Protein–RNA interactions for Protein: Q12235

YCT1, High affinity cysteine transporter, yeastyeast

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCT1Q12235 NSR1YGR159C 1245 nt17■□□□□ 0.31
YCT1Q12235 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.73■□□□□ 0.27
YCT1Q12235 NOP1YDL014W 984 nt16.11■□□□□ 0.17
YCT1Q12235 MDJ1YFL016C 1536 nt15.49■□□□□ 0.07
YCT1Q12235 YKL036CYKL036C 393 nt14.43□□□□□ -0.1
YCT1Q12235 YJL027CYJL027C 417 nt14.29□□□□□ -0.12
YCT1Q12235 SRX1YKL086W 384 nt14.04□□□□□ -0.16
YCT1Q12235 Q0297Q0297 156 nt13.92□□□□□ -0.18
YCT1Q12235 DBP2YNL112W 1641 nt13.51□□□□□ -0.25
YCT1Q12235 YBR190WYBR190W 312 nt13.35□□□□□ -0.27
YCT1Q12235 YCR051WYCR051W 669 nt13.3□□□□□ -0.28
YCT1Q12235 RTC3YHR087W 336 nt13.04□□□□□ -0.32
YCT1Q12235 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
YCT1Q12235 SCS3YGL126W 1143 nt12.88□□□□□ -0.35
YCT1Q12235 SSA3YBL075C 1950 nt12.82□□□□□ -0.36
YCT1Q12235 CCC1YLR220W 969 nt12.82□□□□□ -0.36
YCT1Q12235 RVS167YDR388W 1449 nt12.68□□□□□ -0.38
YCT1Q12235 RPP1BYDL130W 321 nt12.5□□□□□ -0.41
YCT1Q12235 YOL085CYOL085C 342 nt12.49□□□□□ -0.41
YCT1Q12235 SCJ1YMR214W 1134 nt12.46□□□□□ -0.41
YCT1Q12235 PUT4YOR348C 1884 nt12.44□□□□□ -0.42
YCT1Q12235 PKP1YIL042C 1185 nt12.35□□□□□ -0.43
YCT1Q12235 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YCT1Q12235 SHR5YOL110W 714 nt12.11□□□□□ -0.47
YCT1Q12235 ARE1YCR048W 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
YCT1Q12235 URN1YPR152C 1398 nt12.03□□□□□ -0.48
YCT1Q12235 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
YCT1Q12235 PET122YER153C 765 nt11.98□□□□□ -0.49
YCT1Q12235 SAH1YER043C 1350 nt11.97□□□□□ -0.49
YCT1Q12235 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.94□□□□□ -0.5
YCT1Q12235 OPI9YLR338W 858 nt11.94□□□□□ -0.5
YCT1Q12235 DEP1YAL013W 1218 nt11.89□□□□□ -0.51
YCT1Q12235 BSC6YOL137W 1494 nt11.84□□□□□ -0.51
YCT1Q12235 RPN10YHR200W 807 nt11.79□□□□□ -0.52
YCT1Q12235 SCR1SCR1 522 nt11.78□□□□□ -0.52
YCT1Q12235 YDJ1YNL064C 1230 nt11.73□□□□□ -0.53
YCT1Q12235 YNL208WYNL208W 600 nt11.68□□□□□ -0.54
YCT1Q12235 BUD23YCR047C 828 nt11.63□□□□□ -0.55
YCT1Q12235 PUN1YLR414C 792 nt11.61□□□□□ -0.55
YCT1Q12235 RRN5YLR141W 1092 nt11.59□□□□□ -0.55
YCT1Q12235 SPT5YML010W 3192 nt11.57□□□□□ -0.56
YCT1Q12235 GAR1YHR089C 618 nt11.53□□□□□ -0.56
YCT1Q12235 PTC2YER089C 1395 nt11.53□□□□□ -0.56
YCT1Q12235 YJR018WYJR018W 363 nt11.45□□□□□ -0.58
YCT1Q12235 NAB2YGL122C 1578 nt11.45□□□□□ -0.58
YCT1Q12235 ATS1YAL020C 1002 nt11.4□□□□□ -0.58
