Protein–RNA interactions for Protein: Q12400

TRM10, tRNA (guanine(9)-N1)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10Q12400 NSR1YGR159C 1245 nt18.54■□□□□ 0.56
TRM10Q12400 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.21■□□□□ 0.51
TRM10Q12400 NOP1YDL014W 984 nt17.47■□□□□ 0.39
TRM10Q12400 MDJ1YFL016C 1536 nt17.01■□□□□ 0.31
TRM10Q12400 YJL027CYJL027C 417 nt15.65■□□□□ 0.1
TRM10Q12400 YKL036CYKL036C 393 nt15.61■□□□□ 0.09
TRM10Q12400 SRX1YKL086W 384 nt15.25■□□□□ 0.03
TRM10Q12400 Q0297Q0297 156 nt15.09■□□□□ 0.01
TRM10Q12400 DBP2YNL112W 1641 nt14.79□□□□□ -0.04
TRM10Q12400 YBR190WYBR190W 312 nt14.63□□□□□ -0.07
TRM10Q12400 YCR051WYCR051W 669 nt14.46□□□□□ -0.09
TRM10Q12400 RTC3YHR087W 336 nt14.31□□□□□ -0.12
TRM10Q12400 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 SSA3YBL075C 1950 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM10Q12400 CCC1YLR220W 969 nt14.01□□□□□ -0.17
TRM10Q12400 SCS3YGL126W 1143 nt13.91□□□□□ -0.18
TRM10Q12400 RVS167YDR388W 1449 nt13.81□□□□□ -0.2
TRM10Q12400 PUT4YOR348C 1884 nt13.69□□□□□ -0.22
TRM10Q12400 SCJ1YMR214W 1134 nt13.62□□□□□ -0.23
TRM10Q12400 RPP1BYDL130W 321 nt13.55□□□□□ -0.24
TRM10Q12400 YOL085CYOL085C 342 nt13.52□□□□□ -0.25
TRM10Q12400 PKP1YIL042C 1185 nt13.42□□□□□ -0.26
TRM10Q12400 ARE1YCR048W 1833 nt13.28□□□□□ -0.28
TRM10Q12400 POA1YBR022W 534 nt13.26□□□□□ -0.29
TRM10Q12400 SHR5YOL110W 714 nt13.2□□□□□ -0.3
TRM10Q12400 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.18□□□□□ -0.3
TRM10Q12400 URN1YPR152C 1398 nt13.18□□□□□ -0.3
TRM10Q12400 SAH1YER043C 1350 nt13.16□□□□□ -0.3
TRM10Q12400 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.14□□□□□ -0.31
TRM10Q12400 OPI9YLR338W 858 nt13.09□□□□□ -0.31
TRM10Q12400 BSC6YOL137W 1494 nt13.06□□□□□ -0.32
TRM10Q12400 DEP1YAL013W 1218 nt13.04□□□□□ -0.32
TRM10Q12400 PET122YER153C 765 nt13.02□□□□□ -0.33
TRM10Q12400 RPN10YHR200W 807 nt12.86□□□□□ -0.35
TRM10Q12400 BUD23YCR047C 828 nt12.81□□□□□ -0.36
TRM10Q12400 SPT5YML010W 3192 nt12.78□□□□□ -0.36
TRM10Q12400 YNL208WYNL208W 600 nt12.75□□□□□ -0.37
TRM10Q12400 SCR1SCR1 522 nt12.75□□□□□ -0.37
TRM10Q12400 YDJ1YNL064C 1230 nt12.74□□□□□ -0.37
TRM10Q12400 PUN1YLR414C 792 nt12.71□□□□□ -0.37
TRM10Q12400 SSA4YER103W 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
TRM10Q12400 PTC2YER089C 1395 nt12.65□□□□□ -0.38
TRM10Q12400 RRN5YLR141W 1092 nt12.59□□□□□ -0.39
TRM10Q12400 GAR1YHR089C 618 nt12.57□□□□□ -0.4
TRM10Q12400 NAB2YGL122C 1578 nt12.56□□□□□ -0.4
TRM10Q12400 YJR018WYJR018W 363 nt12.53□□□□□ -0.4
TRM10Q12400 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.33□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 FIS1YIL065C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 MEP2YNL142W 1500 nt12.31□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 FPR4YLR449W 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 DAL1YIR027C 1383 nt12.29□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 ATS1YAL020C 1002 nt12.28□□□□□ -0.44
TRM10Q12400 YJR120WYJR120W 351 nt12.2□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 RSB1YOR049C 1065 nt12.19□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 PHO4YFR034C 939 nt12.18□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 TIR1YER011W 765 nt12.16□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 INM2YDR287W 879 nt12.15□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 RPP2BYDR382W 333 nt12.15□□□□□ -0.46
TRM10Q12400 YPS1YLR120C 1710 nt12.12□□□□□ -0.47
TRM10Q12400 SSA1YAL005C 1929 nt12.12□□□□□ -0.47
TRM10Q12400 DCW1YKL046C 1350 nt12.11□□□□□ -0.47
TRM10Q12400 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.06□□□□□ -0.48
TRM10Q12400 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.49
TRM10Q12400 YBL100CYBL100C 315 nt11.96□□□□□ -0.49
TRM10Q12400 YDR095CYDR095C 411 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM10Q12400 EMI2YDR516C 1503 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM10Q12400 YMR090WYMR090W 684 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM10Q12400 YBR220CYBR220C 1683 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM10Q12400 SRB2YHR041C 633 nt11.81□□□□□ -0.52
TRM10Q12400 YDL221WYDL221W 552 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM10Q12400 BDH2YAL061W 1254 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM10Q12400 FUN26YAL022C 1554 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM10Q12400 ALF1YNL148C 765 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM10Q12400 SDH1YKL148C 1923 nt11.75□□□□□ -0.53
TRM10Q12400 CAC2YML102W 1407 nt11.75□□□□□ -0.53
TRM10Q12400 RPP2AYOL039W 321 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM10Q12400 PTP1YDL230W 1008 nt11.73□□□□□ -0.53
TRM10Q12400 TRM9YML014W 840 nt11.68□□□□□ -0.54
TRM10Q12400 PAC11YDR488C 1602 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM10Q12400 SCC4YER147C 1875 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM10Q12400 IRC15YPL017C 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 PCH2YBR186W 1695 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 CCT6YDR188W 1641 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 SIS1YNL007C 1059 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 WWM1YFL010C 636 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 SEC11YIR022W 504 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 LSM3YLR438C-A 270 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM10Q12400 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
TRM10Q12400 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.52□□□□□ -0.57
TRM10Q12400 GIS3YLR094C 1509 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM10Q12400 GUT2YIL155C 1950 nt11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms