Protein–RNA interactions for Protein: Q01590

SED5, Integral membrane protein SED5, yeastyeast

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED5Q01590 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.46■□□□□ 0.71
SED5Q01590 NSR1YGR159C 1245 nt19.23■□□□□ 0.67
SED5Q01590 NOP1YDL014W 984 nt19.01■□□□□ 0.63
SED5Q01590 YKL036CYKL036C 393 nt17.66■□□□□ 0.42
SED5Q01590 MDJ1YFL016C 1536 nt17.1■□□□□ 0.33
SED5Q01590 Q0297Q0297 156 nt16.67■□□□□ 0.26
SED5Q01590 SRX1YKL086W 384 nt16.59■□□□□ 0.25
SED5Q01590 YJL027CYJL027C 417 nt16.5■□□□□ 0.23
SED5Q01590 SCS3YGL126W 1143 nt16.12■□□□□ 0.17
SED5Q01590 YCR051WYCR051W 669 nt15.75■□□□□ 0.11
SED5Q01590 YOL085CYOL085C 342 nt15.28■□□□□ 0.04
SED5Q01590 PKP1YIL042C 1185 nt15.01□□□□□ -0.01
SED5Q01590 DBP2YNL112W 1641 nt15□□□□□ -0.01
SED5Q01590 RPP1BYDL130W 321 nt14.96□□□□□ -0.01
SED5Q01590 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
SED5Q01590 CCC1YLR220W 969 nt14.75□□□□□ -0.05
SED5Q01590 YBR190WYBR190W 312 nt14.71□□□□□ -0.05
SED5Q01590 SSA3YBL075C 1950 nt14.71□□□□□ -0.06
SED5Q01590 SCJ1YMR214W 1134 nt14.5□□□□□ -0.09
SED5Q01590 ATS1YAL020C 1002 nt14.47□□□□□ -0.09
SED5Q01590 RTC3YHR087W 336 nt14.36□□□□□ -0.11
SED5Q01590 PET122YER153C 765 nt14.25□□□□□ -0.13
SED5Q01590 RVS167YDR388W 1449 nt14.19□□□□□ -0.14
SED5Q01590 SCR1SCR1 522 nt14.18□□□□□ -0.14
SED5Q01590 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SED5Q01590 PUT4YOR348C 1884 nt13.93□□□□□ -0.18
SED5Q01590 RRN5YLR141W 1092 nt13.87□□□□□ -0.19
SED5Q01590 SHR5YOL110W 714 nt13.72□□□□□ -0.21
SED5Q01590 YDJ1YNL064C 1230 nt13.7□□□□□ -0.22
SED5Q01590 RSB1YOR049C 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
SED5Q01590 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.59□□□□□ -0.23
SED5Q01590 ARE1YCR048W 1833 nt13.47□□□□□ -0.25
SED5Q01590 POA1YBR022W 534 nt13.44□□□□□ -0.26
SED5Q01590 PST2YDR032C 597 nt13.37□□□□□ -0.27
SED5Q01590 GAR1YHR089C 618 nt13.36□□□□□ -0.27
SED5Q01590 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.28□□□□□ -0.28
SED5Q01590 BSC6YOL137W 1494 nt13.28□□□□□ -0.28
SED5Q01590 SAH1YER043C 1350 nt13.27□□□□□ -0.29
SED5Q01590 DEP1YAL013W 1218 nt13.26□□□□□ -0.29
SED5Q01590 URN1YPR152C 1398 nt13.23□□□□□ -0.29
SED5Q01590 SPT5YML010W 3192 nt13.2□□□□□ -0.3
SED5Q01590 OPI9YLR338W 858 nt13.13□□□□□ -0.31
SED5Q01590 RPN10YHR200W 807 nt13.11□□□□□ -0.31
SED5Q01590 YNL208WYNL208W 600 nt13.1□□□□□ -0.31
SED5Q01590 SSA4YER103W 1929 nt13.05□□□□□ -0.32
SED5Q01590 YKL097CYKL097C 411 nt12.93□□□□□ -0.34
