RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	RAX1	Q08760	435 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	VPS68	Q12016	184 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PSY3	Q12318	242 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SFG1	Q12507	346 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BPH1	P25356	2167 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FOB1	O13329	566 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	INH1	P01097	85 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MET2	P08465	486 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RPO26	P20435	155 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RRT12	P25381	491 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YIH1	P25637	258 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SKN1	P33336	771 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	OPY1	P38271	328 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ICS2	P38284	255 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NPR3	P38742	1146 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ECM14	P38836	430 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FHL1	P39521	936 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SPC72	P39723	622 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YEL057C	P39983	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SPO73	P40031	143 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BUR6	P40096	142 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PUG1	P40100	303 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SSU1	P41930	458 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RRT5	P43607	289 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SIP4	P46954	829 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HOC1	P47124	396 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IBA57	P47158	497 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	COS5	P47187	383 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	DIA3	P52290	468 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GPI1	P53306	609 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RET3	P53600	189 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MTQ1	P53944	314 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PIR1	Q03178	341 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RNH1	Q04740	348 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PHO92	Q06390	306 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CUR1	Q06469	252 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YOR376W	Q08900	122 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PER33	Q12144	273 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YLR046C	Q12253	270 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.92	□□□□□ -2.26	RIP-Chip
PAM16	YJL104W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SPS100	P13130	326 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	EPT1	P22140	391 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	DBF2	P22204	572 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CLB1	P24868	471 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ELO2	P25358	347 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SPS22	P25380	463 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RPB9	P27999	122 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MSP1	P28737	362 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SFC1	P33303	322 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SKT5	P34226	696 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HSM3	P38348	480 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CYC2	P38909	366 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FAD1	P38913	306 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	DSE1	P40077	573 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	JEM1	P40358	645 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RIC1	P40395	1056 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YIL086C	P40503	102 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GCD10	P41814	478 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IME4	P41833	600 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IRC6	P43615	237 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GLG2	P47011	380 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BRO1	P48582	844 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	JJJ1	P53863	590 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IPI3	P53877	555 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TIM8	P57744	87 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SED5	Q01590	340 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YDR209C	Q03480	137 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ARO80	Q04052	950 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TAF9	Q05027	157 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	DON1	Q05610	365 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FUS2	Q05670	677 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	VTA1	Q06263	330 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MSA1	Q08471	629 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YDR056C	Q12025	205 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MDM32	Q12171	622 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	0.92	□□□□□ -2.26	not detected
PAM16	YJL104W	PEX11	Q12462	236 aa		0.92	□□□□□ -2.26

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