 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
YMC1P32331 WWM1YFL010C 636 nt12.27□□□□□ -0.45
YMC1P32331 YGR021WYGR021W 873 nt12.22□□□□□ -0.45
YMC1P32331 FPR4YLR449W 1179 nt12.18□□□□□ -0.46
YMC1P32331 INM2YDR287W 879 nt12.17□□□□□ -0.46
YMC1P32331 DAL1YIR027C 1383 nt12.16□□□□□ -0.46
YMC1P32331 HOM6YJR139C 1080 nt12.15□□□□□ -0.46
YMC1P32331 BDH2YAL061W 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
YMC1P32331 YOR139CYOR139C 393 nt12.13□□□□□ -0.47
YMC1P32331 MNP1YGL068W 585 nt12.12□□□□□ -0.47
YMC1P32331 FIS1YIL065C 468 nt12.1□□□□□ -0.47
YMC1P32331 SPT5YML010W 3192 nt12.1□□□□□ -0.47
YMC1P32331 YBL100CYBL100C 315 nt12.07□□□□□ -0.48
YMC1P32331 NPL3YDR432W 1245 nt12.06□□□□□ -0.48
YMC1P32331 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.06□□□□□ -0.48
YMC1P32331 PHO4YFR034C 939 nt12.03□□□□□ -0.48
YMC1P32331 LSM3YLR438C-A 270 nt12□□□□□ -0.49
YMC1P32331 RKM5YLR137W 1104 nt11.98□□□□□ -0.49
YMC1P32331 YOL037CYOL037C 354 nt11.94□□□□□ -0.5
YMC1P32331 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
YMC1P32331 FUN26YAL022C 1554 nt11.92□□□□□ -0.5
YMC1P32331 SSA4YER103W 1929 nt11.81□□□□□ -0.52
YMC1P32331 ALF1YNL148C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
YMC1P32331 CCT6YDR188W 1641 nt11.77□□□□□ -0.53
YMC1P32331 YPS1YLR120C 1710 nt11.76□□□□□ -0.53
YMC1P32331 YDR095CYDR095C 411 nt11.69□□□□□ -0.54
YMC1P32331 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.69□□□□□ -0.54
YMC1P32331 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.69□□□□□ -0.54
YMC1P32331 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.67□□□□□ -0.54
YMC1P32331 MEP2YNL142W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 YLR281CYLR281C 468 nt11.66□□□□□ -0.54
YMC1P32331 WHI5YOR083W 888 nt11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.8 ms