RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	SRB4	P32569	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MRPL6	P32904	214 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	YPC1	P38298	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	HAC1	P41546	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MTQ1	P53944	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MRPL25	P23369	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CPR3	P25719	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	PMT2	P31382	759 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	PDC2	P32896	925 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	OPY1	P38271	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	SIP3	P38717	1229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	HEM14	P40012	539 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	UBC13	P52490	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	SWC4	P53201	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	SHY1	P53266	389 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MFG1	Q07684	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	JIP3	O13555	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MSI1	P13712	422 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	AIM29	P36154	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	LDB7	P38210	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CGR1	P53188	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CPD1	P53314	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
PTR2	YKR093W	GTO3	Q04806	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	CTA1	P15202	515 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	DDI1	P40087	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	RIF2	Q06208	395 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MCT1	Q12283	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	PRM4	Q12498	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	YIA6	P40556	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	MRPL50	P53724	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTR2	YKR093W	NAM2	P11325	894 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MOB2	P43563	287 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TAD2	P47058	250 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CDH1	P53197	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	VHT1	P53241	593 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	GRS2	Q06817	618 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	TFS1	P14306	219 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CSE1	P33307	960 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SDH3	P33421	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	NDT80	P38830	627 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	EGT2	P42835	1041 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RAD17	P48581	401 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ATP16	Q12165	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YOS9	Q99220	542 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SPP41	P38904	1435 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	ERD1	P16151	362 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MER1	P16523	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RPB5	P20434	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	POF1	P25576	258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	IES6	P32617	166 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PFS1	P38872	237 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PEX22	P39718	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	BNS1	P50084	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CLD1	P53264	445 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	GIM3	P53900	129 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	PLP2	Q12017	286 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CBS2	P14905	389 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	DEP1	P31385	405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CSE2	P33308	149 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	CHL4	P38907	458 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	HIT1	P46973	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	AIM23	P47015	356 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	KRE28	Q04431	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTR2	YKR093W	FAR10	Q06001	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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