Protein–RNA interactions for Protein: Q03178

PIR1, Cell wall mannoprotein PIR1, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR1Q03178 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.78■□□□□ 0.92
PIR1Q03178 NSR1YGR159C 1245 nt20.47■□□□□ 0.87
PIR1Q03178 NOP1YDL014W 984 nt20.21■□□□□ 0.83
PIR1Q03178 YKL036CYKL036C 393 nt18.83■□□□□ 0.6
PIR1Q03178 MDJ1YFL016C 1536 nt18.09■□□□□ 0.49
PIR1Q03178 Q0297Q0297 156 nt17.77■□□□□ 0.44
PIR1Q03178 SRX1YKL086W 384 nt17.69■□□□□ 0.42
PIR1Q03178 YJL027CYJL027C 417 nt17.61■□□□□ 0.41
PIR1Q03178 SCS3YGL126W 1143 nt17.24■□□□□ 0.35
PIR1Q03178 YCR051WYCR051W 669 nt16.8■□□□□ 0.28
PIR1Q03178 YOL085CYOL085C 342 nt16.32■□□□□ 0.2
PIR1Q03178 PKP1YIL042C 1185 nt16.07■□□□□ 0.16
PIR1Q03178 DBP2YNL112W 1641 nt16.07■□□□□ 0.16
PIR1Q03178 RPP1BYDL130W 321 nt15.94■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
PIR1Q03178 CCC1YLR220W 969 nt15.76■□□□□ 0.11
PIR1Q03178 ATS1YAL020C 1002 nt15.45■□□□□ 0.06
PIR1Q03178 SCJ1YMR214W 1134 nt15.42■□□□□ 0.06
PIR1Q03178 YBR190WYBR190W 312 nt15.33■□□□□ 0.04
PIR1Q03178 PET122YER153C 765 nt15.25■□□□□ 0.03
PIR1Q03178 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.11■□□□□ 0.01
PIR1Q03178 RVS167YDR388W 1449 nt15.09■□□□□ 0.01
PIR1Q03178 SCR1SCR1 522 nt15.07■□□□□ 0
PIR1Q03178 RTC3YHR087W 336 nt15□□□□□ -0.01
PIR1Q03178 RRN5YLR141W 1092 nt14.81□□□□□ -0.04
PIR1Q03178 SHR5YOL110W 714 nt14.62□□□□□ -0.07
PIR1Q03178 YDJ1YNL064C 1230 nt14.6□□□□□ -0.07
PIR1Q03178 RSB1YOR049C 1065 nt14.55□□□□□ -0.08
PIR1Q03178 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.52□□□□□ -0.09
PIR1Q03178 PST2YDR032C 597 nt14.28□□□□□ -0.12
PIR1Q03178 GAR1YHR089C 618 nt14.27□□□□□ -0.13
PIR1Q03178 DEP1YAL013W 1218 nt14.19□□□□□ -0.14
PIR1Q03178 URN1YPR152C 1398 nt14.13□□□□□ -0.15
PIR1Q03178 YNL208WYNL208W 600 nt13.94□□□□□ -0.18
PIR1Q03178 RPN10YHR200W 807 nt13.91□□□□□ -0.18
PIR1Q03178 OPI9YLR338W 858 nt13.89□□□□□ -0.19
PIR1Q03178 PUT4YOR348C 1884 nt13.82□□□□□ -0.2
PIR1Q03178 YKL097CYKL097C 411 nt13.8□□□□□ -0.2
PIR1Q03178 TIR1YER011W 765 nt13.78□□□□□ -0.2
PIR1Q03178 SAH1YER043C 1350 nt13.77□□□□□ -0.21
PIR1Q03178 SHU1YHL006C 453 nt13.69□□□□□ -0.22
PIR1Q03178 ARE1YCR048W 1833 nt13.64□□□□□ -0.23
PIR1Q03178 SSA1YAL005C 1929 nt13.6□□□□□ -0.23
PIR1Q03178 YJR018WYJR018W 363 nt13.48□□□□□ -0.25
PIR1Q03178 PUN1YLR414C 792 nt13.47□□□□□ -0.25
PIR1Q03178 SRB2YHR041C 633 nt13.46□□□□□ -0.25
PIR1Q03178 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.46□□□□□ -0.25
PIR1Q03178 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.43□□□□□ -0.26