YCT1Q12235 SSA4YER103W 1929 nt11.4□□□□□ -0.58
YCT1Q12235 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.36□□□□□ -0.59
YCT1Q12235 RSB1YOR049C 1065 nt11.24□□□□□ -0.61
YCT1Q12235 FIS1YIL065C 468 nt11.22□□□□□ -0.61
YCT1Q12235 DAL1YIR027C 1383 nt11.22□□□□□ -0.61
YCT1Q12235 FPR4YLR449W 1179 nt11.19□□□□□ -0.62
YCT1Q12235 TIR1YER011W 765 nt11.17□□□□□ -0.62
YCT1Q12235 MEP2YNL142W 1500 nt11.17□□□□□ -0.62
YCT1Q12235 RPP2BYDR382W 333 nt11.14□□□□□ -0.63
YCT1Q12235 YJR120WYJR120W 351 nt11.13□□□□□ -0.63
YCT1Q12235 INM2YDR287W 879 nt11.11□□□□□ -0.63
YCT1Q12235 SSA1YAL005C 1929 nt11.1□□□□□ -0.63
YCT1Q12235 PHO4YFR034C 939 nt11.1□□□□□ -0.63
YCT1Q12235 YPS1YLR120C 1710 nt11.04□□□□□ -0.64
YCT1Q12235 BDF1YLR399C 2061 nt10.99□□□□□ -0.65
YCT1Q12235 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.96□□□□□ -0.65
YCT1Q12235 DCW1YKL046C 1350 nt10.95□□□□□ -0.66
YCT1Q12235 YBL100CYBL100C 315 nt10.93□□□□□ -0.66
YCT1Q12235 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
YCT1Q12235 YDR095CYDR095C 411 nt10.9□□□□□ -0.66
YCT1Q12235 TAT1YBR069C 1860 nt10.85□□□□□ -0.67
YCT1Q12235 YMR090WYMR090W 684 nt10.83□□□□□ -0.68
YCT1Q12235 EMI2YDR516C 1503 nt10.83□□□□□ -0.68
YCT1Q12235 BDH2YAL061W 1254 nt10.81□□□□□ -0.68
YCT1Q12235 SRB2YHR041C 633 nt10.79□□□□□ -0.68
YCT1Q12235 FUN26YAL022C 1554 nt10.77□□□□□ -0.68
YCT1Q12235 YBR220CYBR220C 1683 nt10.76□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.75□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.75□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 ALF1YNL148C 765 nt10.75□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 PAC11YDR488C 1602 nt10.73□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 YDL221WYDL221W 552 nt10.71□□□□□ -0.69
YCT1Q12235 RPP2AYOL039W 321 nt10.7□□□□□ -0.7
YCT1Q12235 TRM9YML014W 840 nt10.69□□□□□ -0.7
YCT1Q12235 PTP1YDL230W 1008 nt10.66□□□□□ -0.7
YCT1Q12235 SDH1YKL148C 1923 nt10.66□□□□□ -0.7
YCT1Q12235 CAC2YML102W 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
YCT1Q12235 PST2YDR032C 597 nt10.62□□□□□ -0.71
YCT1Q12235 CCT6YDR188W 1641 nt10.6□□□□□ -0.71
YCT1Q12235 LSM3YLR438C-A 270 nt10.59□□□□□ -0.71
YCT1Q12235 WWM1YFL010C 636 nt10.58□□□□□ -0.72
YCT1Q12235 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.57□□□□□ -0.72
YCT1Q12235 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.57□□□□□ -0.72
YCT1Q12235 SIS1YNL007C 1059 nt10.55□□□□□ -0.72
YCT1Q12235 SCC4YER147C 1875 nt10.54□□□□□ -0.72
YCT1Q12235 NVJ2YPR091C 2313 nt10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.1 ms