Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 NSR1YGR159C 1245 nt19.48■□□□□ 0.71
SNF8Q12483 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.36■□□□□ 0.69
SNF8Q12483 NOP1YDL014W 984 nt18.72■□□□□ 0.59
SNF8Q12483 MDJ1YFL016C 1536 nt17.52■□□□□ 0.39
SNF8Q12483 YKL036CYKL036C 393 nt17.07■□□□□ 0.32
SNF8Q12483 SRX1YKL086W 384 nt16.39■□□□□ 0.21
SNF8Q12483 Q0297Q0297 156 nt16.36■□□□□ 0.21
SNF8Q12483 YJL027CYJL027C 417 nt16.12■□□□□ 0.17
SNF8Q12483 YCR051WYCR051W 669 nt15.49■□□□□ 0.07
SNF8Q12483 DBP2YNL112W 1641 nt15.45■□□□□ 0.06
SNF8Q12483 SCS3YGL126W 1143 nt15.43■□□□□ 0.06
SNF8Q12483 YBR190WYBR190W 312 nt15□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNF8Q12483 YOL085CYOL085C 342 nt14.82□□□□□ -0.04
SNF8Q12483 CCC1YLR220W 969 nt14.76□□□□□ -0.05
SNF8Q12483 RPP1BYDL130W 321 nt14.66□□□□□ -0.06
SNF8Q12483 RTC3YHR087W 336 nt14.59□□□□□ -0.07
SNF8Q12483 PKP1YIL042C 1185 nt14.59□□□□□ -0.07
SNF8Q12483 RVS167YDR388W 1449 nt14.39□□□□□ -0.11
SNF8Q12483 SCJ1YMR214W 1134 nt14.34□□□□□ -0.11
SNF8Q12483 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.07□□□□□ -0.16
SNF8Q12483 PET122YER153C 765 nt14.04□□□□□ -0.16
SNF8Q12483 SHR5YOL110W 714 nt13.87□□□□□ -0.19
SNF8Q12483 PUT4YOR348C 1884 nt13.83□□□□□ -0.2
SNF8Q12483 SCR1SCR1 522 nt13.78□□□□□ -0.2
SNF8Q12483 ATS1YAL020C 1002 nt13.74□□□□□ -0.21
SNF8Q12483 YDJ1YNL064C 1230 nt13.63□□□□□ -0.23
SNF8Q12483 URN1YPR152C 1398 nt13.61□□□□□ -0.23
SNF8Q12483 RRN5YLR141W 1092 nt13.6□□□□□ -0.23
SNF8Q12483 DEP1YAL013W 1218 nt13.53□□□□□ -0.24
SNF8Q12483 ARE1YCR048W 1833 nt13.5□□□□□ -0.25
SNF8Q12483 OPI9YLR338W 858 nt13.49□□□□□ -0.25
SNF8Q12483 SSA3YBL075C 1950 nt13.46□□□□□ -0.25
SNF8Q12483 SAH1YER043C 1350 nt13.45□□□□□ -0.26
SNF8Q12483 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.35□□□□□ -0.27
SNF8Q12483 POA1YBR022W 534 nt13.34□□□□□ -0.27
SNF8Q12483 RPN10YHR200W 807 nt13.33□□□□□ -0.28
SNF8Q12483 GAR1YHR089C 618 nt13.32□□□□□ -0.28
SNF8Q12483 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.3□□□□□ -0.28
SNF8Q12483 YNL208WYNL208W 600 nt13.3□□□□□ -0.28
SNF8Q12483 RSB1YOR049C 1065 nt13.22□□□□□ -0.29
SNF8Q12483 BSC6YOL137W 1494 nt13.11□□□□□ -0.31
SNF8Q12483 PUN1YLR414C 792 nt13.07□□□□□ -0.32
SNF8Q12483 YJR018WYJR018W 363 nt12.97□□□□□ -0.33
SNF8Q12483 PTC2YER089C 1395 nt12.95□□□□□ -0.34
SNF8Q12483 BUD23YCR047C 828 nt12.93□□□□□ -0.34
SNF8Q12483 TIR1YER011W 765 nt12.9□□□□□ -0.34
SNF8Q12483 NAB2YGL122C 1578 nt12.82□□□□□ -0.36
SNF8Q12483 SSA1YAL005C 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
