RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ECM27P47144 725 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CAF40P53829 373 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C AIM32Q04689 311 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PBA1Q05778 276 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MDM30Q05930 598 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MRPL35Q06678 367 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YPL199CQ08954 240 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HRT3Q12347 344 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SAM1P10659 382 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SAM2P19358 384 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C URA4P20051 364 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C GEX1P25596 615 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SWD3P38123 315 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MMS4P38257 691 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TIS11P47977 285 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ACL4Q03771 387 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YMR130WQ04223 302 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MUM3Q08750 479 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YPR022CQ12139 1133 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ERP4Q12450 207 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SMC6Q12749 1114 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CCH1P50077 2039 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HHF1P02309 103 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CPR2P23285 205 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C BRF1P29056 596 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SOR1P35497 357 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NAT2P37293 288 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C APE3P37302 537 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SLM4P38247 162 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SRP72P38688 640 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HMS2P47175 358 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TCB2P48231 1178 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MRP51Q02950 344 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DCS1Q06151 350 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MMR1Q06324 491 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SOR2Q07786 357 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ESA1Q08649 445 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C THP3Q12049 470 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C VPS54Q12071 889 aa1.67□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NAT1P12945 854 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CLN3P13365 580 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CLN1P20437 546 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ITR1P30605 584 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PXA2P34230 853 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NDT80P38830 627 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data1.66□□□□□ -2.14not detected
HDA3YPR179C MST28P39552 234 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C OST1P41543 476 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YFL067WP43537 175 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C LAM5P43560 674 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SSN8P47821 323 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RPT4P53549 437 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C FRE4P53746 719 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C GOR1P53839 350 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HOT1Q03213 719 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C REX4Q08237 289 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TIM18Q08749 192 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RBD2Q12270 262 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ORT1Q12375 292 aa1.66□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ADH2P00331 348 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SCEIP03882 235 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ILV5P06168 395 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HOM3P10869 527 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data1.65□□□□□ -2.14not detected
HDA3YPR179C LSB5P25369 354 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SMY1P32364 656 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RIB5P38145 238 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MIX23P38162 196 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SER3P40054 469 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YML6P51998 286 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C OCA2P53949 197 aa1.65□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TEF1P02994 458 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CPR4P25334 318 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C CTR86P25355 563 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SDH3P33421 198 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RRN10P38204 145 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RRP4P38792 359 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PHO86P46956 311 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C PHB2P50085 310 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RSC1P53236 928 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C YNR048WP53740 393 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C IBD2P53892 351 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C GIP3Q03016 1276 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C BET5Q03630 159 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C TSA2Q04120 196 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C SGT1Q08446 395 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C MED2Q12124 431 aa1.65□□□□□ -2.15
HDA3YPR179C RAD61Q99359 647 aa1.65□□□□□ -2.15
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