Protein–RNA interactions for Protein: P53307

YGR219W, Uncharacterized protein YGR219W, yeastyeast

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR219WP53307 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.16■□□□□ 0.18
YGR219WP53307 NSR1YGR159C 1245 nt16.1■□□□□ 0.17
YGR219WP53307 NOP1YDL014W 984 nt15.68■□□□□ 0.1
YGR219WP53307 MDJ1YFL016C 1536 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR219WP53307 YKL036CYKL036C 393 nt14.36□□□□□ -0.11
YGR219WP53307 SRX1YKL086W 384 nt13.66□□□□□ -0.22
YGR219WP53307 Q0297Q0297 156 nt13.64□□□□□ -0.23
YGR219WP53307 YJL027CYJL027C 417 nt13.41□□□□□ -0.26
YGR219WP53307 YCR051WYCR051W 669 nt13□□□□□ -0.33
YGR219WP53307 SCS3YGL126W 1143 nt12.99□□□□□ -0.33
YGR219WP53307 DBP2YNL112W 1641 nt12.65□□□□□ -0.38
YGR219WP53307 YOL085CYOL085C 342 nt12.43□□□□□ -0.42
YGR219WP53307 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 CCC1YLR220W 969 nt12.34□□□□□ -0.43
YGR219WP53307 YBR190WYBR190W 312 nt12.29□□□□□ -0.44
YGR219WP53307 PKP1YIL042C 1185 nt12.28□□□□□ -0.44
YGR219WP53307 RPP1BYDL130W 321 nt12.26□□□□□ -0.45
YGR219WP53307 RTC3YHR087W 336 nt12.07□□□□□ -0.48
YGR219WP53307 RVS167YDR388W 1449 nt11.95□□□□□ -0.5
YGR219WP53307 SCJ1YMR214W 1134 nt11.81□□□□□ -0.52
YGR219WP53307 PET122YER153C 765 nt11.72□□□□□ -0.53
YGR219WP53307 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.72□□□□□ -0.53
YGR219WP53307 SCR1SCR1 522 nt11.61□□□□□ -0.55
YGR219WP53307 ATS1YAL020C 1002 nt11.6□□□□□ -0.55
YGR219WP53307 SHR5YOL110W 714 nt11.48□□□□□ -0.57
YGR219WP53307 RRN5YLR141W 1092 nt11.39□□□□□ -0.59
YGR219WP53307 YDJ1YNL064C 1230 nt11.32□□□□□ -0.6
YGR219WP53307 URN1YPR152C 1398 nt11.23□□□□□ -0.61
YGR219WP53307 DEP1YAL013W 1218 nt11.22□□□□□ -0.61
YGR219WP53307 PUT4YOR348C 1884 nt11.19□□□□□ -0.62
YGR219WP53307 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.15□□□□□ -0.62
YGR219WP53307 RSB1YOR049C 1065 nt11.15□□□□□ -0.62
YGR219WP53307 GAR1YHR089C 618 nt11.12□□□□□ -0.63
YGR219WP53307 RPN10YHR200W 807 nt11.06□□□□□ -0.64
YGR219WP53307 OPI9YLR338W 858 nt11.06□□□□□ -0.64
YGR219WP53307 SSA3YBL075C 1950 nt11.05□□□□□ -0.64
YGR219WP53307 SAH1YER043C 1350 nt11.03□□□□□ -0.64
YGR219WP53307 YNL208WYNL208W 600 nt11.02□□□□□ -0.65
YGR219WP53307 ARE1YCR048W 1833 nt10.97□□□□□ -0.65
YGR219WP53307 POA1YBR022W 534 nt10.89□□□□□ -0.67
YGR219WP53307 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.87□□□□□ -0.67
YGR219WP53307 PUN1YLR414C 792 nt10.76□□□□□ -0.69
YGR219WP53307 PST2YDR032C 597 nt10.74□□□□□ -0.69
YGR219WP53307 TIR1YER011W 765 nt10.73□□□□□ -0.69
YGR219WP53307 YJR018WYJR018W 363 nt10.72□□□□□ -0.69
