Protein–RNA interactions for Protein: Q07350

PRP11, Pre-mRNA-splicing factor PRP11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP11Q07350 NSR1YGR159C 1245 nt17.02■□□□□ 0.32
PRP11Q07350 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.94■□□□□ 0.3
PRP11Q07350 NOP1YDL014W 984 nt16.59■□□□□ 0.25
PRP11Q07350 YKL036CYKL036C 393 nt15.37■□□□□ 0.05
PRP11Q07350 MDJ1YFL016C 1536 nt15.22■□□□□ 0.03
PRP11Q07350 Q0297Q0297 156 nt14.51□□□□□ -0.09
PRP11Q07350 SRX1YKL086W 384 nt14.46□□□□□ -0.09
PRP11Q07350 YJL027CYJL027C 417 nt14.36□□□□□ -0.11
PRP11Q07350 SCS3YGL126W 1143 nt13.98□□□□□ -0.17
PRP11Q07350 YCR051WYCR051W 669 nt13.71□□□□□ -0.21
PRP11Q07350 DBP2YNL112W 1641 nt13.3□□□□□ -0.28
PRP11Q07350 YOL085CYOL085C 342 nt13.27□□□□□ -0.29
PRP11Q07350 YBR190WYBR190W 312 nt13.16□□□□□ -0.3
PRP11Q07350 RPP1BYDL130W 321 nt13.02□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 PKP1YIL042C 1185 nt13.02□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP11Q07350 RTC3YHR087W 336 nt12.87□□□□□ -0.35
PRP11Q07350 CCC1YLR220W 969 nt12.84□□□□□ -0.35
PRP11Q07350 RVS167YDR388W 1449 nt12.7□□□□□ -0.38
PRP11Q07350 SCJ1YMR214W 1134 nt12.63□□□□□ -0.39
PRP11Q07350 ATS1YAL020C 1002 nt12.55□□□□□ -0.4
PRP11Q07350 SSA3YBL075C 1950 nt12.4□□□□□ -0.42
PRP11Q07350 PET122YER153C 765 nt12.38□□□□□ -0.43
PRP11Q07350 SCR1SCR1 522 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP11Q07350 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP11Q07350 SHR5YOL110W 714 nt12.12□□□□□ -0.47
PRP11Q07350 RRN5YLR141W 1092 nt12.05□□□□□ -0.48
PRP11Q07350 PUT4YOR348C 1884 nt12.03□□□□□ -0.48
PRP11Q07350 YDJ1YNL064C 1230 nt11.96□□□□□ -0.49
PRP11Q07350 URN1YPR152C 1398 nt11.91□□□□□ -0.5
PRP11Q07350 RSB1YOR049C 1065 nt11.85□□□□□ -0.51
PRP11Q07350 RPN10YHR200W 807 nt11.82□□□□□ -0.52
PRP11Q07350 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.81□□□□□ -0.52
PRP11Q07350 OPI9YLR338W 858 nt11.79□□□□□ -0.52
PRP11Q07350 DEP1YAL013W 1218 nt11.77□□□□□ -0.53
PRP11Q07350 SAH1YER043C 1350 nt11.73□□□□□ -0.53
PRP11Q07350 ARE1YCR048W 1833 nt11.72□□□□□ -0.53
PRP11Q07350 POA1YBR022W 534 nt11.68□□□□□ -0.54
PRP11Q07350 YNL208WYNL208W 600 nt11.67□□□□□ -0.54
PRP11Q07350 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.64□□□□□ -0.55
PRP11Q07350 GAR1YHR089C 618 nt11.62□□□□□ -0.55
PRP11Q07350 PST2YDR032C 597 nt11.6□□□□□ -0.55
PRP11Q07350 PUN1YLR414C 792 nt11.52□□□□□ -0.57
PRP11Q07350 BSC6YOL137W 1494 nt11.47□□□□□ -0.57
PRP11Q07350 BUD23YCR047C 828 nt11.39□□□□□ -0.59
PRP11Q07350 YJR018WYJR018W 363 nt11.36□□□□□ -0.59
PRP11Q07350 PTC2YER089C 1395 nt11.33□□□□□ -0.6
PRP11Q07350 NAB2YGL122C 1578 nt11.27□□□□□ -0.61
PRP11Q07350 TIR1YER011W 765 nt11.24□□□□□ -0.61
PRP11Q07350 YKL097CYKL097C 411 nt11.23□□□□□ -0.61
PRP11Q07350 RPP2BYDR382W 333 nt11.17□□□□□ -0.62
PRP11Q07350 SHU1YHL006C 453 nt11.08□□□□□ -0.64
PRP11Q07350 DAL1YIR027C 1383 nt11.06□□□□□ -0.64
PRP11Q07350 INM2YDR287W 879 nt11.06□□□□□ -0.64
PRP11Q07350 SSA1YAL005C 1929 nt11.04□□□□□ -0.64
PRP11Q07350 FPR4YLR449W 1179 nt11.04□□□□□ -0.64
PRP11Q07350 FIS1YIL065C 468 nt10.99□□□□□ -0.65
PRP11Q07350 YJR120WYJR120W 351 nt10.96□□□□□ -0.65
PRP11Q07350 SPT5YML010W 3192 nt10.93□□□□□ -0.66
PRP11Q07350 PHO4YFR034C 939 nt10.93□□□□□ -0.66
PRP11Q07350 SSA4YER103W 1929 nt10.88□□□□□ -0.67
PRP11Q07350 YBL100CYBL100C 315 nt10.85□□□□□ -0.67
PRP11Q07350 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.84□□□□□ -0.67
PRP11Q07350 MEP2YNL142W 1500 nt10.8□□□□□ -0.68
PRP11Q07350 BDH2YAL061W 1254 nt10.8□□□□□ -0.68
PRP11Q07350 YGR021WYGR021W 873 nt10.79□□□□□ -0.68
PRP11Q07350 SRB2YHR041C 633 nt10.79□□□□□ -0.68
PRP11Q07350 YPS1YLR120C 1710 nt10.78□□□□□ -0.68
PRP11Q07350 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.75□□□□□ -0.69
PRP11Q07350 WWM1YFL010C 636 nt10.72□□□□□ -0.69
PRP11Q07350 YDR095CYDR095C 411 nt10.7□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 ALF1YNL148C 765 nt10.7□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 FUN26YAL022C 1554 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 HOM6YJR139C 1080 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 TRM9YML014W 840 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 YOR139CYOR139C 393 nt10.69□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 NPL3YDR432W 1245 nt10.67□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 LSM3YLR438C-A 270 nt10.65□□□□□ -0.7
PRP11Q07350 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.62□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 MNP1YGL068W 585 nt10.61□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 YMR090WYMR090W 684 nt10.6□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 YOL037CYOL037C 354 nt10.59□□□□□ -0.71
PRP11Q07350 RKM5YLR137W 1104 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP11Q07350 DCW1YKL046C 1350 nt10.54□□□□□ -0.72
PRP11Q07350 CCT6YDR188W 1641 nt10.54□□□□□ -0.72
PRP11Q07350 BDF1YLR399C 2061 nt10.53□□□□□ -0.72
PRP11Q07350 RPP2AYOL039W 321 nt10.53□□□□□ -0.72
PRP11Q07350 PAC11YDR488C 1602 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP11Q07350 FPS1YLL043W 2010 nt10.5□□□□□ -0.73
PRP11Q07350 EMI2YDR516C 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
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