Protein–RNA interactions for Protein: P52490

UBC13, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 13, yeastyeast

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBC13P52490 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.6■□□□□ 0.41
UBC13P52490 NSR1YGR159C 1245 nt17.51■□□□□ 0.39
UBC13P52490 NOP1YDL014W 984 nt17.19■□□□□ 0.34
UBC13P52490 YKL036CYKL036C 393 nt15.89■□□□□ 0.13
UBC13P52490 MDJ1YFL016C 1536 nt15.41■□□□□ 0.06
UBC13P52490 Q0297Q0297 156 nt15.07■□□□□ 0
UBC13P52490 SRX1YKL086W 384 nt15.01□□□□□ -0.01
UBC13P52490 YJL027CYJL027C 417 nt14.82□□□□□ -0.04
UBC13P52490 SCS3YGL126W 1143 nt14.46□□□□□ -0.09
UBC13P52490 YCR051WYCR051W 669 nt14.19□□□□□ -0.14
UBC13P52490 YOL085CYOL085C 342 nt13.74□□□□□ -0.21
UBC13P52490 DBP2YNL112W 1641 nt13.69□□□□□ -0.22
UBC13P52490 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.54□□□□□ -0.24
UBC13P52490 RPP1BYDL130W 321 nt13.5□□□□□ -0.25
UBC13P52490 PKP1YIL042C 1185 nt13.46□□□□□ -0.25
UBC13P52490 CCC1YLR220W 969 nt13.32□□□□□ -0.28
UBC13P52490 YBR190WYBR190W 312 nt13.2□□□□□ -0.3
UBC13P52490 SCJ1YMR214W 1134 nt12.97□□□□□ -0.33
UBC13P52490 ATS1YAL020C 1002 nt12.95□□□□□ -0.34
UBC13P52490 RVS167YDR388W 1449 nt12.93□□□□□ -0.34
UBC13P52490 PET122YER153C 765 nt12.86□□□□□ -0.35
UBC13P52490 RTC3YHR087W 336 nt12.85□□□□□ -0.35
UBC13P52490 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.81□□□□□ -0.36
UBC13P52490 SCR1SCR1 522 nt12.79□□□□□ -0.36
UBC13P52490 RRN5YLR141W 1092 nt12.49□□□□□ -0.41
UBC13P52490 SHR5YOL110W 714 nt12.49□□□□□ -0.41
UBC13P52490 YDJ1YNL064C 1230 nt12.43□□□□□ -0.42
UBC13P52490 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.25□□□□□ -0.45
UBC13P52490 RSB1YOR049C 1065 nt12.24□□□□□ -0.45
UBC13P52490 GAR1YHR089C 618 nt12.07□□□□□ -0.48
UBC13P52490 URN1YPR152C 1398 nt12.06□□□□□ -0.48
UBC13P52490 DEP1YAL013W 1218 nt12.01□□□□□ -0.49
UBC13P52490 PST2YDR032C 597 nt12□□□□□ -0.49
UBC13P52490 RPN10YHR200W 807 nt11.96□□□□□ -0.49
UBC13P52490 YNL208WYNL208W 600 nt11.93□□□□□ -0.5
UBC13P52490 PUT4YOR348C 1884 nt11.92□□□□□ -0.5
UBC13P52490 OPI9YLR338W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
UBC13P52490 SAH1YER043C 1350 nt11.77□□□□□ -0.53
UBC13P52490 SSA3YBL075C 1950 nt11.73□□□□□ -0.53
UBC13P52490 ARE1YCR048W 1833 nt11.72□□□□□ -0.53
UBC13P52490 TIR1YER011W 765 nt11.7□□□□□ -0.54
UBC13P52490 PUN1YLR414C 792 nt11.59□□□□□ -0.55
UBC13P52490 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.55□□□□□ -0.56
UBC13P52490 YKL097CYKL097C 411 nt11.55□□□□□ -0.56
UBC13P52490 YJR018WYJR018W 363 nt11.53□□□□□ -0.56
UBC13P52490 SSA1YAL005C 1929 nt11.52□□□□□ -0.56
UBC13P52490 POA1YBR022W 534 nt11.51□□□□□ -0.57
UBC13P52490 SHU1YHL006C 453 nt11.47□□□□□ -0.57
UBC13P52490 PTC2YER089C 1395 nt11.38□□□□□ -0.59
UBC13P52490 RPP2BYDR382W 333 nt11.34□□□□□ -0.59
UBC13P52490 YJR120WYJR120W 351 nt11.34□□□□□ -0.59
UBC13P52490 SRB2YHR041C 633 nt11.29□□□□□ -0.6
UBC13P52490 BSC6YOL137W 1494 nt11.27□□□□□ -0.6
UBC13P52490 NAB2YGL122C 1578 nt11.27□□□□□ -0.61
UBC13P52490 BUD23YCR047C 828 nt11.26□□□□□ -0.61
UBC13P52490 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.22□□□□□ -0.61
UBC13P52490 YGR021WYGR021W 873 nt11.19□□□□□ -0.62
UBC13P52490 WWM1YFL010C 636 nt11.15□□□□□ -0.62
UBC13P52490 INM2YDR287W 879 nt11.14□□□□□ -0.63
UBC13P52490 DAL1YIR027C 1383 nt11.13□□□□□ -0.63
UBC13P52490 HOM6YJR139C 1080 nt11.12□□□□□ -0.63
UBC13P52490 BDH2YAL061W 1254 nt11.12□□□□□ -0.63
UBC13P52490 FIS1YIL065C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
UBC13P52490 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.05□□□□□ -0.64
UBC13P52490 YOR139CYOR139C 393 nt11.05□□□□□ -0.64
UBC13P52490 FPR4YLR449W 1179 nt11.03□□□□□ -0.64
UBC13P52490 MNP1YGL068W 585 nt11.02□□□□□ -0.65
UBC13P52490 YBL100CYBL100C 315 nt11.02□□□□□ -0.65
UBC13P52490 LSM3YLR438C-A 270 nt11.01□□□□□ -0.65
UBC13P52490 PHO4YFR034C 939 nt11□□□□□ -0.65
UBC13P52490 NPL3YDR432W 1245 nt10.97□□□□□ -0.65
UBC13P52490 RKM5YLR137W 1104 nt10.95□□□□□ -0.66
UBC13P52490 YOL037CYOL037C 354 nt10.95□□□□□ -0.66
UBC13P52490 FUN26YAL022C 1554 nt10.88□□□□□ -0.67
UBC13P52490 TRM9YML014W 840 nt10.88□□□□□ -0.67
UBC13P52490 SPT5YML010W 3192 nt10.87□□□□□ -0.67
UBC13P52490 CCT6YDR188W 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
UBC13P52490 YPS1YLR120C 1710 nt10.78□□□□□ -0.68
UBC13P52490 YDR095CYDR095C 411 nt10.74□□□□□ -0.69
UBC13P52490 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.72□□□□□ -0.69
UBC13P52490 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.72□□□□□ -0.69
UBC13P52490 ALF1YNL148C 765 nt10.72□□□□□ -0.69
UBC13P52490 SSA4YER103W 1929 nt10.66□□□□□ -0.7
UBC13P52490 YLR281CYLR281C 468 nt10.65□□□□□ -0.7
UBC13P52490 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.63□□□□□ -0.71
UBC13P52490 MEP2YNL142W 1500 nt10.6□□□□□ -0.71
UBC13P52490 WHI5YOR083W 888 nt10.59□□□□□ -0.71
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