RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	YMR027W	Q04371	470 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BCH1	Q05029	724 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SRL2	Q12020	392 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YRM1	Q12340	786 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BRF1	P29056	596 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SFH5	P47008	294 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SPC19	Q03954	165 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	DCS1	Q06151	350 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	IRC25	Q07951	179 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BSC6	Q08280	497 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	HOM3	P10869	527 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ADK2	P26364	225 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	TFB1	P32776	642 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MRPL10	P36520	322 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	OCA2	P53949	197 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ACL4	Q03771	387 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BUG1	Q12191	341 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ATG34	Q12292	412 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	NAM2	P11325	894 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YBR056W	P38081	501 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	NUP116	Q02630	1113 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MED2	Q12124	431 aa		2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	IMA3	P0CW40	589 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	IMA4	P0CW41	589 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	PDX1	P16451	410 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RPC53	P25441	422 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	CSE2	P33308	149 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	CHK1	P38147	527 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SLM4	P38247	162 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YHR131C	P38835	850 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MDE1	P47095	244 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	BRO1	P48582	844 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	HOT1	Q03213	719 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YDR131C	Q03899	556 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	URH1	Q04179	340 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MMR1	Q06324	491 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	IMA2	Q08295	589 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.48	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	PCL1	P24867	279 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	CLB1	P24868	471 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	ERV1	P27882	189 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YIL029C	P40538	142 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MTQ1	P53944	314 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	HAL1	Q01766	294 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RMT2	Q03305	412 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	NDE2	Q07500	545 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	RAX1	Q08760	435 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	VPS54	Q12071	889 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	IZH2	Q12442	317 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	MTR10	Q99189	972 aa		2.47	□□□□□ -2.01
CSE4	YKL049C	YCL068C	P25593	260 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	UTH1	P36135	365 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	SBE22	P38814	852 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	TOM22	P49334	152 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	ADA2	Q02336	434 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	COX3	P00420	269 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	NUP2	P32499	720 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	COX14	P39103	70 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	VHS2	P40463	436 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	GAB1	P41733	394 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	ZIM17	P42844	174 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	STD1	Q02794	444 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	MMT1	Q03218	510 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	CCE1	Q03702	353 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	TSA2	Q04120	196 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	PLP2	Q12017	286 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	AHC1	Q12433	566 aa		2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	CPR2	P23285	205 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	DBF4	P32325	704 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	HEL1	P36113	551 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	SER3	P40054	469 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	GAT2	P40209	560 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	SIM1	P40472	476 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	YPS6	P40583	537 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	TCB2	P48231	1178 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CSE4	YKL049C	MRM2	P53123	320 aa		2.44	□□□□□ -2.02

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