RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	VPS3	P23643	1011 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	POP8	P38208	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MED8	P38304	223 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	AVT6	P40074	448 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	GLG2	P47011	380 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	NBP35	P52920	328 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	USE1	P53146	245 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SDC1	Q03323	175 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	MRX8	Q05473	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	PEX10	Q05568	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	SNF8	Q12483	233 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MGR3	YMR115W	JEN1	P36035	616 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CAB3	P36076	571 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PHO89	P38361	574 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	KRE28	Q04431	385 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YLR283W	Q05867	314 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YDL144C	Q07589	356 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CSM4	Q08955	156 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YPS3	Q12303	508 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CKA2	P19454	339 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YGR067C	P53243	804 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
MGR3	YMR115W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	NTE1	Q04958	1679 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ARG80	P07249	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PHO80	P20052	293 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	MRPL25	P23369	157 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	DOA4	P32571	926 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	MSS2	P40990	351 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	OTU1	P43558	301 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	NNT1	Q05874	261 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PLB3	Q08108	686 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PPA2	P28239	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RPE1	P46969	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	HOC1	P47124	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	GIS3	Q12418	502 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	POX1	P13711	748 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CPT1	P17898	393 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ERG2	P32352	222 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	FMT1	P32785	401 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YHL049C	P38722	271 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YJR079W	P47126	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	IGO1	P53897	168 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CTF19	Q02732	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RFM1	Q12192	310 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YCT1	Q12235	531 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	UFD4	P33202	1483 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YPK9	Q12697	1472 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	MER1	P16523	270 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RAD51	P25454	400 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SYS1	P41544	203 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	UFD1	P53044	361 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CGR1	P53188	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PGA2	P53903	129 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ATG17	Q06410	417 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SGE1	P33335	543 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	HMT1	P38074	348 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YBR096W	P38256	230 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	FZO1	P38297	855 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ARN2	P38724	620 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	GIM3	P53900	129 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	DXO1	Q06349	442 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	JIP3	O13555	125 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	CUP2	P15315	225 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	MIC12	P38341	106 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	RAD17	P48581	401 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	ZRG17	P53735	605 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MGR3	YMR115W	SPO77	Q06134	477 aa		3.03	□□□□□ -1.92

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