RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A ROY1Q04847 553 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A BCH1Q05029 724 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A DCS1Q06151 350 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A BUG1Q12191 341 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A ATG34Q12292 412 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A ISN1Q99312 450 aa2.11□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A HOM3P10869 527 aa2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A RAD57P25301 460 aa2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A NIP1P32497 812 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A JLP2P40206 208 aa2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A OAZ1Q02803 292 aa2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A AFI1Q99222 893 aa2.1□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A RRP1P35178 278 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A RRP4P38792 359 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A CAK1P43568 368 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A MDE1P47095 244 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A PHB2P50085 310 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A MTQ1P53944 314 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A HOT1Q03213 719 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A ACL4Q03771 387 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A URH1Q04179 340 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A NDE2Q07500 545 aa2.09□□□□□ -2.07
RPC10YHR143W-A TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A NAM2P11325 894 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PDX1P16451 410 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A URA7P28274 579 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A TFB1P32776 642 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YBR056WP38081 501 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A SLM4P38247 162 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A COX14P39103 70 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A TOM22P49334 152 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RPT4P53549 437 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RRP9Q06506 573 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RAX1Q08760 435 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RUP1Q12242 671 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YRM1Q12340 786 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CEX1Q12453 761 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MTR10Q99189 972 aa2.08□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RPC53P25441 422 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YCL068CP25593 260 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ADK2P26364 225 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MRPL10P36520 322 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ATP3P38077 311 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CHK1P38147 527 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YIL029CP40538 142 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A GAB1P41733 394 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A BRO1P48582 844 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A OCA2P53949 197 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YDR131CQ03899 556 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MMR1Q06324 491 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PLP2Q12017 286 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A JID1Q12350 301 aa2.07□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A IMA3P0CW40 589 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A IMA4P0CW41 589 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CLB1P24868 471 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A NUP2P32499 720 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CSE2P33308 149 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A OLA1P38219 394 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A SBE22P38814 852 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YPS6P40583 537 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A HAL1Q01766 294 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A NUP116Q02630 1113 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A STD1Q02794 444 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MMT1Q03218 510 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RMT2Q03305 412 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A TSA2Q04120 196 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A IMA2Q08295 589 aa2.06□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MSI1P13712 422 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.05□□□□□ -2.08not detected
RPC10YHR143W-A RPB5P20434 215 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CPR2P23285 205 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PCL1P24867 279 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PRR1P28708 518 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A GAT2P40209 560 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A VHS2P40463 436 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ALF1P53904 254 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MDM36Q06820 579 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A IZH2Q12442 317 aa2.05□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A COX3P00420 269 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ERV1P27882 189 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PHA2P32452 334 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A UTH1P36135 365 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YHR131CP38835 850 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A SIM1P40472 476 aa2.04□□□□□ -2.08
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