Protein–RNA interactions for Protein: P46969

RPE1, Ribulose-phosphate 3-epimerase, yeastyeast

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPE1P46969 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.56■□□□□ 0.56
RPE1P46969 NSR1YGR159C 1245 nt18.33■□□□□ 0.52
RPE1P46969 NOP1YDL014W 984 nt18.08■□□□□ 0.48
RPE1P46969 YKL036CYKL036C 393 nt16.8■□□□□ 0.28
RPE1P46969 MDJ1YFL016C 1536 nt16.29■□□□□ 0.2
RPE1P46969 Q0297Q0297 156 nt15.87■□□□□ 0.13
RPE1P46969 SRX1YKL086W 384 nt15.81■□□□□ 0.12
RPE1P46969 YJL027CYJL027C 417 nt15.71■□□□□ 0.11
RPE1P46969 SCS3YGL126W 1143 nt15.35■□□□□ 0.05
RPE1P46969 YCR051WYCR051W 669 nt15□□□□□ -0.01
RPE1P46969 YOL085CYOL085C 342 nt14.55□□□□□ -0.08
RPE1P46969 DBP2YNL112W 1641 nt14.36□□□□□ -0.11
RPE1P46969 PKP1YIL042C 1185 nt14.32□□□□□ -0.12
RPE1P46969 RPP1BYDL130W 321 nt14.24□□□□□ -0.13
RPE1P46969 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.23□□□□□ -0.13
RPE1P46969 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
RPE1P46969 YBR190WYBR190W 312 nt13.99□□□□□ -0.17
RPE1P46969 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
RPE1P46969 ATS1YAL020C 1002 nt13.76□□□□□ -0.21
RPE1P46969 SCJ1YMR214W 1134 nt13.74□□□□□ -0.21
RPE1P46969 RTC3YHR087W 336 nt13.72□□□□□ -0.21
RPE1P46969 PET122YER153C 765 nt13.6□□□□□ -0.23
RPE1P46969 RVS167YDR388W 1449 nt13.53□□□□□ -0.24
RPE1P46969 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.5□□□□□ -0.25
RPE1P46969 SCR1SCR1 522 nt13.48□□□□□ -0.25
RPE1P46969 RRN5YLR141W 1092 nt13.22□□□□□ -0.29
RPE1P46969 SHR5YOL110W 714 nt13.08□□□□□ -0.32
RPE1P46969 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
RPE1P46969 YDJ1YNL064C 1230 nt13.05□□□□□ -0.32
RPE1P46969 RSB1YOR049C 1065 nt12.98□□□□□ -0.33
RPE1P46969 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.96□□□□□ -0.33
RPE1P46969 GAR1YHR089C 618 nt12.75□□□□□ -0.37
RPE1P46969 PST2YDR032C 597 nt12.73□□□□□ -0.37
RPE1P46969 ARE1YCR048W 1833 nt12.68□□□□□ -0.38
RPE1P46969 DEP1YAL013W 1218 nt12.68□□□□□ -0.38
RPE1P46969 URN1YPR152C 1398 nt12.65□□□□□ -0.38
RPE1P46969 POA1YBR022W 534 nt12.63□□□□□ -0.39
RPE1P46969 SAH1YER043C 1350 nt12.58□□□□□ -0.4
RPE1P46969 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.56□□□□□ -0.4
RPE1P46969 OPI9YLR338W 858 nt12.52□□□□□ -0.41
RPE1P46969 YNL208WYNL208W 600 nt12.49□□□□□ -0.41
RPE1P46969 RPN10YHR200W 807 nt12.47□□□□□ -0.41
RPE1P46969 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.41
RPE1P46969 TIR1YER011W 765 nt12.31□□□□□ -0.44
RPE1P46969 YKL097CYKL097C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
RPE1P46969 BUD23YCR047C 828 nt12.26□□□□□ -0.45
RPE1P46969 SHU1YHL006C 453 nt12.18□□□□□ -0.46
RPE1P46969 PUN1YLR414C 792 nt12.18□□□□□ -0.46
RPE1P46969 SSA1YAL005C 1929 nt12.14□□□□□ -0.47
RPE1P46969 SPT5YML010W 3192 nt12.13□□□□□ -0.47
RPE1P46969 PTC2YER089C 1395 nt12.12□□□□□ -0.47
RPE1P46969 YJR018WYJR018W 363 nt12.07□□□□□ -0.48
RPE1P46969 NAB2YGL122C 1578 nt12.01□□□□□ -0.49
RPE1P46969 SSA4YER103W 1929 nt12□□□□□ -0.49
RPE1P46969 SRB2YHR041C 633 nt11.97□□□□□ -0.49
RPE1P46969 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.96□□□□□ -0.49
RPE1P46969 YJR120WYJR120W 351 nt11.92□□□□□ -0.5
RPE1P46969 RPP2BYDR382W 333 nt11.86□□□□□ -0.51
RPE1P46969 WWM1YFL010C 636 nt11.79□□□□□ -0.52
RPE1P46969 FIS1YIL065C 468 nt11.79□□□□□ -0.52
RPE1P46969 FPR4YLR449W 1179 nt11.79□□□□□ -0.52
RPE1P46969 YOR139CYOR139C 393 nt11.78□□□□□ -0.52
RPE1P46969 DAL1YIR027C 1383 nt11.77□□□□□ -0.53
RPE1P46969 YGR021WYGR021W 873 nt11.76□□□□□ -0.53
RPE1P46969 HOM6YJR139C 1080 nt11.73□□□□□ -0.53
RPE1P46969 MEP2YNL142W 1500 nt11.73□□□□□ -0.53
RPE1P46969 PAC11YDR488C 1602 nt11.71□□□□□ -0.53
RPE1P46969 MNP1YGL068W 585 nt11.7□□□□□ -0.54
RPE1P46969 PHO4YFR034C 939 nt11.66□□□□□ -0.54
RPE1P46969 INM2YDR287W 879 nt11.64□□□□□ -0.55
RPE1P46969 NPL3YDR432W 1245 nt11.64□□□□□ -0.55
RPE1P46969 BDH2YAL061W 1254 nt11.64□□□□□ -0.55
RPE1P46969 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.6□□□□□ -0.55
RPE1P46969 YPS1YLR120C 1710 nt11.58□□□□□ -0.56
RPE1P46969 RKM5YLR137W 1104 nt11.56□□□□□ -0.56
RPE1P46969 BDF1YLR399C 2061 nt11.55□□□□□ -0.56
RPE1P46969 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.54□□□□□ -0.56
RPE1P46969 YOL037CYOL037C 354 nt11.54□□□□□ -0.56
RPE1P46969 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
RPE1P46969 YBL100CYBL100C 315 nt11.53□□□□□ -0.56
RPE1P46969 NVJ2YPR091C 2313 nt11.52□□□□□ -0.57
RPE1P46969 LSM3YLR438C-A 270 nt11.51□□□□□ -0.57
RPE1P46969 YDR095CYDR095C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
RPE1P46969 FUN26YAL022C 1554 nt11.41□□□□□ -0.58
RPE1P46969 TAT1YBR069C 1860 nt11.4□□□□□ -0.58
RPE1P46969 TRM9YML014W 840 nt11.4□□□□□ -0.58
RPE1P46969 YMR090WYMR090W 684 nt11.38□□□□□ -0.59
RPE1P46969 EMI2YDR516C 1503 nt11.38□□□□□ -0.59
RPE1P46969 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.31□□□□□ -0.6
RPE1P46969 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.31□□□□□ -0.6
RPE1P46969 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.31□□□□□ -0.6
RPE1P46969 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.31□□□□□ -0.6
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