Protein–RNA interactions for Protein: Q12338

RNH203, Ribonuclease H2 subunit C, yeastyeast

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNH203Q12338 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.64■□□□□ 0.41
RNH203Q12338 NSR1YGR159C 1245 nt17.56■□□□□ 0.4
RNH203Q12338 NOP1YDL014W 984 nt17.22■□□□□ 0.35
RNH203Q12338 YKL036CYKL036C 393 nt15.96■□□□□ 0.15
RNH203Q12338 MDJ1YFL016C 1536 nt15.47■□□□□ 0.07
RNH203Q12338 Q0297Q0297 156 nt15.16■□□□□ 0.02
RNH203Q12338 SRX1YKL086W 384 nt15.09■□□□□ 0.01
RNH203Q12338 YJL027CYJL027C 417 nt14.87□□□□□ -0.03
RNH203Q12338 SCS3YGL126W 1143 nt14.56□□□□□ -0.08
RNH203Q12338 YCR051WYCR051W 669 nt14.22□□□□□ -0.13
RNH203Q12338 YOL085CYOL085C 342 nt13.83□□□□□ -0.2
RNH203Q12338 DBP2YNL112W 1641 nt13.79□□□□□ -0.2
RNH203Q12338 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
RNH203Q12338 RPP1BYDL130W 321 nt13.57□□□□□ -0.24
RNH203Q12338 PKP1YIL042C 1185 nt13.54□□□□□ -0.24
RNH203Q12338 CCC1YLR220W 969 nt13.35□□□□□ -0.27
RNH203Q12338 YBR190WYBR190W 312 nt13.23□□□□□ -0.29
RNH203Q12338 SCJ1YMR214W 1134 nt13.06□□□□□ -0.32
RNH203Q12338 ATS1YAL020C 1002 nt13.04□□□□□ -0.32
RNH203Q12338 PET122YER153C 765 nt12.93□□□□□ -0.34
RNH203Q12338 RVS167YDR388W 1449 nt12.91□□□□□ -0.34
RNH203Q12338 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.87□□□□□ -0.35
RNH203Q12338 RTC3YHR087W 336 nt12.83□□□□□ -0.36
RNH203Q12338 SCR1SCR1 522 nt12.79□□□□□ -0.36
RNH203Q12338 RRN5YLR141W 1092 nt12.56□□□□□ -0.4
RNH203Q12338 SHR5YOL110W 714 nt12.52□□□□□ -0.41
RNH203Q12338 YDJ1YNL064C 1230 nt12.5□□□□□ -0.41
RNH203Q12338 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.33□□□□□ -0.44
RNH203Q12338 RSB1YOR049C 1065 nt12.28□□□□□ -0.44
RNH203Q12338 PST2YDR032C 597 nt12.11□□□□□ -0.47
RNH203Q12338 GAR1YHR089C 618 nt12.11□□□□□ -0.47
RNH203Q12338 URN1YPR152C 1398 nt12.09□□□□□ -0.47
RNH203Q12338 DEP1YAL013W 1218 nt12.04□□□□□ -0.48
RNH203Q12338 PUT4YOR348C 1884 nt11.98□□□□□ -0.49
RNH203Q12338 OPI9YLR338W 858 nt11.96□□□□□ -0.49
RNH203Q12338 YNL208WYNL208W 600 nt11.94□□□□□ -0.5
RNH203Q12338 RPN10YHR200W 807 nt11.92□□□□□ -0.5
RNH203Q12338 SAH1YER043C 1350 nt11.8□□□□□ -0.52
RNH203Q12338 ARE1YCR048W 1833 nt11.77□□□□□ -0.52
RNH203Q12338 TIR1YER011W 765 nt11.74□□□□□ -0.53
RNH203Q12338 SSA1YAL005C 1929 nt11.6□□□□□ -0.55
RNH203Q12338 YKL097CYKL097C 411 nt11.6□□□□□ -0.55
RNH203Q12338 PUN1YLR414C 792 nt11.59□□□□□ -0.55
RNH203Q12338 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.57□□□□□ -0.56
RNH203Q12338 SHU1YHL006C 453 nt11.56□□□□□ -0.56
RNH203Q12338 YJR018WYJR018W 363 nt11.55□□□□□ -0.56
RNH203Q12338 POA1YBR022W 534 nt11.53□□□□□ -0.56
RNH203Q12338 YJR120WYJR120W 351 nt11.46□□□□□ -0.57
RNH203Q12338 SRB2YHR041C 633 nt11.43□□□□□ -0.58
RNH203Q12338 PTC2YER089C 1395 nt11.4□□□□□ -0.59
RNH203Q12338 RPP2BYDR382W 333 nt11.31□□□□□ -0.6
RNH203Q12338 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.3□□□□□ -0.6
RNH203Q12338 BSC6YOL137W 1494 nt11.3□□□□□ -0.6
RNH203Q12338 NAB2YGL122C 1578 nt11.27□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 BUD23YCR047C 828 nt11.25□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 Q0182Q0182 405 nt11.24□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 SSA3YBL075C 1950 nt11.23□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 WWM1YFL010C 636 nt11.22□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 YGR021WYGR021W 873 nt11.21□□□□□ -0.61
RNH203Q12338 HOM6YJR139C 1080 nt11.19□□□□□ -0.62
RNH203Q12338 YOR139CYOR139C 393 nt11.17□□□□□ -0.62
RNH203Q12338 INM2YDR287W 879 nt11.15□□□□□ -0.62
RNH203Q12338 FIS1YIL065C 468 nt11.15□□□□□ -0.62
RNH203Q12338 BDH2YAL061W 1254 nt11.15□□□□□ -0.62
RNH203Q12338 DAL1YIR027C 1383 nt11.14□□□□□ -0.63
RNH203Q12338 MNP1YGL068W 585 nt11.09□□□□□ -0.63
RNH203Q12338 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.08□□□□□ -0.64
RNH203Q12338 LSM3YLR438C-A 270 nt11.04□□□□□ -0.64
RNH203Q12338 PHO4YFR034C 939 nt11.02□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 YBL100CYBL100C 315 nt11.02□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 RKM5YLR137W 1104 nt11.01□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 FPR4YLR449W 1179 nt11□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 NPL3YDR432W 1245 nt10.99□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 YOL037CYOL037C 354 nt10.99□□□□□ -0.65
RNH203Q12338 FUN26YAL022C 1554 nt10.91□□□□□ -0.66
RNH203Q12338 TRM9YML014W 840 nt10.88□□□□□ -0.67
RNH203Q12338 SPT5YML010W 3192 nt10.85□□□□□ -0.67
RNH203Q12338 CCT6YDR188W 1641 nt10.84□□□□□ -0.67
RNH203Q12338 YPS1YLR120C 1710 nt10.81□□□□□ -0.68
RNH203Q12338 YDR095CYDR095C 411 nt10.78□□□□□ -0.68
RNH203Q12338 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.73□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.73□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.73□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.73□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.73□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 YLR281CYLR281C 468 nt10.72□□□□□ -0.69
RNH203Q12338 MOT3YMR070W 1473 nt10.69□□□□□ -0.7
RNH203Q12338 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.69□□□□□ -0.7
RNH203Q12338 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.69□□□□□ -0.7
RNH203Q12338 ALF1YNL148C 765 nt10.69□□□□□ -0.7
RNH203Q12338 WHI5YOR083W 888 nt10.65□□□□□ -0.7
RNH203Q12338 SIS1YNL007C 1059 nt10.63□□□□□ -0.71
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