SNF8Q12483 YJR120WYJR120W 351 nt12.8□□□□□ -0.36
SNF8Q12483 PST2YDR032C 597 nt12.78□□□□□ -0.36
SNF8Q12483 SPT5YML010W 3192 nt12.76□□□□□ -0.37
SNF8Q12483 FIS1YIL065C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
SNF8Q12483 RPP2BYDR382W 333 nt12.62□□□□□ -0.39
SNF8Q12483 DAL1YIR027C 1383 nt12.61□□□□□ -0.39
SNF8Q12483 SRB2YHR041C 633 nt12.6□□□□□ -0.39
SNF8Q12483 INM2YDR287W 879 nt12.53□□□□□ -0.4
SNF8Q12483 FPR4YLR449W 1179 nt12.52□□□□□ -0.41
SNF8Q12483 PHO4YFR034C 939 nt12.5□□□□□ -0.41
SNF8Q12483 YBL100CYBL100C 315 nt12.38□□□□□ -0.43
SNF8Q12483 BDH2YAL061W 1254 nt12.37□□□□□ -0.43
SNF8Q12483 YPS1YLR120C 1710 nt12.35□□□□□ -0.43
SNF8Q12483 MEP2YNL142W 1500 nt12.34□□□□□ -0.43
SNF8Q12483 SSA4YER103W 1929 nt12.34□□□□□ -0.43
SNF8Q12483 SHU1YHL006C 453 nt12.31□□□□□ -0.44
SNF8Q12483 WWM1YFL010C 636 nt12.3□□□□□ -0.44
SNF8Q12483 YDR095CYDR095C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
SNF8Q12483 FUN26YAL022C 1554 nt12.24□□□□□ -0.45
SNF8Q12483 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.18□□□□□ -0.46
SNF8Q12483 LSM3YLR438C-A 270 nt12.17□□□□□ -0.46
SNF8Q12483 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.16□□□□□ -0.46
SNF8Q12483 YGR021WYGR021W 873 nt12.15□□□□□ -0.46
SNF8Q12483 DCW1YKL046C 1350 nt12.15□□□□□ -0.46
SNF8Q12483 TRM9YML014W 840 nt12.14□□□□□ -0.47
SNF8Q12483 HOM6YJR139C 1080 nt12.13□□□□□ -0.47
SNF8Q12483 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.11□□□□□ -0.47
SNF8Q12483 YKL097CYKL097C 411 nt12.11□□□□□ -0.47
SNF8Q12483 CCT6YDR188W 1641 nt12.08□□□□□ -0.48
SNF8Q12483 ALF1YNL148C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
SNF8Q12483 PTP1YDL230W 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
SNF8Q12483 MNP1YGL068W 585 nt12.02□□□□□ -0.49
SNF8Q12483 RPP2AYOL039W 321 nt11.99□□□□□ -0.49
SNF8Q12483 EMI2YDR516C 1503 nt11.97□□□□□ -0.49
SNF8Q12483 SIS1YNL007C 1059 nt11.96□□□□□ -0.49
SNF8Q12483 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.95□□□□□ -0.5
SNF8Q12483 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.95□□□□□ -0.5
SNF8Q12483 RKM5YLR137W 1104 nt11.94□□□□□ -0.5
SNF8Q12483 CAC2YML102W 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
SNF8Q12483 BDF1YLR399C 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
SNF8Q12483 YDL221WYDL221W 552 nt11.88□□□□□ -0.51
SNF8Q12483 YMR090WYMR090W 684 nt11.86□□□□□ -0.51
SNF8Q12483 YBR220CYBR220C 1683 nt11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms