Protein–RNA interactions for Protein: Q12207

NCE102, Non-classical export protein 2, yeastyeast

RIP-Chip data

Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCE102Q12207 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.6■□□□□ 0.41
NCE102Q12207 NSR1YGR159C 1245 nt17.47■□□□□ 0.39
NCE102Q12207 NOP1YDL014W 984 nt17.23■□□□□ 0.35
NCE102Q12207 YKL036CYKL036C 393 nt16.19■□□□□ 0.18
NCE102Q12207 MDJ1YFL016C 1536 nt15.63■□□□□ 0.09
NCE102Q12207 Q0297Q0297 156 nt15.18■□□□□ 0.02
NCE102Q12207 YJL027CYJL027C 417 nt15.17■□□□□ 0.02
NCE102Q12207 SRX1YKL086W 384 nt15.05■□□□□ -0
NCE102Q12207 SCS3YGL126W 1143 nt14.9□□□□□ -0.02
NCE102Q12207 YCR051WYCR051W 669 nt14.3□□□□□ -0.12
NCE102Q12207 YOL085CYOL085C 342 nt14□□□□□ -0.17
NCE102Q12207 DBP2YNL112W 1641 nt13.85□□□□□ -0.19
NCE102Q12207 PKP1YIL042C 1185 nt13.74□□□□□ -0.21
NCE102Q12207 RPP1BYDL130W 321 nt13.63□□□□□ -0.23
NCE102Q12207 SCJ1YMR214W 1134 nt13.6□□□□□ -0.23
NCE102Q12207 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.51□□□□□ -0.25
NCE102Q12207 ATS1YAL020C 1002 nt13.4□□□□□ -0.26
NCE102Q12207 YBR190WYBR190W 312 nt13.32□□□□□ -0.28
NCE102Q12207 CCC1YLR220W 969 nt13.31□□□□□ -0.28
NCE102Q12207 PET122YER153C 765 nt12.98□□□□□ -0.33
NCE102Q12207 RTC3YHR087W 336 nt12.97□□□□□ -0.33
NCE102Q12207 SCR1SCR1 522 nt12.94□□□□□ -0.34
NCE102Q12207 RVS167YDR388W 1449 nt12.87□□□□□ -0.35
NCE102Q12207 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.8□□□□□ -0.36
NCE102Q12207 RRN5YLR141W 1092 nt12.62□□□□□ -0.39
NCE102Q12207 RSB1YOR049C 1065 nt12.47□□□□□ -0.41
NCE102Q12207 SHR5YOL110W 714 nt12.46□□□□□ -0.41
NCE102Q12207 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.38□□□□□ -0.43
NCE102Q12207 YDJ1YNL064C 1230 nt12.38□□□□□ -0.43
NCE102Q12207 PST2YDR032C 597 nt12.34□□□□□ -0.43
NCE102Q12207 PUT4YOR348C 1884 nt12.21□□□□□ -0.45
NCE102Q12207 URN1YPR152C 1398 nt12.15□□□□□ -0.46
NCE102Q12207 DEP1YAL013W 1218 nt12.12□□□□□ -0.47
NCE102Q12207 GAR1YHR089C 618 nt12.05□□□□□ -0.48
NCE102Q12207 YKL097CYKL097C 411 nt12.05□□□□□ -0.48
NCE102Q12207 OPI9YLR338W 858 nt12.01□□□□□ -0.49
NCE102Q12207 ARE1YCR048W 1833 nt11.97□□□□□ -0.49
NCE102Q12207 SAH1YER043C 1350 nt11.95□□□□□ -0.5
NCE102Q12207 YNL208WYNL208W 600 nt11.92□□□□□ -0.5
NCE102Q12207 RPN10YHR200W 807 nt11.9□□□□□ -0.5
NCE102Q12207 SHU1YHL006C 453 nt11.78□□□□□ -0.52
NCE102Q12207 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.78□□□□□ -0.52
NCE102Q12207 POA1YBR022W 534 nt11.78□□□□□ -0.52
NCE102Q12207 TIR1YER011W 765 nt11.65□□□□□ -0.54
NCE102Q12207 PUN1YLR414C 792 nt11.63□□□□□ -0.55
NCE102Q12207 YJR018WYJR018W 363 nt11.58□□□□□ -0.56
NCE102Q12207 SSA3YBL075C 1950 nt11.58□□□□□ -0.56
NCE102Q12207 BSC6YOL137W 1494 nt11.57□□□□□ -0.56
NCE102Q12207 SSA1YAL005C 1929 nt11.56□□□□□ -0.56
NCE102Q12207 PTC2YER089C 1395 nt11.52□□□□□ -0.57
NCE102Q12207 YJR120WYJR120W 351 nt11.51□□□□□ -0.57
NCE102Q12207 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.49□□□□□ -0.57
NCE102Q12207 YOR139CYOR139C 393 nt11.49□□□□□ -0.57
NCE102Q12207 BUD23YCR047C 828 nt11.45□□□□□ -0.58
NCE102Q12207 SRB2YHR041C 633 nt11.43□□□□□ -0.58
NCE102Q12207 NAB2YGL122C 1578 nt11.37□□□□□ -0.59
NCE102Q12207 Q0182Q0182 405 nt11.36□□□□□ -0.59
NCE102Q12207 NPL3YDR432W 1245 nt11.35□□□□□ -0.59
NCE102Q12207 FIS1YIL065C 468 nt11.28□□□□□ -0.6
NCE102Q12207 RPP2BYDR382W 333 nt11.27□□□□□ -0.61
NCE102Q12207 YGR021WYGR021W 873 nt11.24□□□□□ -0.61
NCE102Q12207 DAL1YIR027C 1383 nt11.22□□□□□ -0.61
NCE102Q12207 MNP1YGL068W 585 nt11.19□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 HOM6YJR139C 1080 nt11.19□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 SPT5YML010W 3192 nt11.18□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 WWM1YFL010C 636 nt11.17□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 INM2YDR287W 879 nt11.16□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 YOL037CYOL037C 354 nt11.15□□□□□ -0.62
NCE102Q12207 PHO4YFR034C 939 nt11.13□□□□□ -0.63
NCE102Q12207 FPR4YLR449W 1179 nt11.13□□□□□ -0.63
NCE102Q12207 BDH2YAL061W 1254 nt11.09□□□□□ -0.63
NCE102Q12207 YBL100CYBL100C 315 nt11.06□□□□□ -0.64
NCE102Q12207 RKM5YLR137W 1104 nt11.03□□□□□ -0.64
NCE102Q12207 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.01□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 MOT3YMR070W 1473 nt10.96□□□□□ -0.65
NCE102Q12207 YPS1YLR120C 1710 nt10.95□□□□□ -0.66
NCE102Q12207 FUN26YAL022C 1554 nt10.94□□□□□ -0.66
NCE102Q12207 LSM3YLR438C-A 270 nt10.93□□□□□ -0.66
NCE102Q12207 YDR095CYDR095C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
NCE102Q12207 MEP2YNL142W 1500 nt10.86□□□□□ -0.67
NCE102Q12207 TRM9YML014W 840 nt10.86□□□□□ -0.67
NCE102Q12207 PUS2YGL063W 1113 nt10.83□□□□□ -0.68
NCE102Q12207 YLR281CYLR281C 468 nt10.83□□□□□ -0.68
NCE102Q12207 CCT6YDR188W 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
NCE102Q12207 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.78□□□□□ -0.68
NCE102Q12207 WHI5YOR083W 888 nt10.75□□□□□ -0.69
NCE102Q12207 ALF1YNL148C 765 nt10.73□□□□□ -0.69
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