Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 NSR1YGR159C 1245 nt18.27■□□□□ 0.52
VBA2P38358 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.14■□□□□ 0.49
VBA2P38358 NOP1YDL014W 984 nt17.63■□□□□ 0.41
VBA2P38358 MDJ1YFL016C 1536 nt16.35■□□□□ 0.21
VBA2P38358 YKL036CYKL036C 393 nt16.02■□□□□ 0.16
VBA2P38358 SRX1YKL086W 384 nt15.36■□□□□ 0.05
VBA2P38358 Q0297Q0297 156 nt15.31■□□□□ 0.04
VBA2P38358 YJL027CYJL027C 417 nt15.14■□□□□ 0.01
VBA2P38358 YCR051WYCR051W 669 nt14.55□□□□□ -0.08
VBA2P38358 SCS3YGL126W 1143 nt14.41□□□□□ -0.1
VBA2P38358 DBP2YNL112W 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
VBA2P38358 YBR190WYBR190W 312 nt14.06□□□□□ -0.16
VBA2P38358 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
VBA2P38358 CCC1YLR220W 969 nt13.85□□□□□ -0.19
VBA2P38358 YOL085CYOL085C 342 nt13.85□□□□□ -0.19
VBA2P38358 RPP1BYDL130W 321 nt13.74□□□□□ -0.21
VBA2P38358 RTC3YHR087W 336 nt13.74□□□□□ -0.21
VBA2P38358 PKP1YIL042C 1185 nt13.64□□□□□ -0.23
VBA2P38358 RVS167YDR388W 1449 nt13.56□□□□□ -0.24
VBA2P38358 SCJ1YMR214W 1134 nt13.32□□□□□ -0.28
VBA2P38358 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.17□□□□□ -0.3
VBA2P38358 PET122YER153C 765 nt13.11□□□□□ -0.31
VBA2P38358 SHR5YOL110W 714 nt13□□□□□ -0.33
VBA2P38358 SCR1SCR1 522 nt12.99□□□□□ -0.33
VBA2P38358 PUT4YOR348C 1884 nt12.86□□□□□ -0.35
VBA2P38358 ATS1YAL020C 1002 nt12.85□□□□□ -0.35
VBA2P38358 YDJ1YNL064C 1230 nt12.77□□□□□ -0.37
VBA2P38358 URN1YPR152C 1398 nt12.75□□□□□ -0.37
VBA2P38358 RRN5YLR141W 1092 nt12.73□□□□□ -0.37
VBA2P38358 DEP1YAL013W 1218 nt12.67□□□□□ -0.38
VBA2P38358 OPI9YLR338W 858 nt12.62□□□□□ -0.39
VBA2P38358 RPN10YHR200W 807 nt12.59□□□□□ -0.39
VBA2P38358 SAH1YER043C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
VBA2P38358 ARE1YCR048W 1833 nt12.55□□□□□ -0.4
VBA2P38358 SSA3YBL075C 1950 nt12.55□□□□□ -0.4
VBA2P38358 YNL208WYNL208W 600 nt12.5□□□□□ -0.41
VBA2P38358 GAR1YHR089C 618 nt12.48□□□□□ -0.41
VBA2P38358 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.47□□□□□ -0.41
VBA2P38358 POA1YBR022W 534 nt12.47□□□□□ -0.41
VBA2P38358 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.43□□□□□ -0.42
VBA2P38358 RSB1YOR049C 1065 nt12.42□□□□□ -0.42
VBA2P38358 PUN1YLR414C 792 nt12.29□□□□□ -0.44
VBA2P38358 BSC6YOL137W 1494 nt12.23□□□□□ -0.45
VBA2P38358 YJR018WYJR018W 363 nt12.17□□□□□ -0.46
VBA2P38358 BUD23YCR047C 828 nt12.15□□□□□ -0.46
VBA2P38358 PTC2YER089C 1395 nt12.13□□□□□ -0.47
VBA2P38358 TIR1YER011W 765 nt12.08□□□□□ -0.48
VBA2P38358 NAB2YGL122C 1578 nt12.03□□□□□ -0.48
VBA2P38358 SSA1YAL005C 1929 nt11.94□□□□□ -0.5
VBA2P38358 PST2YDR032C 597 nt11.93□□□□□ -0.5
VBA2P38358 RPP2BYDR382W 333 nt11.91□□□□□ -0.5
VBA2P38358 YJR120WYJR120W 351 nt11.85□□□□□ -0.51
VBA2P38358 DAL1YIR027C 1383 nt11.81□□□□□ -0.52
VBA2P38358 INM2YDR287W 879 nt11.8□□□□□ -0.52
VBA2P38358 FPR4YLR449W 1179 nt11.79□□□□□ -0.52
VBA2P38358 FIS1YIL065C 468 nt11.77□□□□□ -0.53
VBA2P38358 SPT5YML010W 3192 nt11.73□□□□□ -0.53
VBA2P38358 PHO4YFR034C 939 nt11.69□□□□□ -0.54
VBA2P38358 SRB2YHR041C 633 nt11.63□□□□□ -0.55
VBA2P38358 YBL100CYBL100C 315 nt11.61□□□□□ -0.55
VBA2P38358 Q0182Q0182 405 nt11.6□□□□□ -0.55
VBA2P38358 BDH2YAL061W 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
VBA2P38358 YPS1YLR120C 1710 nt11.53□□□□□ -0.56
VBA2P38358 MEP2YNL142W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
VBA2P38358 WWM1YFL010C 636 nt11.49□□□□□ -0.57
VBA2P38358 SHU1YHL006C 453 nt11.47□□□□□ -0.57
VBA2P38358 FUN26YAL022C 1554 nt11.46□□□□□ -0.57
VBA2P38358 SSA4YER103W 1929 nt11.46□□□□□ -0.58
VBA2P38358 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.45□□□□□ -0.58
VBA2P38358 LSM3YLR438C-A 270 nt11.44□□□□□ -0.58
VBA2P38358 TRM9YML014W 840 nt11.44□□□□□ -0.58
VBA2P38358 YDR095CYDR095C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
VBA2P38358 YGR021WYGR021W 873 nt11.42□□□□□ -0.58
VBA2P38358 ALF1YNL148C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
VBA2P38358 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.36□□□□□ -0.59
VBA2P38358 YKL097CYKL097C 411 nt11.36□□□□□ -0.59
VBA2P38358 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.35□□□□□ -0.59
VBA2P38358 HOM6YJR139C 1080 nt11.32□□□□□ -0.6
VBA2P38358 CCT6YDR188W 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
VBA2P38358 DCW1YKL046C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
VBA2P38358 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.27□□□□□ -0.61
VBA2P38358 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.27□□□□□ -0.61
VBA2P38358 RPP2AYOL039W 321 nt11.24□□□□□ -0.61
VBA2P38358 YMR090WYMR090W 684 nt11.21□□□□□ -0.61
VBA2P38358 MNP1YGL068W 585 nt11.19□□□□□ -0.62
VBA2P38358 EMI2YDR516C 1503 nt11.19□□□□□ -0.62
VBA2P38358 MOT3YMR070W 1473 nt11.19□□□□□ -0.62
VBA2P38358 SIS1YNL007C 1059 nt11.18□□□□□ -0.62
VBA2P38358 PTP1YDL230W 1008 nt11.16□□□□□ -0.62
VBA2P38358 RKM5YLR137W 1104 nt11.16□□□□□ -0.62
VBA2P38358 YDL221WYDL221W 552 nt11.09□□□□□ -0.63
VBA2P38358 CAC2YML102W 1407 nt11.09□□□□□ -0.63
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