RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	CAF40	P53829	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	POM33	Q12164	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	EMP46	Q12396	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MEI5	P32489	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YIL024C	P40543	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SNO3	P43544	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	TIS11	P47977	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	BCH1	Q05029	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ECI1	Q05871	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ASR1	Q06834	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SAL1	D6W196	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YLR462W	O13556	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RBK1	P25332	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	IES6	P32617	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RIB1	P38066	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SCO2	P38072	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MIC12	P38341	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YHL049C	P38722	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MED6	P38782	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YER189W	P40104	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YFL064C	P43540	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MRPL50	P53724	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RIM13	Q03792	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	KRE28	Q04431	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MUM3	Q08750	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RGT2	Q12300	763 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	KAR9	P32526	644 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	CSE1	P33307	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPC17	P47076	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ORM1	P53224	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	VBA1	Q04301	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	PRM6	Q04705	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	DCR2	Q05924	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SPO77	Q06134	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	DDC1	Q08949	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	TAF10	Q12030	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MSB2	P32334	1306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MRPL6	P32904	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RCK2	P38623	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MTW1	P39731	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	AVT2	P39981	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SNZ3	P43545	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SNZ2	P53824	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	PIR3	Q03180	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	GPM2	Q12008	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	CRC1	Q12289	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SNF8	Q12483	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	REV1	P12689	985 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPO26	P20435	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ATO2	P32907	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	TKL2	P33315	681 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YKL063C	P35725	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YIL169C	P40442	995 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	CFD1	P40558	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RMR1	P53060	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	TAF9	Q05027	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ITR2	P30606	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YHR035W	P38769	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	JLP2	P40206	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	XBP1	P40489	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YIL054W	P40524	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	GDS1	P41913	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MDV1	P47025	714 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MTQ1	P53944	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	PHA2	P32452	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATR1	YML116W	NUP2	P32499	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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