Protein–RNA interactions for Protein: P40212

RPL13B, 60S ribosomal protein L13-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL13BP40212 NSR1YGR159C 1245 nt16.96■□□□□ 0.31
RPL13BP40212 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.62■□□□□ 0.25
RPL13BP40212 NOP1YDL014W 984 nt16.06■□□□□ 0.16
RPL13BP40212 MDJ1YFL016C 1536 nt15.41■□□□□ 0.06
RPL13BP40212 YJL027CYJL027C 417 nt14.29□□□□□ -0.12
RPL13BP40212 YKL036CYKL036C 393 nt14.29□□□□□ -0.12
RPL13BP40212 SRX1YKL086W 384 nt13.94□□□□□ -0.18
RPL13BP40212 Q0297Q0297 156 nt13.79□□□□□ -0.2
RPL13BP40212 DBP2YNL112W 1641 nt13.37□□□□□ -0.27
RPL13BP40212 YBR190WYBR190W 312 nt13.35□□□□□ -0.27
RPL13BP40212 YCR051WYCR051W 669 nt13.22□□□□□ -0.29
RPL13BP40212 RTC3YHR087W 336 nt13.08□□□□□ -0.32
RPL13BP40212 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RPL13BP40212 CCC1YLR220W 969 nt12.76□□□□□ -0.37
RPL13BP40212 RVS167YDR388W 1449 nt12.71□□□□□ -0.38
RPL13BP40212 SSA3YBL075C 1950 nt12.69□□□□□ -0.38
RPL13BP40212 SCS3YGL126W 1143 nt12.68□□□□□ -0.38
RPL13BP40212 RPP1BYDL130W 321 nt12.39□□□□□ -0.43
RPL13BP40212 PUT4YOR348C 1884 nt12.38□□□□□ -0.43
RPL13BP40212 YOL085CYOL085C 342 nt12.34□□□□□ -0.43
RPL13BP40212 SCJ1YMR214W 1134 nt12.31□□□□□ -0.44
RPL13BP40212 PKP1YIL042C 1185 nt12.2□□□□□ -0.46
RPL13BP40212 SHR5YOL110W 714 nt12.06□□□□□ -0.48
RPL13BP40212 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13BP40212 POA1YBR022W 534 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13BP40212 ARE1YCR048W 1833 nt12.01□□□□□ -0.49
RPL13BP40212 URN1YPR152C 1398 nt12□□□□□ -0.49
RPL13BP40212 SAH1YER043C 1350 nt11.93□□□□□ -0.5
RPL13BP40212 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.92□□□□□ -0.5
RPL13BP40212 OPI9YLR338W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
RPL13BP40212 PET122YER153C 765 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL13BP40212 RPN10YHR200W 807 nt11.84□□□□□ -0.51
RPL13BP40212 DEP1YAL013W 1218 nt11.83□□□□□ -0.52
RPL13BP40212 BSC6YOL137W 1494 nt11.83□□□□□ -0.52
RPL13BP40212 SCR1SCR1 522 nt11.74□□□□□ -0.53
RPL13BP40212 YNL208WYNL208W 600 nt11.67□□□□□ -0.54
RPL13BP40212 BUD23YCR047C 828 nt11.66□□□□□ -0.54
RPL13BP40212 YDJ1YNL064C 1230 nt11.65□□□□□ -0.54
RPL13BP40212 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
RPL13BP40212 PTC2YER089C 1395 nt11.53□□□□□ -0.56
RPL13BP40212 RRN5YLR141W 1092 nt11.48□□□□□ -0.57
RPL13BP40212 GAR1YHR089C 618 nt11.47□□□□□ -0.57
RPL13BP40212 NAB2YGL122C 1578 nt11.46□□□□□ -0.57
RPL13BP40212 SPT5YML010W 3192 nt11.45□□□□□ -0.58
RPL13BP40212 YJR018WYJR018W 363 nt11.44□□□□□ -0.58
RPL13BP40212 SSA4YER103W 1929 nt11.39□□□□□ -0.59
RPL13BP40212 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.23□□□□□ -0.61
RPL13BP40212 ATS1YAL020C 1002 nt11.22□□□□□ -0.61
RPL13BP40212 FPR4YLR449W 1179 nt11.22□□□□□ -0.61
RPL13BP40212 DAL1YIR027C 1383 nt11.21□□□□□ -0.61
RPL13BP40212 RPP2BYDR382W 333 nt11.18□□□□□ -0.62
RPL13BP40212 MEP2YNL142W 1500 nt11.15□□□□□ -0.62
RPL13BP40212 RSB1YOR049C 1065 nt11.15□□□□□ -0.62
RPL13BP40212 INM2YDR287W 879 nt11.14□□□□□ -0.63
RPL13BP40212 FIS1YIL065C 468 nt11.14□□□□□ -0.63
RPL13BP40212 TIR1YER011W 765 nt11.1□□□□□ -0.63
RPL13BP40212 PHO4YFR034C 939 nt11.07□□□□□ -0.64
RPL13BP40212 YPS1YLR120C 1710 nt11.01□□□□□ -0.65
RPL13BP40212 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11□□□□□ -0.65
RPL13BP40212 SSA1YAL005C 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
RPL13BP40212 YJR120WYJR120W 351 nt10.98□□□□□ -0.65
RPL13BP40212 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL13BP40212 BDF1YLR399C 2061 nt10.94□□□□□ -0.66
RPL13BP40212 YBL100CYBL100C 315 nt10.92□□□□□ -0.66
RPL13BP40212 DCW1YKL046C 1350 nt10.9□□□□□ -0.66
RPL13BP40212 YDR095CYDR095C 411 nt10.87□□□□□ -0.67
RPL13BP40212 EMI2YDR516C 1503 nt10.83□□□□□ -0.68
RPL13BP40212 TAT1YBR069C 1860 nt10.81□□□□□ -0.68
RPL13BP40212 ALF1YNL148C 765 nt10.8□□□□□ -0.68
RPL13BP40212 BDH2YAL061W 1254 nt10.77□□□□□ -0.69
RPL13BP40212 FUN26YAL022C 1554 nt10.74□□□□□ -0.69
RPL13BP40212 YBR220CYBR220C 1683 nt10.73□□□□□ -0.69
RPL13BP40212 TRM9YML014W 840 nt10.71□□□□□ -0.69
RPL13BP40212 YDL221WYDL221W 552 nt10.7□□□□□ -0.7
RPL13BP40212 RPP2AYOL039W 321 nt10.7□□□□□ -0.7
RPL13BP40212 SDH1YKL148C 1923 nt10.64□□□□□ -0.71
RPL13BP40212 PAC11YDR488C 1602 nt10.62□□□□□ -0.71
RPL13BP40212 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL13BP40212 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.61□□□□□ -0.71
RPL13BP40212 CAC2YML102W 1407 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 PTP1YDL230W 1008 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 SRB2YHR041C 633 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 LSM3YLR438C-A 270 nt10.58□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 YJL225CYJL225C 5277 nt10.57□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 CCT6YDR188W 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 SEC11YIR022W 504 nt10.55□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 SCC4YER147C 1875 nt10.54□□□□□ -0.72
RPL13BP40212 SIS1YNL007C 1059 nt10.52□□□□□ -0.73
RPL13BP40212 WWM1YFL010C 636 nt10.48□□□□□ -0.73
RPL13BP40212 PCH2YBR186W 1695 nt10.47□□□□□ -0.73
RPL13BP40212 PST2YDR032C 597 nt10.45□□□□□ -0.74
RPL13BP40212 IRC15YPL017C 1500 nt10.43□□□□□ -0.74
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