SED5Q01590 BUD23YCR047C 828 nt12.92□□□□□ -0.34
SED5Q01590 TIR1YER011W 765 nt12.91□□□□□ -0.34
SED5Q01590 SHU1YHL006C 453 nt12.78□□□□□ -0.36
SED5Q01590 PTC2YER089C 1395 nt12.73□□□□□ -0.37
SED5Q01590 PUN1YLR414C 792 nt12.72□□□□□ -0.37
SED5Q01590 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
SED5Q01590 YJR018WYJR018W 363 nt12.64□□□□□ -0.39
SED5Q01590 NAB2YGL122C 1578 nt12.64□□□□□ -0.39
SED5Q01590 BDF1YLR399C 2061 nt12.63□□□□□ -0.39
SED5Q01590 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.53□□□□□ -0.4
SED5Q01590 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.4
SED5Q01590 SRB2YHR041C 633 nt12.48□□□□□ -0.41
SED5Q01590 RPP2BYDR382W 333 nt12.45□□□□□ -0.42
SED5Q01590 TAT1YBR069C 1860 nt12.43□□□□□ -0.42
SED5Q01590 YJR120WYJR120W 351 nt12.43□□□□□ -0.42
SED5Q01590 FIS1YIL065C 468 nt12.42□□□□□ -0.42
SED5Q01590 YGR021WYGR021W 873 nt12.36□□□□□ -0.43
SED5Q01590 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
SED5Q01590 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
SED5Q01590 WWM1YFL010C 636 nt12.35□□□□□ -0.43
SED5Q01590 DAL1YIR027C 1383 nt12.33□□□□□ -0.44
SED5Q01590 FPR4YLR449W 1179 nt12.32□□□□□ -0.44
SED5Q01590 HOM6YJR139C 1080 nt12.3□□□□□ -0.44
SED5Q01590 NPL3YDR432W 1245 nt12.26□□□□□ -0.45
SED5Q01590 YPS1YLR120C 1710 nt12.25□□□□□ -0.45
SED5Q01590 PHO4YFR034C 939 nt12.24□□□□□ -0.45
SED5Q01590 MNP1YGL068W 585 nt12.23□□□□□ -0.45
SED5Q01590 BDH2YAL061W 1254 nt12.21□□□□□ -0.45
SED5Q01590 INM2YDR287W 879 nt12.19□□□□□ -0.46
SED5Q01590 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.17□□□□□ -0.46
SED5Q01590 YBR220CYBR220C 1683 nt12.16□□□□□ -0.46
SED5Q01590 PAC11YDR488C 1602 nt12.15□□□□□ -0.46
SED5Q01590 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.15□□□□□ -0.46
SED5Q01590 EMI2YDR516C 1503 nt12.13□□□□□ -0.47
SED5Q01590 YOL037CYOL037C 354 nt12.13□□□□□ -0.47
SED5Q01590 RKM5YLR137W 1104 nt12.12□□□□□ -0.47
SED5Q01590 LSM3YLR438C-A 270 nt12.1□□□□□ -0.47
SED5Q01590 YBL100CYBL100C 315 nt12.08□□□□□ -0.48
SED5Q01590 YDR095CYDR095C 411 nt12.05□□□□□ -0.48
SED5Q01590 YMR090WYMR090W 684 nt12.05□□□□□ -0.48
SED5Q01590 YDL221WYDL221W 552 nt11.98□□□□□ -0.49
SED5Q01590 SDH1YKL148C 1923 nt11.97□□□□□ -0.49
SED5Q01590 TRM9YML014W 840 nt11.96□□□□□ -0.49
SED5Q01590 FUN26YAL022C 1554 nt11.94□□□□□ -0.5
SED5Q01590 CAC2YML102W 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
SED5Q01590 PTP1YDL230W 1008 nt11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms