RNA–Protein interactions for RNA: YOL053W

AIM39, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene AIM39, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM39	YOL053W	MSP1	P28737	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RRN10	P38204	145 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	WSS1	P38838	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	VPS52	P39904	641 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	AZF1	P41696	914 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RBA50	Q04418	439 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	SOR2	Q07786	357 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	MLH2	Q07980	695 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	BUG1	Q12191	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	COX3	P00420	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	PDE2	P06776	526 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	TOA1	P32773	286 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	ASK1	P35734	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	PFF1	P38244	976 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YSW1	P38280	609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	PCA1	P38360	1216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YIR014W	P40570	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	TRS85	P46944	698 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	TOF1	P53840	1238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	IRC15	Q02733	499 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	GLN3	P18494	730 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	ECM25	P32525	599 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	MLH1	P38920	769 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YIL152W	P40455	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	PHO86	P46956	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	PCP1	P53259	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	MEH1	Q02205	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	VPS74	Q06385	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	DSE3	Q08729	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AIM39	YOL053W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	ALG1	P16661	449 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	DAP2	P18962	818 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	FRE2	P36033	711 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	RSM22	P36056	628 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	UIP5	P36137	443 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	MRPL4	P36517	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SIF2	P38262	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	EPL1	P43572	832 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	PIB2	P53191	635 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	PNG1	Q02890	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	NDL1	Q06568	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SMI1	P32566	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	TRS65	P32893	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	ELP2	P42935	788 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	TAF12	Q03761	539 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YCR100C	P25606	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SPC110	P32380	944 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	ATO2	P32907	282 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	STN1	P38960	494 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	POP2	P39008	433 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	GAT2	P40209	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YIP1	P53039	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	FMP42	Q04991	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YFH1	Q07540	174 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	SNA4	Q07549	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	REX4	Q08237	289 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	RUP1	Q12242	671 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	CTR86	P25355	563 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	YCR041W	P37265	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
AIM39	YOL053W	MET30	P39014	640 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIM39	YOL053W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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