RNA–Protein interactions for RNA: YPR184W

GDB1, Transcript of Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Gene GDB1, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1YPR184W AIM17P23180 465 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RPT1P33299 467 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PEX6P33760 1030 aa4.9□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W DED81P38707 554 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W TAF3Q12297 353 aa4.9□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W CHS1P08004 1131 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W IMA3P0CW40 589 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W IMA4P0CW41 589 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W IME1P21190 360 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YCR099CP25657 155 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W DUG2P38149 878 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W VBA2P38358 474 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RFC3P38629 340 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W LSM12P38828 187 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YGR201CP42936 225 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W IBA57P47158 497 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W IMA2Q08295 589 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SCM3Q12334 223 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PCL9Q12477 304 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ARP2P32381 391 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RPT5P33297 434 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PAN6P40459 309 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W NAS2P40555 220 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SSY5P47002 699 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W LYS5P50113 272 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ART5P53244 586 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RMI1Q02685 241 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MRX10Q05648 414 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YIG1Q08956 461 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W UBX3Q12229 455 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GLN4P13188 809 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SRP54P20424 541 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YHR033WP38690 423 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MNL1P38888 796 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YHR219WP38900 624 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PLB1P39105 664 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W EMP65P40085 556 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W TDA10P42938 290 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W STB2P46679 850 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SLI1P53304 468 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W TUB4P53378 473 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W HOL1P53389 586 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MEH1Q02205 184 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GAS3Q03655 524 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W NNT1Q05874 261 aa4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SNC1P31109 117 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MAE1P36013 669 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GMH1P36125 273 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SOK1P40317 901 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GCD10P41814 478 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MON1P53129 644 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ARG5,6Q01217 863 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W HER2Q03557 464 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W COX17Q12287 69 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YDL199CQ12407 687 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RIF1P29539 1916 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GCN3P14741 305 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YKR015CP36111 568 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MRPL15P36523 253 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W AGP2P38090 596 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PRS3P38689 320 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MNN9P39107 395 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GDI1P39958 451 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PFA3P42836 336 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SNX4P47057 423 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W COS12P53053 380 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W MRH4P53166 561 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W RIM13Q03792 727 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W AIM32Q04689 311 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YFT2Q06676 274 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YPR091CQ06833 770 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W LEU4P06208 619 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data4.88□□□□□ -1.63not detected
GDB1YPR184W APN1P22936 367 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PRP19P32523 503 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W TFB1P32776 642 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ORC2P32833 620 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PEP12P32854 288 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W LDB7P38210 180 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YER184CP39961 794 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W GGA1Q06336 557 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W YPR172WQ06608 200 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W CDA1Q06702 301 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SKM1Q12469 655 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W KIN3P22209 435 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W DSS4P32601 143 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W ARC19P33204 171 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W SDH3P33421 198 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W OSH7P38755 437 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W PRP39P39682 629 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W DDI1P40087 428 aa4.88□□□□□ -1.63
GDB1YPR184W OAZ1Q02803 292 aa4.88□□□□□ -1.63
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