RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A UTP10P42945 1769 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL9AP05738 191 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GPA2P10823 449 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DBR1P24309 405 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RRP7P25368 297 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPS0AP32905 252 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A LTV1P34078 463 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL9BP51401 191 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PXR1P53335 271 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A NAT4Q04751 285 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DBP9Q06218 594 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YOR012WQ12351 137 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TUS1Q06412 1307 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GPI12P23797 304 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DPB2P24482 689 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A NIP1P32497 812 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A UIP5P36137 443 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ECM4P36156 370 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A LIN1P38852 340 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MLH1P38920 769 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PRP39P39682 629 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YFR045WP43617 309 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SAY1P53324 424 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A IRC4Q03036 179 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A EBS1Q03466 884 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A URC2Q04411 772 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A VPS68Q12016 184 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MSP1P28737 362 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A COT1P32798 439 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TRM7P38238 310 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YBR219CP38317 127 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SOK1P40317 901 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YGR219WP53307 113 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RVB1Q03940 463 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPN9Q04062 393 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TRM10Q12400 293 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YOL159C-AQ3E769 90 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DET1Q99288 334 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SPT7P35177 1332 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GRR1P24814 1151 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YOR062CP36025 268 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.25□□□□□ -2.45not detected
YPL060C-AYPL060C-A PIR5P46999 287 aa-0.25□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SGE1P33335 543 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PET8P38921 284 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YGR026WP53217 278 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YDR209CQ03480 137 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SNX41Q04053 625 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GAL3P13045 520 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A OSM1P21375 501 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A STN1P38960 494 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A EOS1P53938 366 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GTO3Q04806 366 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MDM30Q05930 598 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PAR32Q12515 295 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YER188C-AP0C0V2 99 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MDL1P33310 695 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MRPL3P36516 390 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MMS21P38632 267 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPA34P47006 233 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RNH203Q12338 110 aa-0.26□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.27□□□□□ -2.45not detected
YPL060C-AYPL060C-A NSP1P14907 823 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MRPS28P21771 286 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PRE7P23724 241 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TVP38P36164 337 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GLE2P40066 365 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A AYR1P40471 297 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A BMT5P40493 336 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A EFM4P40516 257 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YOL160WQ08321 113 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A NUM1Q00402 2748 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A FMP49A0A023PZB3 126 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPS3P05750 240 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MRPS5P33759 307 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YKL187CP34231 750 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TRS20P38334 175 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A OSH6Q02201 448 aa-0.27□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL12BP0CX54 165 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MRP1P10662 321 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PDX1P16451 410 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GOT1Q03554 138 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TVP15Q03860 143 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RDL2Q08742 149 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPC40P07703 335 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CKI1P20485 582 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ACB1P31787 87 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A AGE2P40529 298 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YFL064CP43540 174 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YJL016WP47072 561 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TAP42Q04372 366 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CSM3Q04659 317 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YPL272CQ08984 517 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RCN1P36054 211 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YER084WP40057 128 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL13BP40212 199 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
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