Protein–RNA interactions for Protein: P53316

YGR250C, Uncharacterized RNA-binding protein YGR250C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR250CP53316 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.63■□□□□ 0.73
YGR250CP53316 NSR1YGR159C 1245 nt19.42■□□□□ 0.7
YGR250CP53316 NOP1YDL014W 984 nt19.21■□□□□ 0.67
YGR250CP53316 YKL036CYKL036C 393 nt17.72■□□□□ 0.43
YGR250CP53316 MDJ1YFL016C 1536 nt17.08■□□□□ 0.32
YGR250CP53316 Q0297Q0297 156 nt16.71■□□□□ 0.27
YGR250CP53316 SRX1YKL086W 384 nt16.67■□□□□ 0.26
YGR250CP53316 YJL027CYJL027C 417 nt16.58■□□□□ 0.24
YGR250CP53316 SCS3YGL126W 1143 nt16.08■□□□□ 0.16
YGR250CP53316 YCR051WYCR051W 669 nt15.89■□□□□ 0.13
YGR250CP53316 YOL085CYOL085C 342 nt15.26■□□□□ 0.03
YGR250CP53316 DBP2YNL112W 1641 nt15.04■□□□□ -0
YGR250CP53316 PKP1YIL042C 1185 nt15.03■□□□□ -0
YGR250CP53316 RPP1BYDL130W 321 nt15.02■□□□□ -0
YGR250CP53316 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YGR250CP53316 CCC1YLR220W 969 nt14.91□□□□□ -0.02
YGR250CP53316 YBR190WYBR190W 312 nt14.62□□□□□ -0.07
YGR250CP53316 RVS167YDR388W 1449 nt14.46□□□□□ -0.09
YGR250CP53316 SCJ1YMR214W 1134 nt14.42□□□□□ -0.1
YGR250CP53316 ATS1YAL020C 1002 nt14.41□□□□□ -0.1
YGR250CP53316 RTC3YHR087W 336 nt14.38□□□□□ -0.11
YGR250CP53316 SCR1SCR1 522 nt14.33□□□□□ -0.12
YGR250CP53316 PET122YER153C 765 nt14.29□□□□□ -0.12
YGR250CP53316 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.22□□□□□ -0.13
YGR250CP53316 RRN5YLR141W 1092 nt13.89□□□□□ -0.19
YGR250CP53316 SHR5YOL110W 714 nt13.87□□□□□ -0.19
YGR250CP53316 YDJ1YNL064C 1230 nt13.78□□□□□ -0.2
YGR250CP53316 RSB1YOR049C 1065 nt13.72□□□□□ -0.21
YGR250CP53316 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.6□□□□□ -0.23
YGR250CP53316 GAR1YHR089C 618 nt13.47□□□□□ -0.25
YGR250CP53316 DEP1YAL013W 1218 nt13.42□□□□□ -0.26
YGR250CP53316 URN1YPR152C 1398 nt13.42□□□□□ -0.26
YGR250CP53316 RPN10YHR200W 807 nt13.38□□□□□ -0.27
YGR250CP53316 PST2YDR032C 597 nt13.29□□□□□ -0.28
YGR250CP53316 YNL208WYNL208W 600 nt13.27□□□□□ -0.29
YGR250CP53316 OPI9YLR338W 858 nt13.18□□□□□ -0.3
YGR250CP53316 PUT4YOR348C 1884 nt13.07□□□□□ -0.32
YGR250CP53316 SAH1YER043C 1350 nt13.05□□□□□ -0.32
YGR250CP53316 TIR1YER011W 765 nt13.01□□□□□ -0.33
YGR250CP53316 Q0182Q0182 405 nt12.93□□□□□ -0.34
YGR250CP53316 YKL097CYKL097C 411 nt12.93□□□□□ -0.34
YGR250CP53316 SSA3YBL075C 1950 nt12.88□□□□□ -0.35
YGR250CP53316 PUN1YLR414C 792 nt12.87□□□□□ -0.35
YGR250CP53316 ARE1YCR048W 1833 nt12.87□□□□□ -0.35
YGR250CP53316 YJR018WYJR018W 363 nt12.82□□□□□ -0.36
YGR250CP53316 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.8□□□□□ -0.36
YGR250CP53316 POA1YBR022W 534 nt12.75□□□□□ -0.37
YGR250CP53316 SSA1YAL005C 1929 nt12.73□□□□□ -0.37
YGR250CP53316 SHU1YHL006C 453 nt12.73□□□□□ -0.37
YGR250CP53316 RPP2BYDR382W 333 nt12.71□□□□□ -0.37
YGR250CP53316 PTC2YER089C 1395 nt12.64□□□□□ -0.39
YGR250CP53316 BUD23YCR047C 828 nt12.58□□□□□ -0.4
YGR250CP53316 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.52□□□□□ -0.41
YGR250CP53316 NAB2YGL122C 1578 nt12.49□□□□□ -0.41
YGR250CP53316 YGR021WYGR021W 873 nt12.49□□□□□ -0.41
YGR250CP53316 BSC6YOL137W 1494 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR250CP53316 YJR120WYJR120W 351 nt12.42□□□□□ -0.42
YGR250CP53316 INM2YDR287W 879 nt12.4□□□□□ -0.42
YGR250CP53316 WWM1YFL010C 636 nt12.4□□□□□ -0.42
YGR250CP53316 SRB2YHR041C 633 nt12.39□□□□□ -0.43
YGR250CP53316 FPR4YLR449W 1179 nt12.38□□□□□ -0.43
YGR250CP53316 MOT3YMR070W 1473 nt12.38□□□□□ -0.43
YGR250CP53316 BDH2YAL061W 1254 nt12.35□□□□□ -0.43
YGR250CP53316 DAL1YIR027C 1383 nt12.33□□□□□ -0.44
YGR250CP53316 NPL3YDR432W 1245 nt12.32□□□□□ -0.44
YGR250CP53316 HOM6YJR139C 1080 nt12.31□□□□□ -0.44
YGR250CP53316 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.27□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 YBL100CYBL100C 315 nt12.27□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 MNP1YGL068W 585 nt12.25□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 YOR139CYOR139C 393 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
YGR250CP53316 PHO4YFR034C 939 nt12.19□□□□□ -0.46
YGR250CP53316 YOL037CYOL037C 354 nt12.19□□□□□ -0.46
YGR250CP53316 RKM5YLR137W 1104 nt12.16□□□□□ -0.46
YGR250CP53316 TRM9YML014W 840 nt12.16□□□□□ -0.46
YGR250CP53316 FUN26YAL022C 1554 nt12.09□□□□□ -0.47
YGR250CP53316 ALF1YNL148C 765 nt12.02□□□□□ -0.49
YGR250CP53316 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YGR250CP53316 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YGR250CP53316 CCT6YDR188W 1641 nt11.95□□□□□ -0.5
YGR250CP53316 YPS1YLR120C 1710 nt11.89□□□□□ -0.51
YGR250CP53316 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.86□□□□□ -0.51
YGR250CP53316 YDR095CYDR095C 411 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 YLR281CYLR281C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 WHI5YOR083W 888 nt11.79□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 PUS2YGL063W 1113 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YGR250CP53316 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.3 ms