Protein–RNA interactions for Protein: O13539

THP2, THO complex subunit THP2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2O13539 NSR1YGR159C 1245 nt19.48■□□□□ 0.71
THP2O13539 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.28■□□□□ 0.68
THP2O13539 NOP1YDL014W 984 nt18.63■□□□□ 0.57
THP2O13539 MDJ1YFL016C 1536 nt17.61■□□□□ 0.41
THP2O13539 YKL036CYKL036C 393 nt16.84■□□□□ 0.29
THP2O13539 SRX1YKL086W 384 nt16.26■□□□□ 0.19
THP2O13539 YJL027CYJL027C 417 nt16.24■□□□□ 0.19
THP2O13539 Q0297Q0297 156 nt16.18■□□□□ 0.18
THP2O13539 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
THP2O13539 YCR051WYCR051W 669 nt15.37■□□□□ 0.05
THP2O13539 YBR190WYBR190W 312 nt15.14■□□□□ 0.01
THP2O13539 SCS3YGL126W 1143 nt15.13■□□□□ 0.01
THP2O13539 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.93□□□□□ -0.02
THP2O13539 RTC3YHR087W 336 nt14.75□□□□□ -0.05
THP2O13539 CCC1YLR220W 969 nt14.71□□□□□ -0.05
THP2O13539 YOL085CYOL085C 342 nt14.57□□□□□ -0.08
THP2O13539 RPP1BYDL130W 321 nt14.51□□□□□ -0.09
THP2O13539 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
THP2O13539 PKP1YIL042C 1185 nt14.37□□□□□ -0.11
THP2O13539 SCJ1YMR214W 1134 nt14.31□□□□□ -0.12
THP2O13539 PUT4YOR348C 1884 nt14□□□□□ -0.17
THP2O13539 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.98□□□□□ -0.17
THP2O13539 SSA3YBL075C 1950 nt13.91□□□□□ -0.18
THP2O13539 PET122YER153C 765 nt13.89□□□□□ -0.19
THP2O13539 SHR5YOL110W 714 nt13.89□□□□□ -0.19
THP2O13539 URN1YPR152C 1398 nt13.69□□□□□ -0.22
THP2O13539 SCR1SCR1 522 nt13.68□□□□□ -0.22
THP2O13539 ARE1YCR048W 1833 nt13.64□□□□□ -0.23
THP2O13539 OPI9YLR338W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
THP2O13539 YDJ1YNL064C 1230 nt13.56□□□□□ -0.24
THP2O13539 SAH1YER043C 1350 nt13.55□□□□□ -0.24
THP2O13539 DEP1YAL013W 1218 nt13.54□□□□□ -0.24
THP2O13539 POA1YBR022W 534 nt13.51□□□□□ -0.25
THP2O13539 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.47□□□□□ -0.25
THP2O13539 RPN10YHR200W 807 nt13.45□□□□□ -0.26
THP2O13539 RRN5YLR141W 1092 nt13.43□□□□□ -0.26
THP2O13539 ATS1YAL020C 1002 nt13.42□□□□□ -0.26
THP2O13539 YNL208WYNL208W 600 nt13.35□□□□□ -0.27
THP2O13539 BSC6YOL137W 1494 nt13.3□□□□□ -0.28
THP2O13539 GAR1YHR089C 618 nt13.26□□□□□ -0.29
THP2O13539 PUN1YLR414C 792 nt13.2□□□□□ -0.3
THP2O13539 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.18□□□□□ -0.3
THP2O13539 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
THP2O13539 RSB1YOR049C 1065 nt13.07□□□□□ -0.32
THP2O13539 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
THP2O13539 YJR018WYJR018W 363 nt13.04□□□□□ -0.32
THP2O13539 NAB2YGL122C 1578 nt12.96□□□□□ -0.33
THP2O13539 SPT5YML010W 3192 nt12.95□□□□□ -0.34
THP2O13539 TIR1YER011W 765 nt12.85□□□□□ -0.35
THP2O13539 FIS1YIL065C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
THP2O13539 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
THP2O13539 SSA1YAL005C 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
THP2O13539 DAL1YIR027C 1383 nt12.73□□□□□ -0.37
THP2O13539 RPP2BYDR382W 333 nt12.71□□□□□ -0.37
THP2O13539 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
THP2O13539 SSA4YER103W 1929 nt12.64□□□□□ -0.39
THP2O13539 INM2YDR287W 879 nt12.63□□□□□ -0.39
THP2O13539 PHO4YFR034C 939 nt12.6□□□□□ -0.39
THP2O13539 MEP2YNL142W 1500 nt12.53□□□□□ -0.4
THP2O13539 PST2YDR032C 597 nt12.49□□□□□ -0.41
THP2O13539 YPS1YLR120C 1710 nt12.48□□□□□ -0.41
THP2O13539 YBL100CYBL100C 315 nt12.46□□□□□ -0.41
THP2O13539 SRB2YHR041C 633 nt12.44□□□□□ -0.42
THP2O13539 BDH2YAL061W 1254 nt12.39□□□□□ -0.43
THP2O13539 YDR095CYDR095C 411 nt12.37□□□□□ -0.43
THP2O13539 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.36□□□□□ -0.43
THP2O13539 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
THP2O13539 FUN26YAL022C 1554 nt12.28□□□□□ -0.44
THP2O13539 WWM1YFL010C 636 nt12.2□□□□□ -0.46
THP2O13539 ALF1YNL148C 765 nt12.2□□□□□ -0.46
THP2O13539 TRM9YML014W 840 nt12.19□□□□□ -0.46
THP2O13539 BDF1YLR399C 2061 nt12.18□□□□□ -0.46
THP2O13539 LSM3YLR438C-A 270 nt12.17□□□□□ -0.46
THP2O13539 EMI2YDR516C 1503 nt12.16□□□□□ -0.46
THP2O13539 YMR090WYMR090W 684 nt12.13□□□□□ -0.47
THP2O13539 CCT6YDR188W 1641 nt12.12□□□□□ -0.47
THP2O13539 RPP2AYOL039W 321 nt12.12□□□□□ -0.47
THP2O13539 YGR021WYGR021W 873 nt12.09□□□□□ -0.47
THP2O13539 PTP1YDL230W 1008 nt12.08□□□□□ -0.48
THP2O13539 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.07□□□□□ -0.48
THP2O13539 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
THP2O13539 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.06□□□□□ -0.48
THP2O13539 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.06□□□□□ -0.48
THP2O13539 SHU1YHL006C 453 nt12.06□□□□□ -0.48
THP2O13539 TAT1YBR069C 1860 nt12.05□□□□□ -0.48
THP2O13539 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
THP2O13539 CAC2YML102W 1407 nt12.03□□□□□ -0.48
THP2O13539 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
THP2O13539 HOM6YJR139C 1080 nt12□□□□□ -0.49
THP2O13539 SDH1YKL148C 1923 nt11.97□□□□□ -0.49
THP2O13539 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.94□□□□□ -0.5
THP2O13539 MNP1YGL068W 585 nt11.87□□□□□ -0.51
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