PIR1Q03178 POA1YBR022W 534 nt13.41□□□□□ -0.26
PIR1Q03178 YJR120WYJR120W 351 nt13.36□□□□□ -0.27
PIR1Q03178 PTC2YER089C 1395 nt13.29□□□□□ -0.28
PIR1Q03178 YOR139CYOR139C 393 nt13.25□□□□□ -0.29
PIR1Q03178 RPP2BYDR382W 333 nt13.22□□□□□ -0.29
PIR1Q03178 WWM1YFL010C 636 nt13.22□□□□□ -0.29
PIR1Q03178 BUD23YCR047C 828 nt13.16□□□□□ -0.3
PIR1Q03178 HOM6YJR139C 1080 nt13.15□□□□□ -0.3
PIR1Q03178 MNP1YGL068W 585 nt13.14□□□□□ -0.31
PIR1Q03178 YGR021WYGR021W 873 nt13.14□□□□□ -0.31
PIR1Q03178 BSC6YOL137W 1494 nt13.1□□□□□ -0.31
PIR1Q03178 NAB2YGL122C 1578 nt13.07□□□□□ -0.32
PIR1Q03178 NPL3YDR432W 1245 nt13.06□□□□□ -0.32
PIR1Q03178 SSA3YBL075C 1950 nt13.03□□□□□ -0.32
PIR1Q03178 BDH2YAL061W 1254 nt13.01□□□□□ -0.33
PIR1Q03178 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.97□□□□□ -0.33
PIR1Q03178 FIS1YIL065C 468 nt12.96□□□□□ -0.33
PIR1Q03178 INM2YDR287W 879 nt12.95□□□□□ -0.34
PIR1Q03178 RKM5YLR137W 1104 nt12.95□□□□□ -0.34
PIR1Q03178 DAL1YIR027C 1383 nt12.94□□□□□ -0.34
PIR1Q03178 FPR4YLR449W 1179 nt12.93□□□□□ -0.34
PIR1Q03178 YOL037CYOL037C 354 nt12.93□□□□□ -0.34
PIR1Q03178 YBL100CYBL100C 315 nt12.88□□□□□ -0.35
PIR1Q03178 LSM3YLR438C-A 270 nt12.85□□□□□ -0.35
PIR1Q03178 PHO4YFR034C 939 nt12.84□□□□□ -0.35
PIR1Q03178 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
PIR1Q03178 TRM9YML014W 840 nt12.72□□□□□ -0.37
PIR1Q03178 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.7□□□□□ -0.38
PIR1Q03178 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.7□□□□□ -0.38
PIR1Q03178 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.7□□□□□ -0.38
PIR1Q03178 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.7□□□□□ -0.38
PIR1Q03178 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.7□□□□□ -0.38
PIR1Q03178 YLR281CYLR281C 468 nt12.62□□□□□ -0.39
PIR1Q03178 CCT6YDR188W 1641 nt12.59□□□□□ -0.39
PIR1Q03178 WHI5YOR083W 888 nt12.57□□□□□ -0.4
PIR1Q03178 PUS2YGL063W 1113 nt12.56□□□□□ -0.4
PIR1Q03178 YPS1YLR120C 1710 nt12.52□□□□□ -0.41
PIR1Q03178 ALF1YNL148C 765 nt12.5□□□□□ -0.41
PIR1Q03178 YDR095CYDR095C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
PIR1Q03178 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.45□□□□□ -0.42
PIR1Q03178 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.45□□□□□ -0.42
PIR1Q03178 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.42□□□□□ -0.42
PIR1Q03178 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.37□□□□□ -0.43
PIR1Q03178 YPR011CYPR011C 981 nt12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms