Protein–RNA interactions for Protein: P53314

CPD1, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, yeastyeast

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1P53314 NSR1YGR159C 1245 nt16.15■□□□□ 0.18
CPD1P53314 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.09■□□□□ 0.17
CPD1P53314 NOP1YDL014W 984 nt15.68■□□□□ 0.1
CPD1P53314 MDJ1YFL016C 1536 nt14.46□□□□□ -0.09
CPD1P53314 YKL036CYKL036C 393 nt14.34□□□□□ -0.11
CPD1P53314 Q0297Q0297 156 nt13.68□□□□□ -0.22
CPD1P53314 SRX1YKL086W 384 nt13.68□□□□□ -0.22
CPD1P53314 YJL027CYJL027C 417 nt13.35□□□□□ -0.27
CPD1P53314 SCS3YGL126W 1143 nt12.96□□□□□ -0.33
CPD1P53314 YCR051WYCR051W 669 nt12.92□□□□□ -0.34
CPD1P53314 DBP2YNL112W 1641 nt12.67□□□□□ -0.38
CPD1P53314 YBR190WYBR190W 312 nt12.44□□□□□ -0.42
CPD1P53314 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 YOL085CYOL085C 342 nt12.41□□□□□ -0.42
CPD1P53314 RPP1BYDL130W 321 nt12.26□□□□□ -0.45
CPD1P53314 CCC1YLR220W 969 nt12.23□□□□□ -0.45
CPD1P53314 SSA3YBL075C 1950 nt12.18□□□□□ -0.46
CPD1P53314 RTC3YHR087W 336 nt12.17□□□□□ -0.46
CPD1P53314 PKP1YIL042C 1185 nt12.17□□□□□ -0.46
CPD1P53314 RVS167YDR388W 1449 nt11.96□□□□□ -0.49
CPD1P53314 SCJ1YMR214W 1134 nt11.79□□□□□ -0.52
CPD1P53314 PUT4YOR348C 1884 nt11.7□□□□□ -0.54
CPD1P53314 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.7□□□□□ -0.54
CPD1P53314 PET122YER153C 765 nt11.69□□□□□ -0.54
CPD1P53314 ATS1YAL020C 1002 nt11.59□□□□□ -0.55
CPD1P53314 SCR1SCR1 522 nt11.59□□□□□ -0.55
CPD1P53314 SHR5YOL110W 714 nt11.5□□□□□ -0.57
CPD1P53314 YDJ1YNL064C 1230 nt11.36□□□□□ -0.59
CPD1P53314 ARE1YCR048W 1833 nt11.35□□□□□ -0.59
CPD1P53314 RRN5YLR141W 1092 nt11.34□□□□□ -0.59
CPD1P53314 POA1YBR022W 534 nt11.32□□□□□ -0.6
CPD1P53314 SAH1YER043C 1350 nt11.21□□□□□ -0.61
CPD1P53314 URN1YPR152C 1398 nt11.2□□□□□ -0.62
CPD1P53314 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.18□□□□□ -0.62
CPD1P53314 BSC6YOL137W 1494 nt11.14□□□□□ -0.63
CPD1P53314 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.13□□□□□ -0.63
CPD1P53314 DEP1YAL013W 1218 nt11.12□□□□□ -0.63
CPD1P53314 OPI9YLR338W 858 nt11.11□□□□□ -0.63
CPD1P53314 RPN10YHR200W 807 nt11.08□□□□□ -0.64
CPD1P53314 RSB1YOR049C 1065 nt11.08□□□□□ -0.64
CPD1P53314 GAR1YHR089C 618 nt11.06□□□□□ -0.64
CPD1P53314 YNL208WYNL208W 600 nt11.03□□□□□ -0.64
CPD1P53314 SPT5YML010W 3192 nt11.02□□□□□ -0.65
CPD1P53314 BUD23YCR047C 828 nt10.91□□□□□ -0.66
