Protein–RNA interactions for Protein: Q12339

UTP23, rRNA-processing protein UTP23, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP23Q12339 NSR1YGR159C 1245 nt15.57■□□□□ 0.08
UTP23Q12339 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.36■□□□□ 0.05
UTP23Q12339 NOP1YDL014W 984 nt14.87□□□□□ -0.03
UTP23Q12339 MDJ1YFL016C 1536 nt14.1□□□□□ -0.15
UTP23Q12339 YKL036CYKL036C 393 nt13.3□□□□□ -0.28
UTP23Q12339 YJL027CYJL027C 417 nt13.09□□□□□ -0.31
UTP23Q12339 SRX1YKL086W 384 nt12.89□□□□□ -0.35
UTP23Q12339 Q0297Q0297 156 nt12.78□□□□□ -0.36
UTP23Q12339 SSA3YBL075C 1950 nt12.28□□□□□ -0.44
UTP23Q12339 YCR051WYCR051W 669 nt12.25□□□□□ -0.45
UTP23Q12339 DBP2YNL112W 1641 nt12.23□□□□□ -0.45
UTP23Q12339 YBR190WYBR190W 312 nt12.17□□□□□ -0.46
UTP23Q12339 RTC3YHR087W 336 nt11.95□□□□□ -0.5
UTP23Q12339 SCS3YGL126W 1143 nt11.84□□□□□ -0.51
UTP23Q12339 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP23Q12339 CCC1YLR220W 969 nt11.76□□□□□ -0.53
UTP23Q12339 RVS167YDR388W 1449 nt11.68□□□□□ -0.54
UTP23Q12339 RPP1BYDL130W 321 nt11.49□□□□□ -0.57
UTP23Q12339 YOL085CYOL085C 342 nt11.47□□□□□ -0.57
UTP23Q12339 PKP1YIL042C 1185 nt11.34□□□□□ -0.59
UTP23Q12339 SCJ1YMR214W 1134 nt11.32□□□□□ -0.6
UTP23Q12339 PUT4YOR348C 1884 nt11.23□□□□□ -0.61
UTP23Q12339 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.09□□□□□ -0.63
UTP23Q12339 SHR5YOL110W 714 nt11.09□□□□□ -0.63
UTP23Q12339 URN1YPR152C 1398 nt10.99□□□□□ -0.65
UTP23Q12339 PET122YER153C 765 nt10.97□□□□□ -0.65
UTP23Q12339 ARE1YCR048W 1833 nt10.91□□□□□ -0.66
UTP23Q12339 SCR1SCR1 522 nt10.9□□□□□ -0.66
UTP23Q12339 POA1YBR022W 534 nt10.9□□□□□ -0.66
UTP23Q12339 RPN10YHR200W 807 nt10.88□□□□□ -0.67
UTP23Q12339 OPI9YLR338W 858 nt10.88□□□□□ -0.67
UTP23Q12339 SAH1YER043C 1350 nt10.88□□□□□ -0.67
UTP23Q12339 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.86□□□□□ -0.67
UTP23Q12339 DEP1YAL013W 1218 nt10.86□□□□□ -0.67
UTP23Q12339 YDJ1YNL064C 1230 nt10.76□□□□□ -0.69
UTP23Q12339 BSC6YOL137W 1494 nt10.74□□□□□ -0.69
UTP23Q12339 YNL208WYNL208W 600 nt10.71□□□□□ -0.69
UTP23Q12339 SPT5YML010W 3192 nt10.68□□□□□ -0.7
UTP23Q12339 PUN1YLR414C 792 nt10.64□□□□□ -0.71
UTP23Q12339 BUD23YCR047C 828 nt10.63□□□□□ -0.71
UTP23Q12339 RRN5YLR141W 1092 nt10.63□□□□□ -0.71
UTP23Q12339 SSA4YER103W 1929 nt10.62□□□□□ -0.71
UTP23Q12339 GAR1YHR089C 618 nt10.58□□□□□ -0.72
UTP23Q12339 Q0182Q0182 405 nt10.57□□□□□ -0.72
UTP23Q12339 PTC2YER089C 1395 nt10.52□□□□□ -0.73
UTP23Q12339 ATS1YAL020C 1002 nt10.5□□□□□ -0.73
