RNA–Protein interactions for RNA: YER190W

YRF1-2, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-2, Length 5,046 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2YER190W ATG2P53855 1592 aa9.57□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W STU2P46675 888 aa9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W MRPL10P36520 322 aa9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W SPT8P38915 602 aa9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W YAP3P38749 330 aa9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W APC11Q12157 165 aa9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W OLA1P38219 394 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W LTE1P07866 1435 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W CCT5P40413 562 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W NDC80P40460 691 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W OMS1Q06668 471 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W RTT109Q07794 436 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W PSK2Q08217 1101 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W NUP133P36161 1157 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W SIP3P38717 1229 aa9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W PEX19Q07418 342 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W NUP145P49687 1317 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W MRP7P12687 371 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data9.53□□□□□ -0.88not detected
YRF1-2YER190W HGH1P48362 394 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W YGR130CP53278 816 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W DOS2P54858 310 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W UGA3P26370 528 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W MIF2P35201 549 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W MSH3P25336 1018 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W MLC1P53141 149 aa9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2YER190W TOP1P04786 769 aa9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W DEF1P35732 738 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W GCR2Q01722 534 aa9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W CSI1Q04368 295 aa9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YOL098CQ12496 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W SWI1P09547 1314 aa9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W ATG13Q06628 738 aa9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W CLB5P30283 435 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W MEC3Q02574 474 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W TIM50Q02776 476 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W THI22Q06490 572 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W PSK1P31374 1356 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W SNT2P53127 1403 aa9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YJL181WP46987 611 aa9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YNL050CP53952 270 aa9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W KCC4P25389 1037 aa9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W APT1P49435 187 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W OPY2Q06810 360 aa9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W IMP2'P32351 346 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W RAD9P14737 1309 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W HIM1Q06674 414 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YML133CQ03099 1374 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YLL067CQ07888 1374 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W YLL066CQ99208 1374 aa9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W PRX1P34227 261 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W NFU1P32860 256 aa9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W RAD26P40352 1085 aa9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W BDH2P39713 417 aa9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W TYS1P36421 394 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W MRC1P25588 1096 aa9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W MDM38Q08179 573 aa9.46□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
YRF1-2YER190W RGP1P16664 663 aa9.46□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W YKT6P36015 200 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W MCM2P29469 868 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W BUD3P25558 1636 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SEG2P34250 1132 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W CEP3P40969 608 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SRB4P32569 687 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W CTF4Q01454 927 aa9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W HXK1P04806 485 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W BRN1P38170 754 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W DSD1P53095 428 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SRT1Q03175 343 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W CSC1Q06538 782 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W OSH2Q12451 1283 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SIR4P11978 1358 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SVF1Q05515 481 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W TLG2Q08144 397 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W HCA4P20448 770 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W NUP170P38181 1502 aa9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W BYE1P36106 594 aa9.43□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W HSP82P02829 709 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YRF1-2YER190W SPO22P40511 975 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.2 ms