CPD1P53314 SSA4YER103W 1929 nt10.86□□□□□ -0.67
CPD1P53314 PUN1YLR414C 792 nt10.79□□□□□ -0.68
CPD1P53314 PTC2YER089C 1395 nt10.77□□□□□ -0.68
CPD1P53314 PST2YDR032C 597 nt10.75□□□□□ -0.69
CPD1P53314 TIR1YER011W 765 nt10.72□□□□□ -0.69
CPD1P53314 Q0182Q0182 405 nt10.7□□□□□ -0.7
CPD1P53314 YJR018WYJR018W 363 nt10.7□□□□□ -0.7
CPD1P53314 NAB2YGL122C 1578 nt10.69□□□□□ -0.7
CPD1P53314 SSA1YAL005C 1929 nt10.58□□□□□ -0.72
CPD1P53314 MEP2YNL142W 1500 nt10.51□□□□□ -0.73
CPD1P53314 BDF1YLR399C 2061 nt10.51□□□□□ -0.73
CPD1P53314 RPP2BYDR382W 333 nt10.49□□□□□ -0.73
CPD1P53314 YJR120WYJR120W 351 nt10.47□□□□□ -0.73
CPD1P53314 FIS1YIL065C 468 nt10.46□□□□□ -0.73
CPD1P53314 FPR4YLR449W 1179 nt10.45□□□□□ -0.74
CPD1P53314 DAL1YIR027C 1383 nt10.44□□□□□ -0.74
CPD1P53314 INM2YDR287W 879 nt10.37□□□□□ -0.75
CPD1P53314 DCW1YKL046C 1350 nt10.36□□□□□ -0.75
CPD1P53314 PHO4YFR034C 939 nt10.34□□□□□ -0.75
CPD1P53314 TAT1YBR069C 1860 nt10.34□□□□□ -0.75
CPD1P53314 YPS1YLR120C 1710 nt10.33□□□□□ -0.76
CPD1P53314 SRB2YHR041C 633 nt10.33□□□□□ -0.76
CPD1P53314 SHU1YHL006C 453 nt10.3□□□□□ -0.76
CPD1P53314 YKL097CYKL097C 411 nt10.27□□□□□ -0.77
CPD1P53314 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.26□□□□□ -0.77
CPD1P53314 BDH2YAL061W 1254 nt10.25□□□□□ -0.77
CPD1P53314 YBL100CYBL100C 315 nt10.21□□□□□ -0.77
CPD1P53314 WWM1YFL010C 636 nt10.2□□□□□ -0.78
CPD1P53314 EMI2YDR516C 1503 nt10.19□□□□□ -0.78
CPD1P53314 YGR021WYGR021W 873 nt10.19□□□□□ -0.78
CPD1P53314 YBR220CYBR220C 1683 nt10.17□□□□□ -0.78
CPD1P53314 YDR095CYDR095C 411 nt10.16□□□□□ -0.78
CPD1P53314 YMR090WYMR090W 684 nt10.16□□□□□ -0.78
CPD1P53314 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.13□□□□□ -0.79
CPD1P53314 LSM3YLR438C-A 270 nt10.13□□□□□ -0.79
CPD1P53314 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.1□□□□□ -0.79
CPD1P53314 HOM6YJR139C 1080 nt10.1□□□□□ -0.79
CPD1P53314 FUN26YAL022C 1554 nt10.09□□□□□ -0.79
CPD1P53314 TRM9YML014W 840 nt10.08□□□□□ -0.8
CPD1P53314 YDL221WYDL221W 552 nt10.06□□□□□ -0.8
CPD1P53314 SDH1YKL148C 1923 nt10.05□□□□□ -0.8
CPD1P53314 CAC2YML102W 1407 nt10.04□□□□□ -0.8
CPD1P53314 PAC11YDR488C 1602 nt10.04□□□□□ -0.8
CPD1P53314 PTP1YDL230W 1008 nt10□□□□□ -0.81
CPD1P53314 RPP2AYOL039W 321 nt9.99□□□□□ -0.81
CPD1P53314 CCT6YDR188W 1641 nt9.99□□□□□ -0.81
CPD1P53314 MNP1YGL068W 585 nt9.98□□□□□ -0.81
CPD1P53314 ALF1YNL148C 765 nt9.98□□□□□ -0.81
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