Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.84■□□□□ 0.61
PSF1Q12488 NSR1YGR159C 1245 nt18.76■□□□□ 0.59
PSF1Q12488 NOP1YDL014W 984 nt18.35■□□□□ 0.53
PSF1Q12488 YKL036CYKL036C 393 nt16.92■□□□□ 0.3
PSF1Q12488 MDJ1YFL016C 1536 nt16.6■□□□□ 0.25
PSF1Q12488 Q0297Q0297 156 nt16.06■□□□□ 0.16
PSF1Q12488 SRX1YKL086W 384 nt16.02■□□□□ 0.16
PSF1Q12488 YJL027CYJL027C 417 nt15.79■□□□□ 0.12
PSF1Q12488 SCS3YGL126W 1143 nt15.38■□□□□ 0.05
PSF1Q12488 YCR051WYCR051W 669 nt15.18■□□□□ 0.02
PSF1Q12488 DBP2YNL112W 1641 nt14.71□□□□□ -0.05
PSF1Q12488 YOL085CYOL085C 342 nt14.64□□□□□ -0.07
PSF1Q12488 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.49□□□□□ -0.09
PSF1Q12488 RPP1BYDL130W 321 nt14.4□□□□□ -0.1
PSF1Q12488 PKP1YIL042C 1185 nt14.38□□□□□ -0.11
PSF1Q12488 CCC1YLR220W 969 nt14.3□□□□□ -0.12
PSF1Q12488 YBR190WYBR190W 312 nt14.2□□□□□ -0.14
PSF1Q12488 RVS167YDR388W 1449 nt13.87□□□□□ -0.19
PSF1Q12488 RTC3YHR087W 336 nt13.85□□□□□ -0.19
PSF1Q12488 ATS1YAL020C 1002 nt13.76□□□□□ -0.21
PSF1Q12488 PET122YER153C 765 nt13.74□□□□□ -0.21
PSF1Q12488 SCJ1YMR214W 1134 nt13.74□□□□□ -0.21
PSF1Q12488 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.7□□□□□ -0.22
PSF1Q12488 SCR1SCR1 522 nt13.63□□□□□ -0.23
PSF1Q12488 SSA3YBL075C 1950 nt13.53□□□□□ -0.24
PSF1Q12488 SHR5YOL110W 714 nt13.37□□□□□ -0.27
PSF1Q12488 RRN5YLR141W 1092 nt13.34□□□□□ -0.27
PSF1Q12488 YDJ1YNL064C 1230 nt13.28□□□□□ -0.28
PSF1Q12488 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.09□□□□□ -0.31
PSF1Q12488 RSB1YOR049C 1065 nt13.07□□□□□ -0.32
PSF1Q12488 URN1YPR152C 1398 nt12.98□□□□□ -0.33
PSF1Q12488 GAR1YHR089C 618 nt12.94□□□□□ -0.34
PSF1Q12488 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
PSF1Q12488 PUT4YOR348C 1884 nt12.91□□□□□ -0.34
PSF1Q12488 RPN10YHR200W 807 nt12.82□□□□□ -0.36
PSF1Q12488 OPI9YLR338W 858 nt12.8□□□□□ -0.36
PSF1Q12488 YNL208WYNL208W 600 nt12.79□□□□□ -0.36
PSF1Q12488 PST2YDR032C 597 nt12.75□□□□□ -0.37
PSF1Q12488 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
PSF1Q12488 ARE1YCR048W 1833 nt12.65□□□□□ -0.39
PSF1Q12488 TIR1YER011W 765 nt12.52□□□□□ -0.41
PSF1Q12488 POA1YBR022W 534 nt12.5□□□□□ -0.41
PSF1Q12488 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.47□□□□□ -0.41
PSF1Q12488 PUN1YLR414C 792 nt12.45□□□□□ -0.42
PSF1Q12488 YJR018WYJR018W 363 nt12.39□□□□□ -0.43
PSF1Q12488 SSA1YAL005C 1929 nt12.36□□□□□ -0.43
PSF1Q12488 BSC6YOL137W 1494 nt12.34□□□□□ -0.43
PSF1Q12488 PTC2YER089C 1395 nt12.26□□□□□ -0.45
PSF1Q12488 YKL097CYKL097C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
PSF1Q12488 SHU1YHL006C 453 nt12.21□□□□□ -0.45
PSF1Q12488 BUD23YCR047C 828 nt12.17□□□□□ -0.46
PSF1Q12488 YJR120WYJR120W 351 nt12.17□□□□□ -0.46
PSF1Q12488 RPP2BYDR382W 333 nt12.16□□□□□ -0.46
PSF1Q12488 NAB2YGL122C 1578 nt12.13□□□□□ -0.47
PSF1Q12488 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
PSF1Q12488 SPT5YML010W 3192 nt12.1□□□□□ -0.47
PSF1Q12488 SSA4YER103W 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
PSF1Q12488 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.99□□□□□ -0.49
PSF1Q12488 DAL1YIR027C 1383 nt11.97□□□□□ -0.49
PSF1Q12488 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
PSF1Q12488 WWM1YFL010C 636 nt11.95□□□□□ -0.5
PSF1Q12488 FIS1YIL065C 468 nt11.94□□□□□ -0.5
PSF1Q12488 YGR021WYGR021W 873 nt11.93□□□□□ -0.5
PSF1Q12488 BDH2YAL061W 1254 nt11.91□□□□□ -0.5
PSF1Q12488 FPR4YLR449W 1179 nt11.9□□□□□ -0.5
PSF1Q12488 HOM6YJR139C 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
PSF1Q12488 PHO4YFR034C 939 nt11.84□□□□□ -0.51
PSF1Q12488 YBL100CYBL100C 315 nt11.83□□□□□ -0.52
PSF1Q12488 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.8□□□□□ -0.52
PSF1Q12488 MNP1YGL068W 585 nt11.78□□□□□ -0.52
PSF1Q12488 LSM3YLR438C-A 270 nt11.77□□□□□ -0.53
PSF1Q12488 YOR139CYOR139C 393 nt11.73□□□□□ -0.53
PSF1Q12488 RKM5YLR137W 1104 nt11.7□□□□□ -0.54
PSF1Q12488 FUN26YAL022C 1554 nt11.69□□□□□ -0.54
PSF1Q12488 TRM9YML014W 840 nt11.68□□□□□ -0.54
PSF1Q12488 NPL3YDR432W 1245 nt11.66□□□□□ -0.54
PSF1Q12488 YOL037CYOL037C 354 nt11.64□□□□□ -0.55
PSF1Q12488 MEP2YNL142W 1500 nt11.63□□□□□ -0.55
PSF1Q12488 YPS1YLR120C 1710 nt11.62□□□□□ -0.55
PSF1Q12488 BDF1YLR399C 2061 nt11.61□□□□□ -0.55
PSF1Q12488 CCT6YDR188W 1641 nt11.58□□□□□ -0.56
PSF1Q12488 YDR095CYDR095C 411 nt11.55□□□□□ -0.56
PSF1Q12488 ALF1YNL148C 765 nt11.53□□□□□ -0.56
PSF1Q12488 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.49□□□□□ -0.57
PSF1Q12488 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.49□□□□□ -0.57
PSF1Q12488 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.48□□□□□ -0.57
PSF1Q12488 DCW1YKL046C 1350 nt11.45□□□□□ -0.58
PSF1Q12488 TAT1YBR069C 1860 nt11.44□□□□□ -0.58
PSF1Q12488 SIS1YNL007C 1059 nt11.36□□□□□ -0.59
PSF1Q12488 YLR281CYLR281C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
PSF1Q12488 RPP2AYOL039W 321 nt11.34□□□□□ -0.59
PSF1Q12488 WHI5YOR083W 888 nt11.3□□□□□ -0.6
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