Protein–RNA interactions for Protein: P39927

PTI1, Protein PTI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTI1P39927 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.56■□□□□ 0.56
PTI1P39927 NOP1YDL014W 984 nt18.4■□□□□ 0.54
PTI1P39927 NSR1YGR159C 1245 nt17.98■□□□□ 0.47
PTI1P39927 YKL036CYKL036C 393 nt17.47■□□□□ 0.39
PTI1P39927 YJL027CYJL027C 417 nt16.41■□□□□ 0.22
PTI1P39927 Q0297Q0297 156 nt16.23■□□□□ 0.19
PTI1P39927 SCS3YGL126W 1143 nt16.13■□□□□ 0.17
PTI1P39927 SRX1YKL086W 384 nt16.01■□□□□ 0.15
PTI1P39927 MDJ1YFL016C 1536 nt15.64■□□□□ 0.09
PTI1P39927 YCR051WYCR051W 669 nt15.22■□□□□ 0.03
PTI1P39927 SCJ1YMR214W 1134 nt15.18■□□□□ 0.02
PTI1P39927 YOL085CYOL085C 342 nt15.05■□□□□ -0
PTI1P39927 PKP1YIL042C 1185 nt14.7□□□□□ -0.06
PTI1P39927 ATS1YAL020C 1002 nt14.62□□□□□ -0.07
PTI1P39927 RPP1BYDL130W 321 nt14.56□□□□□ -0.08
PTI1P39927 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.08□□□□□ -0.16
PTI1P39927 SSA3YBL075C 1950 nt13.94□□□□□ -0.18
PTI1P39927 SCR1SCR1 522 nt13.94□□□□□ -0.18
PTI1P39927 CCC1YLR220W 969 nt13.93□□□□□ -0.18
PTI1P39927 PET122YER153C 765 nt13.77□□□□□ -0.21
PTI1P39927 DBP2YNL112W 1641 nt13.71□□□□□ -0.22
PTI1P39927 RTC3YHR087W 336 nt13.69□□□□□ -0.22
PTI1P39927 YBR190WYBR190W 312 nt13.56□□□□□ -0.24
PTI1P39927 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.52□□□□□ -0.25
PTI1P39927 RRN5YLR141W 1092 nt13.45□□□□□ -0.26
PTI1P39927 PST2YDR032C 597 nt13.42□□□□□ -0.26
PTI1P39927 RSB1YOR049C 1065 nt13.4□□□□□ -0.26
PTI1P39927 YKL097CYKL097C 411 nt13.27□□□□□ -0.29
PTI1P39927 RVS167YDR388W 1449 nt13.24□□□□□ -0.29
PTI1P39927 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.19□□□□□ -0.3
PTI1P39927 YDJ1YNL064C 1230 nt13.13□□□□□ -0.31
PTI1P39927 PUT4YOR348C 1884 nt12.89□□□□□ -0.35
PTI1P39927 SHR5YOL110W 714 nt12.86□□□□□ -0.35
PTI1P39927 SHU1YHL006C 453 nt12.69□□□□□ -0.38
PTI1P39927 GAR1YHR089C 618 nt12.67□□□□□ -0.38
PTI1P39927 YOR139CYOR139C 393 nt12.51□□□□□ -0.41
PTI1P39927 POA1YBR022W 534 nt12.43□□□□□ -0.42
PTI1P39927 ARE1YCR048W 1833 nt12.41□□□□□ -0.42
PTI1P39927 NPL3YDR432W 1245 nt12.41□□□□□ -0.42
PTI1P39927 BSC6YOL137W 1494 nt12.31□□□□□ -0.44
PTI1P39927 SPT5YML010W 3192 nt12.28□□□□□ -0.44
PTI1P39927 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.28□□□□□ -0.44
PTI1P39927 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.26□□□□□ -0.45
PTI1P39927 SSA4YER103W 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
PTI1P39927 TIR1YER011W 765 nt12.25□□□□□ -0.45
PTI1P39927 RPN10YHR200W 807 nt12.19□□□□□ -0.46
PTI1P39927 DEP1YAL013W 1218 nt12.19□□□□□ -0.46
PTI1P39927 SAH1YER043C 1350 nt12.18□□□□□ -0.46
PTI1P39927 YNL208WYNL208W 600 nt12.18□□□□□ -0.46
PTI1P39927 URN1YPR152C 1398 nt12.08□□□□□ -0.48
PTI1P39927 OPI9YLR338W 858 nt12.07□□□□□ -0.48
PTI1P39927 YOL037CYOL037C 354 nt12.06□□□□□ -0.48
PTI1P39927 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 YGR021WYGR021W 873 nt12.01□□□□□ -0.49
PTI1P39927 BUD23YCR047C 828 nt11.93□□□□□ -0.5
PTI1P39927 SSA1YAL005C 1929 nt11.9□□□□□ -0.51
PTI1P39927 HOM6YJR139C 1080 nt11.89□□□□□ -0.51
PTI1P39927 MNP1YGL068W 585 nt11.86□□□□□ -0.51
PTI1P39927 BDF1YLR399C 2061 nt11.85□□□□□ -0.51
PTI1P39927 MOT3YMR070W 1473 nt11.8□□□□□ -0.52
PTI1P39927 WWM1YFL010C 636 nt11.75□□□□□ -0.53
PTI1P39927 PUS2YGL063W 1113 nt11.74□□□□□ -0.53
PTI1P39927 RKM5YLR137W 1104 nt11.73□□□□□ -0.53
PTI1P39927 PUN1YLR414C 792 nt11.71□□□□□ -0.53
PTI1P39927 PTC2YER089C 1395 nt11.7□□□□□ -0.54
PTI1P39927 TAT1YBR069C 1860 nt11.68□□□□□ -0.54
PTI1P39927 SRB2YHR041C 633 nt11.68□□□□□ -0.54
PTI1P39927 NAB2YGL122C 1578 nt11.67□□□□□ -0.54
PTI1P39927 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.66□□□□□ -0.54
PTI1P39927 MRPL8YJL063C 717 nt11.66□□□□□ -0.54
PTI1P39927 YLR281CYLR281C 468 nt11.64□□□□□ -0.55
PTI1P39927 MEP2YNL142W 1500 nt11.64□□□□□ -0.55
PTI1P39927 RPP2BYDR382W 333 nt11.61□□□□□ -0.55
PTI1P39927 PAC11YDR488C 1602 nt11.6□□□□□ -0.55
PTI1P39927 YJR018WYJR018W 363 nt11.59□□□□□ -0.55
PTI1P39927 WHI5YOR083W 888 nt11.52□□□□□ -0.57
PTI1P39927 ADO1YJR105W 1023 nt11.48□□□□□ -0.57
PTI1P39927 FMP45YDL222C 930 nt11.43□□□□□ -0.58
PTI1P39927 DCW1YKL046C 1350 nt11.42□□□□□ -0.58
PTI1P39927 IMP2'YIL154C 1041 nt11.42□□□□□ -0.58
PTI1P39927 BDH2YAL061W 1254 nt11.42□□□□□ -0.58
PTI1P39927 LSM3YLR438C-A 270 nt11.42□□□□□ -0.58
PTI1P39927 YCH1YGR203W 447 nt11.4□□□□□ -0.58
PTI1P39927 FIS1YIL065C 468 nt11.39□□□□□ -0.59
PTI1P39927 YJR120WYJR120W 351 nt11.39□□□□□ -0.59
PTI1P39927 DSK2YMR276W 1122 nt11.38□□□□□ -0.59
PTI1P39927 DAL1YIR027C 1383 nt11.36□□□□□ -0.59
PTI1P39927 FPR4YLR449W 1179 nt11.32□□□□□ -0.6
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