UTP23Q12339 YJR018WYJR018W 363 nt10.47□□□□□ -0.73
UTP23Q12339 NAB2YGL122C 1578 nt10.45□□□□□ -0.74
UTP23Q12339 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.41□□□□□ -0.74
UTP23Q12339 RSB1YOR049C 1065 nt10.38□□□□□ -0.75
UTP23Q12339 BDF1YLR399C 2061 nt10.37□□□□□ -0.75
UTP23Q12339 RPP2BYDR382W 333 nt10.27□□□□□ -0.77
UTP23Q12339 FPR4YLR449W 1179 nt10.26□□□□□ -0.77
UTP23Q12339 PAC11YDR488C 1602 nt10.25□□□□□ -0.77
UTP23Q12339 DAL1YIR027C 1383 nt10.24□□□□□ -0.77
UTP23Q12339 TIR1YER011W 765 nt10.23□□□□□ -0.77
UTP23Q12339 TAT1YBR069C 1860 nt10.2□□□□□ -0.78
UTP23Q12339 INM2YDR287W 879 nt10.19□□□□□ -0.78
UTP23Q12339 FIS1YIL065C 468 nt10.18□□□□□ -0.78
UTP23Q12339 NVJ2YPR091C 2313 nt10.15□□□□□ -0.79
UTP23Q12339 PHO4YFR034C 939 nt10.12□□□□□ -0.79
UTP23Q12339 MEP2YNL142W 1500 nt10.11□□□□□ -0.79
UTP23Q12339 SSA1YAL005C 1929 nt10.09□□□□□ -0.79
UTP23Q12339 YJR120WYJR120W 351 nt10.06□□□□□ -0.8
UTP23Q12339 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.02□□□□□ -0.81
UTP23Q12339 YPS1YLR120C 1710 nt10.02□□□□□ -0.81
UTP23Q12339 YBL100CYBL100C 315 nt10□□□□□ -0.81
UTP23Q12339 YMR090WYMR090W 684 nt9.93□□□□□ -0.82
UTP23Q12339 YDR095CYDR095C 411 nt9.91□□□□□ -0.82
UTP23Q12339 BDH2YAL061W 1254 nt9.9□□□□□ -0.82
UTP23Q12339 ALF1YNL148C 765 nt9.89□□□□□ -0.83
UTP23Q12339 DCW1YKL046C 1350 nt9.88□□□□□ -0.83
UTP23Q12339 FUN26YAL022C 1554 nt9.85□□□□□ -0.83
UTP23Q12339 MOT3YMR070W 1473 nt9.85□□□□□ -0.83
UTP23Q12339 TRM9YML014W 840 nt9.83□□□□□ -0.84
UTP23Q12339 EMI2YDR516C 1503 nt9.82□□□□□ -0.84
UTP23Q12339 RPP2AYOL039W 321 nt9.77□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 PST2YDR032C 597 nt9.74□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.74□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.74□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 SRB2YHR041C 633 nt9.74□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 FPS1YLL043W 2010 nt9.73□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 YDL221WYDL221W 552 nt9.72□□□□□ -0.85
UTP23Q12339 LSM3YLR438C-A 270 nt9.71□□□□□ -0.86
UTP23Q12339 YBR220CYBR220C 1683 nt9.7□□□□□ -0.86
UTP23Q12339 YJL225CYJL225C 5277 nt9.69□□□□□ -0.86
UTP23Q12339 CCT6YDR188W 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
UTP23Q12339 WWM1YFL010C 636 nt9.67□□□□□ -0.86
UTP23Q12339 SDH1YKL148C 1923 nt9.64□□□□□ -0.87
UTP23Q12339 PTP1YDL230W 1008 nt9.63□□□□□ -0.87
UTP23Q12339 YGR021WYGR021W 873 nt9.63□□□□□ -0.87
UTP23Q12339 CAC2YML102W 1407 nt9.61□□□□□ -0.87
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