RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	TAE1	P38340	232 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YIL067C	P40514	678 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	REE1	P40893	198 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	CIN2	P46670	268 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YAR1	P46683	200 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PMT4	P46971	762 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SRL4	Q03085	281 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ADD37	Q03233	198 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	TRM82	Q03774	444 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	GRX3	Q03835	250 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PBA1	Q05778	276 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RIF2	Q06208	395 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	IRC25	Q07951	179 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	DDC1	Q08949	612 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.58	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	COX2	P00410	251 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	LDS1	P31379	325 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ZRT1	P32804	376 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	NDT80	P38830	627 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YFR057W	P43625	151 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SWC4	P53201	476 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SHY1	P53266	389 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SED5	Q01590	340 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YOR387C	Q08910	206 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SLM3	Q12093	417 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RBD2	Q12270	262 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SFM1	Q12314	213 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PRM4	Q12498	284 aa		2.57	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	MSF1	P08425	469 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PET123	P17558	318 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	NUP2	P32499	720 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	COS9	P36034	407 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	DTR1	P38125	572 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RCK2	P38623	610 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	FMC1	P40491	155 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	MOB2	P43563	287 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SNX41	Q04053	625 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ARV1	Q06541	321 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	BSC6	Q08280	497 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	FDH1	Q08911	376 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	TMS1	Q12116	473 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	FRE8	Q12209	686 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPN6	Q12377	434 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ERP3	Q12403	225 aa		2.56	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	REP1	P03871	373 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YSR3	P23501	404 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RRT12	P25381	491 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ZIP1	P31111	875 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PDC2	P32896	925 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YKL063C	P35725	167 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPC37	P36121	282 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SMF2	P38778	549 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PRM9	P39551	298 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PAN6	P40459	309 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YIA6	P40556	373 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YGR210C	P42942	411 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	LSB1	P53281	241 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	SUR7	P54003	302 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	PET117	Q02771	107 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	COX20	Q04935	205 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	FSH2	Q05015	223 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	BTS1	Q12051	335 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.54	□□□□□ -2	not detected
AIM4	YBR194W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	STE7	P06784	515 aa		2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RAD3	P06839	778 aa		2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AIM4	YBR194W	IFM1	P25038	676 aa		2.54	□□□□□ -2

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