YGR219WP53307 PTC2YER089C 1395 nt10.65□□□□□ -0.7
YGR219WP53307 BUD23YCR047C 828 nt10.65□□□□□ -0.7
YGR219WP53307 BSC6YOL137W 1494 nt10.65□□□□□ -0.7
YGR219WP53307 SSA1YAL005C 1929 nt10.6□□□□□ -0.71
YGR219WP53307 NAB2YGL122C 1578 nt10.52□□□□□ -0.73
YGR219WP53307 RPP2BYDR382W 333 nt10.5□□□□□ -0.73
YGR219WP53307 YJR120WYJR120W 351 nt10.45□□□□□ -0.74
YGR219WP53307 FPR4YLR449W 1179 nt10.4□□□□□ -0.74
YGR219WP53307 SRB2YHR041C 633 nt10.37□□□□□ -0.75
YGR219WP53307 DAL1YIR027C 1383 nt10.36□□□□□ -0.75
YGR219WP53307 INM2YDR287W 879 nt10.35□□□□□ -0.75
YGR219WP53307 SHU1YHL006C 453 nt10.34□□□□□ -0.75
YGR219WP53307 FIS1YIL065C 468 nt10.32□□□□□ -0.76
YGR219WP53307 YKL097CYKL097C 411 nt10.31□□□□□ -0.76
YGR219WP53307 PHO4YFR034C 939 nt10.26□□□□□ -0.77
YGR219WP53307 WWM1YFL010C 636 nt10.25□□□□□ -0.77
YGR219WP53307 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.24□□□□□ -0.77
YGR219WP53307 BDH2YAL061W 1254 nt10.24□□□□□ -0.77
YGR219WP53307 YBL100CYBL100C 315 nt10.23□□□□□ -0.77
YGR219WP53307 YGR021WYGR021W 873 nt10.16□□□□□ -0.78
YGR219WP53307 SPT5YML010W 3192 nt10.13□□□□□ -0.79
YGR219WP53307 FUN26YAL022C 1554 nt10.09□□□□□ -0.79
YGR219WP53307 HOM6YJR139C 1080 nt10.09□□□□□ -0.79
YGR219WP53307 LSM3YLR438C-A 270 nt10.09□□□□□ -0.79
YGR219WP53307 TRM9YML014W 840 nt10.09□□□□□ -0.79
YGR219WP53307 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.08□□□□□ -0.8
YGR219WP53307 YPS1YLR120C 1710 nt10.07□□□□□ -0.8
YGR219WP53307 MNP1YGL068W 585 nt10.05□□□□□ -0.8
YGR219WP53307 ALF1YNL148C 765 nt10.02□□□□□ -0.81
YGR219WP53307 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.01□□□□□ -0.81
YGR219WP53307 MEP2YNL142W 1500 nt9.99□□□□□ -0.81
YGR219WP53307 YDR095CYDR095C 411 nt9.99□□□□□ -0.81
YGR219WP53307 RKM5YLR137W 1104 nt9.96□□□□□ -0.82
YGR219WP53307 CCT6YDR188W 1641 nt9.94□□□□□ -0.82
YGR219WP53307 SSA4YER103W 1929 nt9.94□□□□□ -0.82
YGR219WP53307 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.91□□□□□ -0.82
YGR219WP53307 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.91□□□□□ -0.82
YGR219WP53307 NPL3YDR432W 1245 nt9.87□□□□□ -0.83
YGR219WP53307 YOR139CYOR139C 393 nt9.87□□□□□ -0.83
YGR219WP53307 YOL037CYOL037C 354 nt9.84□□□□□ -0.83
YGR219WP53307 DCW1YKL046C 1350 nt9.84□□□□□ -0.83
YGR219WP53307 FPS1YLL043W 2010 nt9.83□□□□□ -0.84
YGR219WP53307 RPP2AYOL039W 321 nt9.83□□□□□ -0.84
YGR219WP53307 SIS1YNL007C 1059 nt9.8□□□□□ -0.84
YGR219WP53307 PTP1YDL230W 1008 nt9.75□□□□□ -0.85
YGR219WP53307 EMI2YDR516C 1503 nt9.73□□□□□ -0.85
YGR219WP53307 YMR090WYMR090W 684 nt9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms